DNA甲基化的检测方法主要包括哪些?
去哪里找最出色的生命科学学术交流论坛?>>> 方法概括起来可分为三类:基因组整体水平的甲基化检测、基因特异位点甲基化的检测和新甲基化位点的寻找。1) 基因组整体水平甲基化分析a) 高效液相色谱柱(HPLC)及相关方法b) SssI 甲基转移酶法c) 免疫化学法d) 氯乙醛法2) 特异性位点的DNA甲基化的检测a) 甲基化敏感性限制性内切酶(MS-RE)-PCR/Southern法b) 直接测序法c) 甲基化特异性的PCR(methylation-specific PCR, MS-PCR)d) 甲基化敏感性单核苷酸引物延伸(Ms-SnuPE)e) 结合重亚硫酸盐的限制性内切酶法(combined bisulfite restriction analysis,COBRA)f) 甲基化敏感性单链构象分析(methylation-specific single-strand conformation analysis,MS-SSCA)g) 甲基化敏感性变性梯度凝胶电泳(methylation-specific denaturing gradient gel electrophoresis,MS-DGGE)h) 甲基化敏感性解链曲线分析(methylation-specific melting curve analysis,MS-MCA)i) 荧光法(Methylight)j) DNA微阵列法k) 甲基化敏感性斑点分析(methylation sensitive dot blotassay,MS-DBA)l) 甲基化特异性多连接依赖性探针扩(Methylation-Specific multiplex ligation-dependent probe amplification,MS-MLPA)3) 甲基化新位点的寻找a) 限制性标记基因组扫描(restriction landmark genomic scanning,RLGS)b) MBD(Methyl-CpG binding domain column chromatography,甲基化结合区)柱层析法c) 联合甲基化敏感性限制性内切酶的MBD(Combination of methylated-DNA precipitation and methylation-sensitive restriction enzymes,COMPARE-MS)
先说DNA甲基化对DNA复制的调节吧,基因组中60%~ 90% 的CpG 都被甲基化, 未甲基化的CpG 成簇地组成CpG 岛, DNA 甲基化可引起基因组中相应区域染色质结构变化, 使染色质高度螺旋化, 凝缩成团, 使复制不能进行。
DNA修复:修复有多种,涉及甲基化的主要是错配修复,错配修复主要用来纠正DNA双螺旋上错配的碱基对,还能修复一些因复制打滑而产生的小段的核苷酸插入或缺失。错配修复的过程需要区分母链和子链,做到只切除子链上错误的核苷酸,而不切除母链上本来就正常的核苷酸。这过程就是由甲基化完成的,Dam甲基化酶将母链上的GATC的C甲基化,从而将母链子链区分开来。
什么是肾上腺素和糖皮制激素?
肾上腺素(adrenaline,epinephrine,AD)是肾上腺髓质的主要激素,其生物合成主要是在髓质铬细胞中首先形成去甲肾上腺素,然后进一步经苯乙胺-N-甲基转移酶(phenylethanolamine N-methyl transferase,PNMT)的作用,使去甲肾上腺素甲基化形成肾上腺素。肾上腺素的一般做用使心脏收缩力上升;心脏、肝、和筋骨的血管...
胶质瘤化疗进展
替莫唑胺(Temozolomide,TMZ)属于第二代烷化剂化疗药。它可直接作用于合成DNA的底物,使之甲基化,从而导致DNA 单链和双链断裂,抑制 DNA 的复制,最后导致细胞死亡。因为分子小,具有很好的亲脂性,所以TMZ能较好地通过血脑屏障,在中枢神经系统能达到血浆浓度的40,从而使之在中枢神经系统肿瘤治疗中有很好的应用前景。
大肠杆菌表达菌株JM109,Top10,Rosetta各自有什么特点啊,如何选择?_百度...
要排除dam,dcm甲基化的影响,需要用特定的dam-,dcm-的菌株,如JM110 如果由JM110或 SCS110等甲基化缺失的菌株产生的质粒,则不会被甲基化.各种感受态细胞的区别 用途 特征 Xl1-Blue菌株 基因型:endA1 gyrA96(nalR) thi-1 recA1 relA1 lac glnV44 F‘[Tn10 proAB+ lacIq Δ(lacZ)M15] h...
新帖:谁能帮我翻译,给你5000分
作为eluents Na2SO4。吸收光谱特性和dF \/ HKBJ核 测定sonicated反应混合物使用RTR@p =对照(ck) Shimadzu UV-3100分光光度法测定了。4 ?)-氯甲基化反应阴离子、Hx型_ X 形成了从介绍用反相高效液相色谱法测定核;3H # 8x - 离子色谱(Yokogawa-Hokushin IC-100)。0ynvn9@t R | h(SXa 23。超声辐照~ qx...
端粒及端粒酶的结构功能及生理意义
另外,Wan �et al〔11〕�报道了具有更高生物稳定性的2’-O-甲基化榔头样核酶能在大约�0.4μmol\/L�时抑制人神经胶质瘤U87-MG细胞中90%的端粒酶活性. 能降解端粒酶RNA组分的核酶有希望成为一种抗癌新药物.� Feng �et al〔12〕在体外采用了与模板区互补的反义寡核苷酸来抑制端粒酶活性. 转染了...
