微生物DNA提取的原理和方法是什么?
原理就是去掉植物细胞壁 细胞膜 质体 线粒体 叶绿体 剩下细胞核了。就是DNA了。
通常采用机械研磨的方法破碎植物的组织和细胞,由于植物细胞匀浆含有多种酶类(尤其是氧化酶类)对DNA的抽提产生不利的影响,在抽提缓冲液中需加入抗氧化剂或强还原剂(如巯基乙醇)以降低这些酶类的活性。在液氮中研磨,材料易于破碎,并减少研磨过程中各种酶类的作用。
十二烷基肌酸钠(sarkosyl)、十六烷基三甲基溴化铵(hexadyltrimethyl ammomum bromide,简称为CTAB)、十二烷基硫酸钠(sodium dodecyl sulfate,简称SDS)等离子型表面活性剂,能溶解细胞膜和核膜蛋白,使核蛋白解聚,从而使DNA得以游离出来。再加入苯酚和氯仿等有机溶剂,能使蛋白质变性,并使抽提液分相,因核酸(DNA、RNA)水溶性很强,经离心后即可从抽提液中除去细胞碎片和大部分蛋白质。上清液中加入无水乙醇使DNA沉淀,沉淀DNA溶于TE溶液中,即得植物总DNA溶液
就是破碎 分离 提取 病毒的话就是提取 纯化然后再取样做DNA。
细菌染色体DNA的抽提一、 目的
熟练掌握抽提细菌DNA的一般方法
二、原理
要进行重组DNA 实验,就离不开外源基因的纯化,而外源基因主要来源之一就要直接从生物的染色体DNA上制备,所以制备高质量的染色体DNA样品经常为基因工程实验所需要,抽提细菌染色体DNA的方法目前已有许多种,这里所介绍的两种方法:一适用于枯杆菌染色体的抽提;另一种方法则适用于大肠杆菌染色体的制备。
基因工程实验所需要的基因组DNA 通常要求分子量尽可能大,以此增加外源基因获得率,但要获得大片段的DNA 非易事,细菌基因组DNA通常是个很大的环状态DNA,而在抽提过程中,不可避免的机械剪切力必将切断DNA,如果要抽提到大的DNA 分子,就要尽可能地温和操作,减少剪切力,减少切断DNA 分子的可能性;分子热运动也会减少所抽提到的DNA分子量,所以提取过程也要尽可能在低温下进行。另外细胞内及抽提器皿中污染的核酸酶也会降解制备过程中的DNA,所以制备过程要抑制其核酸酶的活性。
另外制备的细菌染色体DNA 必须是高纯度的,以满足基因工程中各种酶反应的需要,制备的样品必须没有蛋白污染,没有RNA,各种离子浓度应符合要求,这些在染色体制备时都应考虑到。
大肠杆菌染色体DNA 抽提首先收集对数生长期的细胞,然后用离子型表面活性剂十二烷基磺酸钠(SDS)破裂细胞,SDS 具有的主要功能是:(1)溶解细胞膜上的脂类和蛋白质,因而溶解膜蛋白而破坏细胞膜;(2)解聚细胞膜上的脂类和蛋白质,有助于消除染色体DNA上的蛋白质;(3)SDS 能与蛋白质结合成为R1—0—SO3R2—蛋白质的复合物,使蛋白质变性而沉淀下来。但是SDS 能抑制核糖核酸酶的作用,所以在以后的提取过程中,必须把它除干净。以免影响下一步RNase的作用。破细胞后RNA经RNase消化除去,蛋白质经苯酚、氯仿:异戊醇抽提除去经洒精沉淀回收DNA。枯草杆菌染色体制备与上类似,但略加修改的方法要适合教学要求。枯草杆菌是格兰氏阳性菌,所以在SDS 处理前需要使用溶菌酶裂解细胞壁。溶菌酶是一种糖苷水解酶,它能水解菌体细胞壁的主要化学成份肽聚糖中的β—1,4 糖苷键,有助于细胞壁破裂,破裂的细胞壁在SDS 的作用下溶菌,同时用蛋白酶K 消化蛋白质,能解离缠绕在染色体DNA上的蛋白质,然后加入一定量的醋酸钾,使蛋白质变性,通常离心除去,在这期间可加入核糖酸酶消化RNA,最后用乙醇回收DNA。
此二种方法抽提的细菌染色体DNA,无RNA和蛋白质污染,可用于限制性内切酶消化,分子再克隆等。但在下一步实验前,要测定其DNA的浓度,常用测定DNA 浓度的方法,是溴化乙锭电泳法;当DNA 样品在琼脂糖凝胶中电泳时,加入的EB 会增强发射的荧光。而荧光的强度正比于DNA 的含量,如将已知浓度的标准样品作电泳对照,就可估计出待样品的浓度。
