以cDNA第一链为模板的PCR是以什么设计引物的

作者&投稿:笃戴 (若有异议请与网页底部的电邮联系)
反转录PCR中以第一链cDNA为模板合成第二链PCR时引物该怎么设,还有这个PCR的模板只有一条链为什么设~

引物是热稳定DNA聚合酶的结合位点,能够使子链合成时按照5’—〉3’的方向进行,不设置引物根本就没办法进行互补链的合成,因此尽管只有一条链也应该设置引物。一条模版合成了互补链后,在加热解链后,模板链和互补链均可再做下一次PCR合成的模版,按照指数增长方式快速的合成多个DNA。

RT-PCR中合成第一链cDNA为RNA和DNA组成的“杂双链”,在设计PCR的引物时候也是根据cDNA第一链设计的,因此将第一链cDNA可以用来PCR。
第二链cDNA是在第一链cDNA的基础上使用RNAase将RNA消化,利用百度百科上的几种方法合成与第一链cDNA互补的第二链cDNA,此刻就是构成了真正的,不包含RNA的“双链cDNA”,对双链cDNA修饰后用于构建cDNA文库。
当然合成第二链cDNA后也能用作PCR反应
所以合成第一链cDNA用来PCR可以,想要再合成第二链cDNA做PCR也可以。

一般以mRNA为模板设计引物扩增目的片段。

你是要扩展cDNA第二条链吗?
是要扩展全长吗?
如果不是,就和普通的PCR一样。
如果是,一般用同聚体加尾法。

mRNA

要知道模板序列


自身引导合成法和置换合成法合成cDNA第二链的优缺点是什么?
1. 自身引导合成法首先,通过变性降解去除杂交分子中的RNA,使得单链cDNA的3'端形成发夹结构作为引物。在大肠杆菌聚合酶I Klenow或反转录酶的作用下,这个引物引导第二链的合成。然而,这种方法存在一些缺点:S1核酸酶在切割发夹结构时,可能导致mRNA 5'端序列出现缺失和重排。此外,如果S1核酸酶纯度不足...

反转录PCR中以第一链cDNA为模板合成第二链PCR时引物该怎么设,还有这个...
引物是热稳定DNA聚合酶的结合位点,能够使子链合成时按照5’—〉3’的方向进行,不设置引物根本就没办法进行互补链的合成,因此尽管只有一条链也应该设置引物。一条模版合成了互补链后,在加热解链后,模板链和互补链均可再做下一次PCR合成的模版,按照指数增长方式快速的合成多个DNA。

RACE技术的技术原理
然后用一个基因特异引物GSP1(gene specific primer,GSP)作为上游引物,用一个含有部分接头序列的通用引物UPM(universal primer,UPM)作为下游引物,以cDNA第一链为模板,进行PCR循环,把目的基因3' 末端的DNA片段扩增出来。(见下图)SMARTTM 5'-RACE原理先利用mRNA的3'末端的poly(A)尾巴作为一个引...

以cDNA第一链为模板的PCR是以什么设计引物的
一般以mRNA为模板设计引物扩增目的片段。

反转录PCR引物如何设计?已经得到cDNA第一链,引物设计是以cdna为模版,设...
不,需要两条,因为随着你PCR的进行,另一条互补链会被引物扩增出来,因此你需要两条引物都加进去。

真核生物mRNA测序
2、mRNA捕获:真核生物的成熟mRNA带有poly-A尾,因此可以采用附着poly-T oligo的磁珠从总RNA中捕获mRNA。3、mRNA片段化:4、cDNA第一链合成:以mRNA为模板合成cDNA。5、cDNA第二链合成:以cDNA第一链为模板合成cDNA第二链。6、双链cDNA末端修复:3'加A,5'修复。7、加接头:8、PCR富集mRNA文库。...

RT-PCR的原理是什么?有何用途?
RT—PCR(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction)是将RNA的反转录(RT)和cDNA的聚合酶链式扩增(PCR)相结合的技术。原理是提取组织或细胞中的总RNA或者mRNA,在反转录酶的作用下将RNA或者mRNA反转录成cDNA,再以该cDNA第一链为模板进行PCR扩增,根据靶基因设计用于PCR扩增的基因特异的上下游...

组建cDNA文库的组建有哪些步骤?
(3)cDNA第二链的合成:通常有自身引导合成法和置换合成法两种方法合成。自身引导合成法。用碱处理mRNA-cDNA杂交体,水解mRNA模板,cDNA第一链3′端能够形成发夹结构,这种结构可用作合成cDNA第二链的引物。在大肠杆菌DNA聚合酶Klenow片段或反转录酶的作用下,以四种dNTP为原料完成双链cDNA的合成,利用...