化学制浆过程中木质素溶出两种途径是什么
磺化包括高温磺化氧化,磺化,和磺甲基化高温磺化碱木质素和Na:SO约18O?反应,木质素磺酸基团的侧链中引入作为网状的大分子结构,得到水溶性好的产品木质素屏幕低谷效应更加明显,该表面可以被磺化,但其网络内的磺酸基由于不能进入,但不磺化。第一氧化荆,(例如KMn0,H O)等的氧化,小分子被中断,然后磺化,然后使用偶联...
试说明DNA损伤的类型及其修复机制
○2环境因素造成的损伤—辐射(TT)致癌物质(烷化剂、EB亚硝酸等)如碱基的损伤、错配,碱基的缺失,碱基的交联等。2)○1错配修复系统恢复错配;○2碱基切除修复系统切除突变碱基;○3核苷酸切除修复系统修复被破坏的DNA;○4DNA直接修复系统修复嘧啶二聚体或甲基化DNA。 本回答被提问者采纳 已赞过 已踩过< 你对...
食品中CMC是什么?
食品中CMC是羧甲基纤维素钠,是纤维素的羧甲基化衍生物,是最主要的离子型纤维素胶。CMC-Na为白色纤维状或颗粒状粉末,无臭、无味、有吸湿性,易于分散在水中形成透明的胶体溶液。CMC在食品中的应用:传统的调酸型乳饮料在应用了CMC-Na冷化料工艺优化后,在货架期内,其产品黏度总是高于热化料产品...
邸静希普:[答案] 去哪里找最出色的生命科学学术交流论坛?>>> 方法概括起来可分为三类:基因组整体水平的甲基化检测、基因特异位点甲基化的检测和新甲基化位点的寻找.1) 基因组整体水平甲基化分析a) 高效液相色谱柱(HPLC)及相关方法...
盐亭县18534834159: DNA甲基化的检测方法主要包括哪些? - ?
邸静希普: 参考见解:方法概括起来可分为三类:基因组整体水平的甲基化检测、基因特异位点甲基化的检测和新甲基化位点的寻找.1) 基因组整体水平甲基化分析 a) 高效液相色谱柱(HPLC)及相关方法 b) SssI 甲基转移酶法 c) 免疫化学法 d) 氯乙醛法2) 特异性位点的DNA甲基化的检测 a) 甲基化敏感性限制性内切酶(MS-RE)-PCR/Southern法 b) 直接测序法
盐亭县18534834159: DNA甲基化检测有哪些方法?? - ?
邸静希普: DNA甲基化检测: Southern Blot杂交、 Bisulfite Sequencing and McrBC-PCR
盐亭县18534834159: 如何进行DNA甲基化分析 - ?
邸静希普: 基因甲基化的检测方法主要有以下几种:甲基化特异性的PCR(Methylation-specific PCR,MSP) 用亚硫酸氢盐处理基因组DNA,所有未发生甲基化的胞嘧啶被转化为尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变;随后设计针对甲基化和非甲基化序列的引物进...
盐亭县18534834159: 甲基化的甲基化检测技术 - ?
邸静希普: 曾经是2009年最值得关注的技术.遗传上除了ATGC这四种碱基,人们对第五种碱基-甲基化的胞嘧啶的兴趣也日益增加.甲基化修饰的存在对DNA转录的调控起了重要作用,异常的甲基化往往是许多疾病的起因.既然如此重要,系统绘制甲基...
盐亭县18534834159: DNA甲基化的最主流研究方法是什么 - ?
邸静希普: 甲基化特异性PCR(MSP),或甲基化组测序.适用对象不一样,前者针对特定基因的甲基化水平,后者针对全基因.
盐亭县18534834159: 如何检测甲基化的程度? - ?
邸静希普: 先用中亚硫酸盐处理,使DNA中未发生甲基化得胞嘧啶脱氨基转化为尿嘧啶而甲基化的胞嘧啶保持不变,PCR扩增得到所需片段,片段中尿嘧啶全部转化成T,然后对PCR产物测序,并与未处理的序列比较,判断CpG位点是否发生甲基化.我们研究院对甲基化检测很专业,感兴趣的话,可以看看:中关村华康基因研究院
盐亭县18534834159: 如何查找印记基因的差异甲基化区域 - ?
邸静希普: 找甲基化位点也就CpG岛一般是有以下几个方法:1. MSP,亚硫酸氢盐转化后,将你想测的基因区域(如启动子区)转入细菌质粒中,进行测序(金标准).挑克隆7/10是甲基化的克隆认为这个位点70%甲基化.大概可以测400+片段,但是问题是...
盐亭县18534834159: 什么是bisulfite sequencing PCR,BSP - ?
邸静希普: 目前, 基因的甲基化研究主要结合亚硫酸氢钠处理和PCR技术,分为甲基化特异性PCR(Methylation specific PCR,MSP)和硫化测序PCR(Bisulfite sequencing PCR, BSP).技术原理:DNA经亚硫酸氢盐硫化处理后,DNA双链中的“C”转化为“...
盐亭县18534834159: 如何确定一个基因是高甲基化还是低甲基化 - ?
邸静希普: 你这里说的白细胞甲基化应该是针对比如血液的,而全基因组甲基化通常涉及到的是全身的,检测时候取的样本不一样吧.