实验二 RT-PCR扩增GADPH

作者&投稿:简耿 (若有异议请与网页底部的电邮联系)
~

实验二:RT-PCR扩增GAPDH的精密操作


RT-PCR,即逆转录聚合酶链反应,是分子生物学中不可或缺的工具,它能将RNA转化为cDNA,为基因扩增提供模板。这项技术的核心在于严谨的步骤和精准的试剂选择,下面我们将深入解析这一实验的各个环节。


2.1 RT-PCR原理与关键步骤


首先,从组织或细胞中提取的总RNA或mRNA需要经过逆转录,由逆转录酶催化,它依赖于Zn2+和四种脱氧核苷三磷酸(dATP、dGTP、dCTP、dTTP),在引物引导下,以5'→3'的方向合成cDNA。但请注意,逆转录酶不具备从3'→5'的核酸外切酶活性,这是区分RT和PCR的重要特征。


PCR反应则分为三个阶段:起始变性、循环扩增和充分延伸。在94℃变性阶段,DNA模板被分开成单链,便于引物结合。循环反应则涉及变性、退火(引物与模板结合)、延伸三个步骤,通常需要25~30轮,确保目标片段的高效扩增。最后,72℃的延伸阶段让产物完整延伸,提高扩增效率。


2.2 实验材料与关键试剂


实验的核心材料包括小鼠肝脏的总RNA,以及Takara PrimeSript TM 1st strand cDNA合成试剂盒,用于逆转录。此外,GAPDH引物具有Xol I 和Bam H I酶切位点,确保扩增产物的纯度。dNTPs、Taq DNA聚合酶、DEPC处理的ddH2O等是PCR反应的必要元素。实验中还涉及不同规格的移液枪、PCR仪等专业设备。


2.3 实验过程详解


实验过程分为主动逆转录和PCR扩增两部分。首先,使用Takara试剂盒逆转录RNA,关键步骤包括配制反应液(含Oligo dT Primer、dNTPs、模板RNA和RNase抑制剂等),在65℃保温后进行酶反应,再通过95℃终止酶活性。然后,进行PCR扩增,以cDNA为模板,通过精确设定的温度和循环次数,确保GAPDH基因片段的高效扩增。PCR产物的回收则借助TAKARA Minibest DNA Fragment Purification kit,通过洗脱步骤去除杂质,保留纯化的DNA片段。


2.4 实验注意事项与讨论


实验中,确保RNA的完整性至关重要,这要求在处理过程中严格控制温度和时间。每个步骤,如酶反应的温度控制和PCR循环数的设定,都需根据实验材料特性进行微调。同时,理解各试剂在提取过程中的作用,如逆转录酶、缓冲液和洗脱液等,能有效提高实验的准确性和成功率。


通过精心设计的实验步骤和对每个环节的严格把控,我们得以在RT-PCR中高效扩增GAPDH基因,为后续的分子生物学研究打下坚实基础。




盐边县17776849810: GADPH是什么 -
习冒替诺: GAPDH是参与糖酵解的一种关键酶,由4个30-40kDa的亚基组成,分子量146kDa,检测条带大约在36kDa.GAPDH基因几乎在所有组织中都高水平表达,广泛用作Western blot蛋白质标准化的内参.因为GAPDH 作为管家基因在同种细胞或者...

盐边县17776849810: “RT - PCR扩增目的基因cDNA”需要注意的事项有哪些? -
习冒替诺: RT-PCR 是将 RNA 的反转录(RT)和 cDNA 的聚合酶链式扩增(PCR)相结 合的技术.首先经反转录酶的作用从 RNA 合成 cDNA,再以 cDNA 为模板, 扩增合成目的片段.RT-PCR 技术灵敏而且用途广泛,可用于检测细胞中基 因表达水平...

盐边县17776849810: 反向PCR怎么做 -
习冒替诺: 反向pcr(inverse pcr)反向pcr是一种多聚合酶链式反应(pcr)应用的方法,可使已知序列的核心区边侧的未知rma成几何级数扩增.用适当的限制性内切裂解含核心区的rma,以产生适合于pcr扩增大小的片段,然后片段的末端再连接形成环状分子.pcr的引物同源于环上核心区的末端序列,但其方向可使链的延长经过环上的未知区而不是分开引物的核心区.这种反向pcr方法可用于扩增本来就在核心区旁边的序.

盐边县17776849810: 如何测定taqman探针的浓度 -
习冒替诺: 一般Taqman定量PCR实验过程为:目的基因查找比对→探针与引物设计→探针与引物合成→配置反应体系→反应参数→重复实验,优化条件→获得曲线数据,比对标准曲线→再重复验证. 第一步:在第一步目的基因查找比对过程中可以利用...

盐边县17776849810: rt - pcr的值为 什么意思 -
习冒替诺: 阈值指指数增长期荧光信号的临界值,一般PCR仪会自动给出阈值,而CT指就是扩增曲线达到阈值时的循环圈数.

盐边县17776849810: 影响RT - PCR扩增产物因素 -
习冒替诺: 具体的实验都是不一样的,看你用两部法还是一步法做RT-PCR,反应体系、引物特异性、操作手法等等都会影响到扩增产物质量还有扩增效率

盐边县17776849810: 论述RT - PCR检测基因表达的实验步骤及如何判断并消除DNA污染所造成的影响. -
习冒替诺: RT-PCR实验,主要分为3步: 1. total RNA的提取 2. mRNA的反转录 3. 荧光定量PCR 消除DNA污染: 1. 按照说明书加入足量的Trizol,细胞过多会引起DNA污染. 2. 现在已经有去除基因组污染的反转录试剂盒,已经在很多实验室常用.你可以尝试一下.

盐边县17776849810: pcr技术扩增 -
习冒替诺: PCR(聚合酶链式反应)是利用DNA在体外摄氏95度时解旋,55度时引物与单链按碱基互补配对的原则结合,再调温度至72度左右DNA聚合酶沿着磷酸到五碳糖(5'-3')的方向合成互补链.由PCR技术制造的PCR仪实际就是一个温控设备,能...

盐边县17776849810: RT - PCR数据分析 -
习冒替诺: 需要样本间平行比较.目的基因/GAPDH比值越大,说明目的基因表达量越高.比如1号样本目的基因/GAPDH比值等于0.5;2号样本目的基因/GAPDH比值等于0.8;那就说明2号样本中目的基因的表达量比1号样本高.

盐边县17776849810: RT - PCR融解曲线详解 -
习冒替诺: 融解曲线是荧光定量PCR仪出现后为了考察染料法结果的特异性产生的.大家使用荧光定量PCR的目的(也是荧光定量PCR的宣称优点)有快速、准确及无污染,其中快速的前提之一是不用跑电泳就可以通过扩增曲线考察初始拷贝数的量;准...

本站内容来自于网友发表,不代表本站立场,仅表示其个人看法,不对其真实性、正确性、有效性作任何的担保
相关事宜请发邮件给我们
© 星空见康网