如何获得cDNA?需要哪些步骤?
把 cDNA 克隆到载体中之前,必须把这种杂交体中的 RNA 转变成 DNA 链,即形成双链 DNA 分子。2.利用 cDNA 第一链的 3' 末端常常出现发夹环的特征,这种发夹结构是反转录酶在第一链末端“返折”并且进行复制第一链的结果,用这种方法合成的双链 cDNA 在一端有一个发夹环,可以用单链特异的 S1...

RT-PCR中合成第一链cDNA为什么可以进行PCR,难道不需要合成第二链吗
RT-PCR中合成第一链cDNA为RNA和DNA组成的“杂双链”,在设计PCR的引物时候也是根据cDNA第一链设计的,因此将第一链cDNA可以用来PCR。第二链cDNA是在第一链cDNA的基础上使用RNAase将RNA消化,利用百度百科上的几种方法合成与第一链cDNA互补的第二链cDNA,此刻就是构成了真正的,不包含RNA的“双链cDNA...

于洪区17667429620: 以cDNA第一链为模板的PCR是以什么设计引物的 -
甫科盐酸:[答案] 一般以mRNA为模板设计引物扩增目的片段.

于洪区17667429620: 以cDNA第一链为模板的PCR是以什么设计引物的 -
甫科盐酸: 一般以mRNA为模板设计引物扩增目的片段.

于洪区17667429620: 反转录PCR中以第一链cDNA为模板合成第二链PCR时引物该怎么设,还有这个PCR的模板只有一条链为什么设还有这个PCR的模板只有一条链为什么设上... -
甫科盐酸:[答案] 引物是热稳定DNA聚合酶的结合位点,能够使子链合成时按照5'—〉3'的方向进行,不设置引物根本就没办法进行互补链的合成,因此尽管只有一条链也应该设置引物.一条模版合成了互补链后,在加热解链后,模板链和互补链均可再做下一次...

于洪区17667429620: 何为原位PCR? -
甫科盐酸: 原位PCR是原位杂交细胞定位和PCR的高灵敏度相结合的技术,使得靶基因检测有了极大的改进.此技术是在细胞(爬片、甩片或涂片)或组织(石蜡、冰冻切片)上直接对靶基因片段进行扩增,通过掺入标记基团直接显色或结合原位杂交进行检测的方法.

于洪区17667429620: 反转录PCR引物如何设计?已经得到cDNA第一链,引物设计是以cdna为模版,设计上下游引物吗?cDNA不是只有一条链吗,是不是只需要一条引物?求详解. -
甫科盐酸:[答案] 不,需要两条,因为随着你PCR的进行,另一条互补链会被引物扩增出来,因此你需要两条引物都加进去.

于洪区17667429620: AS - PCR和ARMS - PCR的区别 -
甫科盐酸: PCR这里是指常规的PCR吧?就是以DNA为模板,dNTP为原料,在Taq DNA聚合酶的作用下,扩增DNA.RT-PCR即Reverse transcription-PCR,顾名思义就是讲mRNA通过反转录成第一链cDNA后,以第一链cDNA为模板进行PCR.

于洪区17667429620: 原核表达载体的原核表达载体调控原件 -
甫科盐酸: (1)通过PCR方法:以含目的基因的克隆质粒为模板,按基因序列设计一对引物(在上游和下游引物分别引入不同的酶切位点),PCR循环获得所需基因片段. (2)通过RT-PCR方法:提取总RNA,以mRNA为模板,逆转录形成cDNA第一链,以逆...

于洪区17667429620: 分不清反转录和反转录PCR,希望能人帮我解释一下 -
甫科盐酸: 个人理解..反转录是指从RNA到cDNA的这一步.RT-PCR是指从RNA反转合成cDNA第一链,然后以cDNA 为模板扩增目的片断,已达到检测目标基因是否表达等目的.....

于洪区17667429620: PCR和realtimePCR的引物一样?RT - PCR和real
甫科盐酸: ~完成定量PCR包含RT和real-time PCR两部分:①RT即逆转录反应,以RNA为模板,采用逆转录引物合成cDNA第一链;②Real-time PCR即实时定量PCR,以①中的...

于洪区17667429620: 何为ARMS - PCR -
甫科盐酸: 扩增阻滞突变系统PCR,也叫等位基因特异性PCR.基于引物3'末端碱基与模板结合的严谨性而发展起来的一种技术,最初主要是用于等位基因分型,目前已经有基于该技术的体细胞突变检测试剂盒问世

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