逆转录原理

作者&投稿:笪虹 (若有异议请与网页底部的电邮联系)
rna逆转录时65℃,5min是什么原理~

循环反应:1.变性,即对待扩增的RNA模板加热变性,温度条件89~95℃,保温定时间(5~120秒);2.复性,即RT引物(用于RT过程中,与RNA链结合并能引导CDNA合成的DNA寡核苷酸)与RNA链上的互补序列结合复性,温度条件55~68℃,保温一定时间(5~90秒);3.延伸,即逆转录酶催化RT引物延伸合成CDNA,形成RNA-DNA杂合双链,温度条件60~70℃,保温一定时间(60~180秒);杂合双链变性解链后,RT引物再结合到RNA链上,由逆转录酶第二次催化引物延伸合成CDNA,如此,利用RNA模板,可以反复进行CDNA合成,因而,称之为循环逆转录(Cycle Reverse Transcription,CRT)。
这个不同温度持续时间,以实际逆转录反应不同而有所差异。

原理是:提取组织或细胞中的总RNA,以其中的mRNA作为模板,采用Oligo(dT)或随机引物利用逆转录酶反转录成cDNA。再以cDNA为模板进行PCR扩增,而获得目的基因或检测基因表达。
该技术主要用于:分析基因的转录产物、获取目的基因、合成cDNA探针、构建RNA高效转录系统。
RT- PCR(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction)即逆转录PCR,是将RNA的反转录(RT)和cDNA的聚合酶链式扩增(PCR)相结合的技术。
首先经反转录酶的作用从RNA合成 cDNA,再以cDNA为模板,扩增合成目的片段。RT-PCR技术灵敏而且用途广泛,可用于检测细胞中基因表达水平,细胞中RNA病毒的含量和直接克隆特定基因的cDNA序列。
作为模板的RNA可以是总RNA、mRNA或体外转录的RNA产物。无论使用何种RNA,关键是确保RNA中无RNA酶和基因组 DNA的污染。
用于反转录的引物可视实验的具体情况选择随机引物、Oligo dT 及基因特异性引物中的一种。对于短的不具有发卡结构的真核细胞mRNA,三种都可。

扩展资料
反转录酶的选择
1、Money 鼠白血病病毒(MMLV)反转录酶:有强的聚合酶活性,RNA酶H活性相对较弱。最适作用温度为37℃。
2、禽成髓细胞瘤病毒(AMV)反转录酶:有强的聚合酶活性和RNA酶H活性。最适作用温度为42℃。
3、Thermus thermophilus、Thermus flavus等嗜热微生物的热稳定性反转录酶:在Mn存在下,允许高温反转录RNA,以消除RNA模板的二级结构。
4、MMLV反转录酶的RNase H突变体:商品名为SuperScript 和SuperScriptⅡ。此种酶较其它酶能多将更大部分的RNA转换成cDNA,这一特性允许从含二级结构的、低温反转录很困难的mRNA模板合成较长cDNA。
参考资料:百度百科——RT -PCR

逆转录PCR ( RT-PCR )的原理
逆转录PCR (RT-PCR )具有较高的灵敏性、操作简单等优点,常用于基因定量分析、生物学检测等,此外常用逆转录PCR克隆目的基因。 本文主要讲述了逆转录PCR的原理、重要参数以及操作注意事项。
cDNA的合成是RT-PCR 的重要环节。以mRNA为模板,在逆转录酶的催化下,随机引物、oligo(dT)或基因特异性引物的引导下合成互补的DNA(complementary DNA,cDNA),再按照普通PCR的方法用两条引物以cDNA为模板,则可扩增出不含内含子的可编码完整基因的序列。
逆转录PCR 重要参数
不同mRNA拷贝成cDNA的效率不同;因此,适合于一种mRNA拷贝的条件可能对另一种mRNA不适合。一般来说,从事不均一mRMA群体时,所使用的条件是导致cDNA合成的终产量达到最大,下述参数十分重要。
1.逆转录酶 有两种不同的逆转录酶可以催化以mRNA为模板,oligo(dT)作为引物,合成与mRNA互补的cDNA链。一种来自纯化的禽成髓细胞瘤病毒(AMV),由两条肽链组成,具有聚合酶活性和很强的RNA酶H活性,它最适温度是42℃,最适pH8.3。在高反应温度时可消除mRNA的二级结构对逆转录的阻碍,然而高水平的RNA酶H的活性既抑制cDNA产生也限制其长度。另外,禽源逆转录酶制剂可被能切割DNA的核酸内切酶污染。
另一种来源于鼠白血病病毒(Mo-MLV),是单肽链的,有RNA聚合酶活性和相对较弱的RNA酶H活性,最适温度37℃,最适pH7.6,较弱的RNA酶H活性对获得2-3kb的mRNA的全长cDNA有很大好处。
在第一链反应前可用氢氧化甲基汞处理,破坏mRNA的二级结构,这一步对于最适反应温度较低(37)℃的鼠源逆转录酶催化的反应可能更为重要。临合成cDNA第一链之前加入过量的巯基试剂,可以使氢氧化甲基汞从RNA上解离。
2.单价阳离子 离子条件基本上影响各种模板的转录效率。用钾比用钠离子可获得较长的转录产物。对于cDNA长度的最适钾离子浓度为140-150mM。
3.二价阳离子 对于反转录酶活性来说,二价阳离子是必需的。低于4mM Mg2 未能观察到活性;产生全长转录产物的最适浓度是6-10mM。
4.脱氧核苷三磷酸 使用四种脱氧核苷三磷酸(dNTP)中每一种的高浓度对于有效合成cDNA是特别重要的。如果其中只有一种的浓度下降到10-50微摩尔以下,全长转录物的产量将明显下降。常用的dNTP的浓度为200-250微摩尔。
材料与方法


「单细胞测序1」单细胞转录组测序原理-欧易生物
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聂拉木县17772657918: 重组DNA技术中,如何采用逆转录PCR方法直接从mRNA获得特定基因的cDNA.(即逆转录PCR的基本原理) -
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聂拉木县17772657918: 什么是逆转录?是从RNA→DNA吗?碱基互补配对是怎样的 -
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聂拉木县17772657918: 什么是逆转录?请详细解释.大神们帮帮忙 -
姓姚康复: 转录是DNA→RNA,所以,顾名思义逆转录就是RNADNA.这是一些病毒侵入细胞进行繁殖的一种方式,需要逆转录酶的,病毒RNA变为DNA后就可以像正常细胞的DNA一样转录、翻译了.当然可能不只这一种方法,特殊的有RNA的自我复制,出现新个体~ 这应该很容易懂的吧,希望有用~

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