我做出来的PCR产物跑胶能出现清晰地条带,为什么测序公司不能测序,说是信号中断,什么原因?

作者&投稿:示雪 (若有异议请与网页底部的电邮联系)
为什么测序公司不能测序,说是信号中断,什么原因~

原因在于测序时经历了PCR反应及测序反应(测序反应本身也是PCR反应)二次聚合酶的打滑现象。
原因不明的复杂结构,测序结果就出现突然信号减弱或消失。出现这些现象的原因由DNA模板本身立体结构所造成的。
当DNA碱基中含GC含量高的时候,从某一位置开始聚合酶的聚合反应便无法进行下去。这样的情况,建议可以尝试换用反向引物进行测序。或者是将PCR产物做一个TA克隆后再测序,可以根本上解决测序信号中断的问题。

你知道你的目的片段的序列吗?看是否有str位点?如果有且为杂合子的话就无法直接用PCR产物测序,但可以通过转载体解决。琼脂糖凝胶电泳的分辨率较低,所以即使条带清晰,相差几个到十几个碱基也是无法区分的。还有就是你的测序引物是你的PCR引物吗?可以考虑设计专门的测序引物来测序,这样就可以避免因为非特异扩增而导致的测序结果较乱。如果知道了目的序列,就拿目的序列来设计,如果不知道,那就看你的现在的测序结果,找你的说法,应该是开始的碱基测序结果较好,那么你可以通过这些测序较好的碱基序列来设计测序引物。
另外,你拿到测序结果了吗?如果拿到了,那么就看你的测序峰形图,如果存在STR位点,测序应该是到一个位置后开始出现杂峰,但前面的峰较好,杂峰也是比较有规律的,至少刚开始出现杂峰的位置是,你可以看到两个平行的峰,他们缝间距是比较固定的,这样通常就是STR位点了。通常的解决办法就是转载体。
(仅供参考)

原因在于测序时经历了PCR反应及测序反应(测序反应本身也是PCR反应)二次聚合酶的打滑现象。 原因不明的复杂结构,测序结果就出现突然信号减弱或消失。出现这些现象的原因由DNA模板本身立体结构所造成的。
当DNA碱基中含GC含量高的时候,从某一位置开始聚合酶的聚合反应便无法进行下去。这样的情况,建议可以尝试换用反向引物进行测序。或者是将PCR产物做一个TA克隆后再测序,可以根本上解决测序信号中断的问题。

多大的片段啊,可能是片段太大,可以多设计几条引物!

多大的条带 拿通用引物去测一下 可能是里面有loop结构


PCR的产物是DNA吗?
PCR的产物一定是DNA。通俗的说,产物都是双链DNA,始于上游引物,终于下游引物。但如果很严谨的来说,还有不到1%的产物是带有3'单链尾巴的双链DNA以及一些没来得及复性的单链DNA,不过通常实验中我们忽略这些。你可以仔细想一下PCR的原理,特别是开始的3个循环。产物不会是RNA,首先我们PCR时用的Taq酶...

pcr产物是双链还是单链
双链。根据查询刷刷题APP显示。1、模板高温变性:双连解旋,形成两条单链。2、低温退火:上下游引物分别与两条单链退火,碱基配对结合。3、中温延伸:在高温聚合酶的参与下,利用dNTP,从引物最后的碱基开始,进行链的延长,最后形成双链。这是一个循环,N此循环后,也是这样,最终形成双链。

pcr产物测序之前需要纯化吗?
PCR产物测序之前通常需要经过纯化处理。PCR产物是由DNA扩增得到的片段,其中可能还包含有引物、缓冲液、盐等反应组分。这些杂质可能会影响测序的准确性和可靠性,因此需要进行纯化。通常,PCR产物的纯化方法主要有凝胶切割、凝胶电泳分离、酶处理、柱式纯化等。其中,通过凝胶切割和凝胶电泳分离可以将PCR产物从...