三、材料
(一)菌株
大肠杆菌C600、枯草杆菌BR151。
(二)仪器
电泳设备、恒温水浴锅、低速离心机、恒温振荡器、紫外检测仪。
(三)器皿
玻璃离心管(10 毫升)、移液管(10毫升、5毫升)、微量取样器、烧杯、玻璃棒、试管、三角瓶
(四)试剂
(1)LB 完全肉汤培养液:1%蛋白胨 0.5%酵母粉 0.5%NaCl pH7.5。
(2)BY 培养液:1%蛋白胨 0.5%牛肉膏 0.5%酵母粉 0.5%葡萄糖 0.5%NaClpH7.5
(3)SET 溶液:20%蔗糖;50mmol/L Tris—HCl(pH7.6) 50mmol/L EDTA。
(4)20%SDS
(5)饱和酚
(6)氯仿:异戊醇(24:1 V:V)
(7)预冷无水酒精
(8)TE 溶液
(9)RNase溶液
(10)5mol/L 醋酸钾
(11)蛋白酶K 20mg/ml
四、实验步骤
1、取大肠杆菌C600单菌落于5 毫升LB培养液中,37℃振荡培养过液。
2、将上述菌液1%接种量接种于20 毫升LB 培养液中,37℃摇床振荡培养过夜。
3、已培养好的菌液,收集于10毫升的离心管中,在低速离心机上4000r/min离心10分钟,去上清,留沉淀菌体。
4、用5 毫升的SET 溶液悬浮细胞,加入20% SDS 1毫升,37℃下轻摇过夜,使细胞裂解。
5、加入等体积的饱和酚,上下轻轻摇匀,放置5 分钟后,在低速离心机上3500r/min离心10 分钟。
6、取上相,加入1/2 体积的饱和酚,1/2体积的氯仿异:戊醇,上下翻转均匀,3500r/min离心10 分钟。
7、取上相,加入等体积的氯仿:异戊醇,如第6步,离心。
8、取上相于一干净离心管中,另在一个50 毫升的烧杯中加入15毫升预冷无水酒精,把上述的上相液沿着玻棒慢慢倒入酒精中,并温和地搅拌以使DNA 附着于玻棒上。
9、挑起DNA,再放于干净的酒精中洗涤,然后把DNA溶于50 毫升TE 中,待测浓度。
(二)枯草杆菌染色体DNA 的抽提
1、在BY 斜面上划线活化枯草杆菌BR151。
2、挑一环已活化的BR151 菌株于20 毫升的BY培养液中,37℃摇床振荡培养过液。
3、过夜培养物,收集10 毫升于离心管内,在低速离心机上3500r/min离心10 分钟。
4、沉淀菌体加入0.75 毫升溶菌酶液(8 毫克溶菌酶/1毫升SET),振荡器上悬浮细胞,悬浮液移入1.5 毫升离心管,室温30 分钟。
5、在反应液中加入0.15毫升SDS溶液,蛋白酶K 溶液5 微升,37℃水浴10 分钟后转入75℃水浴5 分钟。
6、加入5mol/L 醋酸钾0.3 毫升,上下翻转均匀,置于冰上30 分钟,期间不时摇动。
于台式高速离心机离10000r/min10 分钟。
7、上清液移入另一离心管,弃沉淀。重复第六步。
8、上清液移入5 毫升的离心管内,缓慢加入2倍体积的无水酒精,DNA呈絮状沉淀。用一灭菌牙签,挑起DNA 沉淀,溶于50微升TE中。待检查浓度。
9、若无絮状沉,则把其置-20℃冷冻3 小时(或-70℃冷冻30 分钟),取出离心10 分钟(10000rPm),去上清,晾干,加入50ul TE溶解(取20ul 点样测定)。
(三)染色体DNA 制备样品浓度测定
1、按实验一方法制备琼脂糖凝胶(0.6%)
2、分别取标准浓度的λDNA 0.05ug、0.1ug、0.15ug、0.2ug,加相应的加样缓冲液混合好,点样。
3、取2 微升染色体DNA 样品点样(冷冻离心获取的DNA样品取50 微升点样),打开电泳仪电泳,待溴酚兰进入凝胶2 厘米后,停止电泳,紫外灯下观察,估计样品DNA浓度。
五、结果讨论与问题
紫外光下观察DNA 样品纯度,计算出制备的DNA总量和浓度。
1、SDS 在抽提DNA 过程有哪几个作用?
