APC的APC基因突变检测方法

作者&投稿:尚虎 (若有异议请与网页底部的电邮联系)
APC的基因突变~

APC基因突变类型主要有点突变和框架移码突变,前者包括无义突变,错位突变和拼接错误,后者包括缺失和插入. APC基因突变有300多种,这些突变遍及整个基因,60%以上的突变位于第15号外显子的5′端. 其中密码子第1286~1513号之间的10%左右的编码区集中了约65%的体细胞突变,被称为突变密集区(MCR). 大部分突变属于错位突变,由缺失或1~8个碱基对的插入引起. 大约95%的突变结果是在下游形成提前的终止密码子,使APC蛋白呈截短改变,这可能削弱了APC蛋白固有的抑制细胞增殖功能,从而导致APC蛋白功能的障碍;Jarvinena等[1]认为这些APC截短蛋白可以结合于野生型APC蛋白,并对野生型蛋白具有显性负效应, 使之失活而导致肿瘤发生. 现国内外关于APC基因突变的研究很多,不同的报道所选择的研究目的基因也大都不相同,但大部分以研究15号外显子突变为主. Miyaki等[2]报道日本人在MCR以密码子1260~1453段突变率最高;国内王艳等[3]报道在1339~1436密码子区域突变率最高,1260~1359密码子区域突变率最低;而高枫等[4]将1337~1453段分为两段,分别设计引物扩增,也证实了上述说法.

APC 蛋白与 β连环蛋白 ( beta-catenin ) ( 一种转录transcription 因子 ) 形成复合物,导致β连环蛋白降解。如果缺乏 APC 蛋白,过多的β连环蛋白就会在 细胞核 (nucleus) 内的聚集。β连环蛋白与细胞核内的另一种蛋白结合 , 形成一种复合物;这种复合物又与 DNA结合,启动了几种 基因 (genes) 的转录。这种复合物中的一个靶基因叫做 c-myc 一种已知的 癌基因。 C-myc 本身就是几种基因的转录因子 (transcription factor), 它控制着细胞的生长和分裂。因此,APC 基因的突变导致了一系列的连锁反应,最终导致细胞分裂的加速。研究显示, 对缺乏APC 蛋白的结肠癌细胞添加APC 蛋白质有减退肿瘤细胞成长功能。成长的减退是由于细胞自动死亡增加的结果, 可见 APC 有控制细胞死亡并且成长的功能. 所以, APC基因的损失对细胞成长与细胞死亡之间的平衡有一定的影响。 APC基因控制细胞数量。

  通过检测APC基因突变,可筛选出FAP家族成员高危患者,也可用于评估结直肠癌的疗效和预后,所以检测APC基因变化对预防、早期诊断及早期治疗结直肠癌具有重大意义[13]. 检测APC基因突变的方法报道较多,大致分为3类.
第1类,直接序列分析,PCRSSCP法. 检测APC基因高度多态性DNA标记,不必对整个庞大的APC基因所有外显子进行检测[14]. 应用微卫星多态性标记进行LOH分析是目前抑癌基因定位和等位基因丢失研究中最经常采用的方法. APC基因等位丢失亦常出现在散发性结直肠癌中,LOH发生率为35%~45%[15]. 此类方法适合于较小片段基因(100~500 bp)突变的检测,对APC基因需分成40个相互重叠的片段来检测,费时,费力.
第2类,包括异源脱氧核糖核酸分子(DNA)分析法(Hdxa)和错配化学清除/羟胺锇酸酐(CCM/HOT)等. 一次可检测较大片段的DNA,减少受检片段,如CCM/HOT法使之降到25个片段. 然而,仍要对外显子进行突变检测,需较大片段的序列分析来确定,对APC基因检测也非简便的方法.
第3类,是针对基因突变产生终止密码而表达不全蛋白质(截短蛋白质)来设计的. 如体外合成蛋白质试验(IVSP法)和蓝/白选择试验,可以检测大片段的DNA或RNA,又能选择性发现产生终止密码的突变,与蓝/白选择试验不同的是,IVSP法还可根据不全蛋白大小来确定突变的位点. 通过对APC基因进行体外合成蛋白质及等位基因特异性表达的测定,可以更有效地检测到不能被PCRSSCP法所检测到的APC基因突变.  总之,由于APC基因突变与FAP早期发生密切相关,且FAP具有较高的遗传倾向,这种疾病如果不加治疗,其恶变率几乎达到100%,所以对APC基因的定位及其功能的研究对于FAP的早期诊断和治疗显得尤为迫切和重要[16]. 如果说最初APC基因的发现为FAP的分子诊断学提供了理论基础,现APC基因的研究进展正使针对这种疾病的分子诊断方法成为可能. 相信通过对APC基因的进一步研究,不仅会有更实用的基因检测诊断方法问世,而且可能得到针对肿瘤发生机制的特异性基因治疗方法
APC启动子有两个区,1A和1B。启动子1A区最为活跃。APC启动子高甲基化也可能是导致结直肠癌的原因。有研究表明APC启动子1A区在结直肠癌中高甲基化,二在腺瘤中不甲基化。APC启动子高甲基化抑制了APC的转录。据报道APC的1A启动子区高甲基化也发生在胃肠癌症中,比如食管癌,胃癌,胰腺癌,肝癌,结直肠癌。