请教一下人基因组DNA进行PCR后得到的产物是什么
PCR技术是利用DNA双链复制的原理进行的 是将基因的核苷酸序列不断地加以复制,使它的数量呈指数形式增长。所以,PCR技术的产物为大量核苷酸序列。

PCR的产物是DNA吗?
可以用于rna的增值,增值产物肯定是双链,因为有个降温的过程,这个时候就是根据配对原则延伸了。你可以看下这个资料http:\/\/baike.baidu.com\/view\/2764.html?wtp=tt 参考资料:http:\/\/baike.baidu.com\/view\/2764.html?wtp=tt

关于PCR产物的理解
PCR有两种解释:1:RT 是”逆转录“这项技术使用的”逆转录酶“来自逆转录病毒,是一种能按照碱基互补配对原则,以脱氧核糖核苷酸为底物,以寡居dT为引物,把mRNA转换成相应DNA的酶,由于该酶的效果与中心法则顺序相反,故而有”逆转录“之称。2:RT是”实时“细胞瞬时转录的mRNA种类颇多,各种mRNA含量...

pcr的产物dna碱基序列的特异性体现了TaqDNA聚合酶的什么?
PCR(聚合酶链反应)是一种常用的分子生物学技术,用于扩增DNA片段。在PCR过程中,Taq DNA聚合酶是最常用的酶之一。Taq DNA聚合酶是从热波菌属(Thermus aquaticus)中分离出来的热稳定DNA聚合酶。其特异性体现在以下几个方面:1. 热稳定性:Taq DNA聚合酶能够在高温条件下工作,因为它起源于生活在高温...

我做出来的PCR产物跑胶能出现清晰地条带,为什么测序公司不能测序,说是...
测序结果就出现突然信号减弱或消失。出现这些现象的原因由DNA模板本身立体结构所造成的。当DNA碱基中含GC含量高的时候,从某一位置开始聚合酶的聚合反应便无法进行下去。这样的情况,建议可以尝试换用反向引物进行测序。或者是将PCR产物做一个TA克隆后再测序,可以根本上解决测序信号中断的问题。

PCR的扩增产物是什么 是如何扩增出来的
产物是目的基因 就是先把目的基因的两条链用加热的方式解开使之成为单链 加入的引物(一小段DNA)通过DNA聚合酶和目的基因连接并扩展出另一条链 反复几次就完了

pcr扩增产物的作用
pcr扩增产物的作用是可以用于进一步的研究。PCR反应完成目标DNA的扩增后,PCR产物可以用于进一步的研究。例如用于DNA测序、克隆、分析基因的功能和表达等。

鄂城区19281298496: 我做出来的PCR产物跑胶能出现清晰地条带,为什么测序公司不能测序,说是信号中断,什么原因?
韦学利鲁: 原因在于测序时经历了PCR反应及测序反应(测序反应本身也是PCR反应)二次聚合酶的打滑现象. 原因不明的复杂结构,测序结果就出现突然信号减弱或消失.出现这些现象的原因由DNA模板本身立体结构所造成的. 当DNA碱基中含GC含量高的时候,从某一位置开始聚合酶的聚合反应便无法进行下去.这样的情况,建议可以尝试换用反向引物进行测序.或者是将PCR产物做一个TA克隆后再测序,可以根本上解决测序信号中断的问题.

鄂城区19281298496: 为什么PCR产物通过核酸定量仪定量很低,而跑凝胶电泳却有很亮的条带 -
韦学利鲁: 为什么PCR产物通过核酸定量仪定量很低,而跑凝胶电泳却有很亮的条带?PCR产物定量只有6ng/ul,而凝胶电泳却有非常亮的条带.欢迎讨论!