2、在本实验中未加入RNase,那么样品中应出现什么情况?
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dna提取浓度低是什么问题?
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错畅欧诺:[答案] 细菌染色体DNA的抽提一、 目的熟练掌握抽提细菌DNA的一般方法二、原理要进行重组DNA 实验,就离不开外源基因的纯化,而外源基因主要来源之一就要直接从生物的染色体DNA上制备,所以制备高质量的染色体DNA样品经常为基因...
白河县15595081476: 提取大肠杆菌DNA时,裂解大肠杆菌最常采用的方法是什么?原理时什么? - ?
错畅欧诺:[答案] 最常用的办法是SDS法,在反应体系中加入终浓度约为1%的SDS37度水浴1小时就可以完成大肠杆菌的裂解.现在手提细菌的基因组DNA基本上就是这个办法,具体步骤在分子克隆和精编分子生物学实验指南上都有,是最经典的方法.SDS是一种阴离...
白河县15595081476: 细菌染色体DNA的提取各个步骤原理!跪谢~~ - ?
错畅欧诺: 1.取细菌培养物1.5 mL 于5000 rpm离心1分钟,倾去上清液. 2.取沉淀加100 μL预冷的溶液I摇匀并悬浮细胞,再加200 μL预冷的溶液II摇匀后冰浴5分钟,最后加入150 μL预冷的溶液III摇匀后冰浴5分钟,12000 *g离心5分钟或10000 *g离心8分钟...
白河县15595081476: 细菌DNA提取的原理 - ?
错畅欧诺: 原理: 1.析出溶解在NaC1溶液中的DNA. 2.用冷酒精提取出含杂质较少的DNA. 3.DNA在沸水浴时被二苯胺染成蓝色.
白河县15595081476: 微生物DNA提取的方法有哪些?
错畅欧诺: 一、试剂准备1.溶液Ⅰ:50mM葡萄糖,25mM Tris-HCl(pH 8.0),10mM EDTA(pH 8.0).1M Tris-HCl(pH 8.0)12.5ml,0.5M EDTA(pH 8.0)10ml,葡萄糖4.730g,加ddH2O至500ml.在10 lbf/in2高压灭菌15min ,贮存于4℃.2.溶液Ⅱ:0.2N NaOH,1% SDS.2...
白河县15595081476: 如何提取水体中微量微生物的DNA ?
错畅欧诺: 没分离提取过,但想来应该如下.首先要把这种微生物从水体中单独分离出来,然后给予它适宜的营养条件和生长环境,让它大量繁殖(数量太少无法提取其DNA),然后才能考虑提取它的DNA.
白河县15595081476: 提取DNA的方法总结 - ?
错畅欧诺: 细菌染色体DNA的抽提 一、 目的 熟练掌握抽提细菌DNA的一般方法 二、原理 要进行重组DNA 实验,就离不开外源基因的纯化,而外源基因主要来源之一就要直接从生物的染色体DNA上制备,所以制备高质量的染色体DNA样品经常为基因工程...
白河县15595081476: DNA提取方法有哪些 - ?
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白河县15595081476: 请问:怎样提取微生物的质粒(DNA)? - ?
错畅欧诺:[答案] 碱提法: 一、试剂准备 1.溶液Ⅰ:50mM葡萄糖,25mM Tris-HCl(pH 8.0),10mM EDTA(pH 8.0).1M Tris-HCl(pH 8.0)12.5ml,0.... 溴化乙锭(EB):10mg/ml 9.RNase A(RNA酶A):不含DNA酶(DNase-free) RNase A的10mg/ml,TE配制,沸水加热15min...
白河县15595081476: dna的提取方法 - ?
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