质粒DNA的小量制备 注意哪些操作 为什么

作者&投稿:车律 (若有异议请与网页底部的电邮联系)
在质粒dna的小量制备中,如何提高质粒dna的产量~

提取方法都是大同小异的,只要操作上注意量都不会差别很大。所以主要还是看菌液的状态。
如果想抽多一些,就摇多些菌液,一般如果是大质粒,用5ml以上菌液摇,多次离心用一管收集,相应增加溶液一二三的量即可。
另外,个人经验认为,一般摇16个小时菌的生长状态比较好。

1.在使用前,在溶液Ⅳ(洗涤液)加入40ml无水乙醇,然后在瓶盖上作好记号.
2.溶液Ⅱ(lysis buffer)在温度较低时,可能会产生沉淀,需先用水浴加热溶解,混匀后再使用.溶液Ⅱ易被空气中的CO2酸化,用完后应立即盖紧瓶盖.
3.最后加水溶解质粒时,可先将水加热,提高溶解度.

质粒DNA的小量制备注意事项:

  1. 如有必要,在酶切反应液中加人1 μl 10 mg/ml RNA酶溶液(不含DNA酶)以去除污染的RNA。

  2. 在使用前,在溶液Ⅳ(洗涤液)加入40ml无水乙醇,然后在瓶盖上作好记号。

  3. 溶液Ⅱ(lysis buffer)在温度较低时,可能会产生沉淀,需先用水浴加热溶解,混匀后再使用.溶液Ⅱ易被空气中的CO2酸化,用完后应立即盖紧瓶盖。

  4. 最后加水溶解质粒时,可先将水加热,提高溶解度。

质粒DNA的小量制备的步骤:

  1. 细菌的收获:将1.5ml菌液倒入微量离心管中,12000g离心30秒,吸去培养液。上清要务必吸取干净,否则会影响质粒的质量。必要时可以离心2次。 

  2. 将细菌沉淀重悬于150μl用冰预冷的溶液I中,加入1/50体积RNAseA贮存液,剧烈振荡,使之完全分散。 
    溶液I:50mmol/L葡萄糖,25mmol/LTris•Cl(pH8.0),10mmol/LEDTA(pH8.0) 
    不含dna酶的RNaseA:10mg/ml,TE配制,煮沸15~30min,-20℃分装贮存 
    注:(1)溶液I高压蒸气灭菌后,贮存于4℃;(2)葡萄糖可以由NaCl代替,以利于储存;但提取大于15kb的质粒,应将细菌悬于等渗蔗糖溶液中,并用溶菌酶处理;(3)务必使细菌沉淀完全分散,以利于碱液作用充分;(4)震荡时可以在离心管中加入牙签或枪头,提高效率;(5)配制RNaseA贮存液时,煮沸时间不宜过长或过短;(6)溶液I每2个月重新配制1次。 

  3. 加200μl溶液Ⅱ,颠倒混匀。 
    溶液Ⅱ:0.2mol/LNaOH,1%SDS 
    注:(1)若菌体裂解得充分,则溶液会变得很粘稠;(2)不要剧烈震荡,否则会混入基因组DNA;(3)每2个月重新配制1次。 

  4. 加150μl用冰预冷的溶液Ⅲ,轻微震荡混匀 
    溶液Ⅲ:5mol/L乙酸钾60ml,冰乙酸11.5ml,水28.5ml 
    注:(1)所配成的溶液对钾是3mol/L,对乙酸根是5mol/L,pH4.8左右;(2)尽量不要有大的块状沉淀,以利于下步离心;(3)每1个月重新配制1次,并分装贮存于小口瓶中。 

  5. 12000g离心5分种,将上清转移到另一离心管中。 

  6. 加入1/2体积的Tris饱和酚、1/2体积的氯仿-异戊醇(24:1)混合液,剧烈震荡混匀。 

  7. 12000g离心5分种,将上层液体转移到另一离心管中。 
    注:为了保证不吸出下层液体,可以先离心30秒,然后将上层与少量下层液体吸至另一离心管,离心5分种,再转移上层液体。切勿混入下层液体。 

  8. 加入60%体积的异丙醇,颠倒混匀后,室温静置5分钟。12000g离心5~10分钟,小心吸去上清液。 
    注:(1)沉淀即为质粒DNA;(2)为确保质粒完全沉淀,异丙醇的体积可以适当加大至62~65%。 

  9. 0.8ml70%乙醇洗涤DNA沉淀后,小心地吸去上清。在空气中静置3~10分钟,待沉淀干燥后,溶解于50μl高压灭菌的水中。 
    注:为洗涤充分,可以洗2次。 

  10. 取1~2μl样品测定紫外吸光度,对所得质粒进行定量并了解其纯度,或取1~2μl样品进行琼脂糖电泳,估计其纯度和得率。 




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国昨替硝: 1.在使用前,在溶液Ⅳ(洗涤液)加入40ml无水乙醇,然后在瓶盖上作好记号. 2.溶液Ⅱ(lysis buffer)在温度较低时,可能会产生沉淀,需先用水浴加热溶解,混匀后再使用.溶液Ⅱ易被空气中的CO2酸化,用完后应立即盖紧瓶盖. 3.最后加水溶解质粒时,可先将水加热,提高溶解度.

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