鄂城区19281298496: 总DNA跑电泳时没有条带,但是做PCR,能跑出来条带,并且条带很清楚这能说明P的是想要的产物吗? -
韦学利鲁:[答案] 总DNA若是用电泳检测不到,有可能是因为浓度比较低,但不一定没有.PCR能出结果,说明DNA模板还是有的.若能检测出PCR结果,要看下片段大小是否与你期望的差不多,若是,可以进行送样测序.确定. -----中国西部生命科学论坛

鄂城区19281298496: 分子实验问题 -
韦学利鲁: 其实结果很明显,就是没有条带.如果有目的条带的话,会在目的长度点很清晰地显现出来.点样孔处的红点是常有的,那个不影响.现在的问题是你的样品没跑出来.建议做以下调整:1、调整PCR反应条件,特别是退火温度需要十分注意....

鄂城区19281298496: 琼脂糖凝胶电泳跑成这样是怎么回事 -
韦学利鲁: 电泳出现拖尾现象,就是弥散.其原因,主要从以下两个方面考虑: 1、PCR产物自身原因: 往往由于酶量过多或酶的质量差,dNTP浓度过高,Mg2+浓度过高,退火温度过低,循环次数过多,而造成PCR的非特异性产物 过多. 对策:①减少Taq酶的量,或调换另一来源的酶.②减少dNTP的浓度.③适当降低Mg2+浓度.④增加模板量,减少引物的用量 ,减少循环次数,提高退火温度. 2、电泳体系的问题: (1)电泳缓冲液TAE或者TBE的污染,建议更换缓冲液.(2)上样时样品漂了,建议增加上样缓冲液的用量,以及小心加样.(3)电压太高.(4)适当把你的胶的浓度加大.(根据你的片断大小而定)(5)观察你的marker是否也存在拖尾现象,作为对照.

鄂城区19281298496: 请教 如何将琼脂糖凝胶电泳跑漂亮 -
韦学利鲁: 1. 一般PCR或RT-PCR的产物电泳时应该用>1%的琼脂糖凝胶进行电泳,2. 事实上,很多情况下胶跑得不够漂亮跟一些微不足道的细节有关,有时候做胶前如果梳子没洗干净,胶的孔就不够整齐;3. 还有点样时,不要让枪头戳到孔的边沿,尤其是前沿,如果戳缺一点,跑出来的胶就是弯曲的.4. 最好不要用这么长的胶跑,等点到最后面的样时,前面的样都有点扩散了,跑的不是很漂亮.

鄂城区19281298496: 电泳图谱清晰的关键是什么? -
韦学利鲁: 不论是DNA、RNA还是蛋白,漂亮的电泳条带的基础是样品质量要好. 1. RNA:RNA提取过程中不发生降解的话,一般普通的琼脂糖电泳会得到3条清晰地条带,上面两条比较亮,且第一条是第二条亮度的2倍,第三条比较淡.如果样品稍有降解...

鄂城区19281298496: 在做荧光定量PCR时,PCR仪检测不到荧光信号,但是产物用琼脂糖电泳后有清晰的目的条带,请问这是为什么? -
韦学利鲁:[答案] 问题很多啊.或者是你的PCR仪需要进行荧光校准(如果其他探针也没有信号的话),已经不能收集荧光信号了.或者是你的探针本身就有问题,合成的不好,信号很弱甚至没有信号.或者是你的探针存放时间太长,存放条件不好,导致探针已经降解....

鄂城区19281298496: PCR产物跑胶什么条带都没有是怎么回事 -
韦学利鲁: 做PCR时,最抑闷的一件事就是花了三个多小时,一点儿结果都没有.以前做的时候,我也遇到这增的问题!所有的反应液和底物加好了,机器设好了,跑吧,跑完PCR了,好的,再来跑电泳检测,结果,白花花一大片,什么都没有,那一刻...

鄂城区19281298496: PCR跑胶,目的条带很亮,但是边沿不清楚,前后有拖尾现象,请教各位是什么原因? -
韦学利鲁: 博凌科为-为你解答:1模板可能有降解,建议避免反复冻融,放置时间不能太长.模板的质量是最重要的.2抽提RNA时有污染,包括基因组DNA污染和蛋白质污染,需重 做抽提.3提高退火温度,减少非特异性扩增.4减少循环次数,减少非特...

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