什么是遗传性癌症?
家族性甲状腺癌综合征:这是由RET基因突变引起的遗传性甲状腺癌,可导致多个家庭成员出现甲状腺癌。家族性黑色素瘤:这是由CDKN2A和CDK4基因突变引起的遗传性黑色素瘤,可导致多个家庭成员患上黑色素瘤。腺瘤家族综合征:这是由APC基因突变引起的遗传性多发性息肉腺瘤,并容易发展成结肠癌。需要注意的是,...

肿瘤基因有突变是什么意思
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著名抑癌基因TP53的突变和药物
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千兆基因组定序完成 癌症研究重大里程碑
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什么是专职APC?
专职APC是指一类特化的细胞,它们具有摄入,加工,处理,提呈胞外抗原,激活CD4+T细胞,诱导免疫应答的能力。这类细胞必须表达MHC-Ⅱ类分子,协同刺激信号分子和各种粘附分子。专职APC包括单核-巨噬细胞,树突状细胞,内皮细胞和B细胞。树突状细胞(DC)机体功能最强的专职抗原递呈细胞,它能高效地摄取、...

抗癌基因有哪些
将抑癌基因导入到缺乏该基因的恶性肿瘤细胞中,观察时候有相应的表现。那么,抑癌基因有什么类型呢?下面我们来具体了解抑癌基因的相关知识。抑癌基因的分类。目前已经鉴定的抑癌基因有一百多种,比较常见的抑癌基因有Rb、P53、APC、nm23等。Rb基因也叫做视网膜母细胞瘤基因,是第一个被发现的抑癌基因。

研究一个抑癌基因的功能需要做哪些试验,系统点的
抑癌基因的产物主要包括:①转录调节因子,如Rb、p53;②负调控转录因子,如WT;③周期蛋白依赖性激酶抑制因子(CKI),如p15、p16、p21;④信号通路的抑制因子,如ras GTP酶活化蛋白(NF-1),磷脂酶(PTEN);⑥DNA修复因子,如BRCA1、BRCA2。⑥与发育和干细胞增殖相关的信号途径组分,如:APC、Axin等。编辑本段抑癌基因失...

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遗传癌症通常是由一些特定的遗传突变引起的。例如,BRCA1和BRCA2基因的突变是导致乳腺癌和卵巢癌的主要遗传因素之一。其他一些基因突变也与癌症有关,例如p53、APC、MLH1等。这些遗传突变可以是家族遗传的,也可以是自然发生的。如果一个人携带了这些突变,那么他们患某些癌症的风险会明显增加。但是,即使...

主要的抑癌基因有哪两种,其作用方式是什么?
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东营区13091765739: 健康基因检测 什么意思 -
赖话朗依: 就是检测健康人群的基因型,预测个人患病的风险,并向受检者提出生活上的指导,避免疾病的发生.现代医学认为:疾病是由于先天的基因禀性和后天的外在因素共同作用的结果.几乎所有疾病的发生都与基因有关,在某些情况下基因发生了...

东营区13091765739: 发现某个基因突变位点后,如何检测其对基因功能的影响? -
赖话朗依: 方法很多 如果这个基因表达蛋白的结构被解析出来的话 可以根据解析出的结构 分析突变是否在蛋白重要的功能位点 实验方法 克隆得到这个基因, 做定点突变得到你需要的突变基因 在细胞中表达 看蛋白在细胞定位有无变化 做coIP看和蛋白相互作用的蛋白有无变化 如果蛋白是个酶的话 看突变前后催化活性的变化 总之,看具体蛋白制定实验 最后最好做一个转基因的小鼠 把突变的基因转到小鼠中 看突变体和野生型的小鼠的不同

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