实时荧光定量PCR的结果该怎样分析?

作者&投稿:彭彩 (若有异议请与网页底部的电邮联系)
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1、如果有标准曲线,按照标准曲线计算;

2、一般都是相对量,则用deltadeltaCT方法来计算;

3、引物或探针降解:可通过PAGE电泳检测其完整性;

4、模板量不足:对未知浓度的样品应从系列稀释样本的最高浓度做起;

5、看CT值是分析荧光定量PCR最直观的一个数据,CT值一般在35左右就失去参考价值了,平时我们实验室用BIODAI-PCR荧光定量法测得的扩增曲线的起跳值基本在30左右。

扩展资料:

PVR的循环参数:

1、预变性;

模板DNA完全变性与PCR酶的完全激活对PCR能否成功至关重要,加热时间参考试剂说明书。

2、变性步骤;

循环中一般95℃,30秒足以使各种靶DNA序列完全变性,可能的情况下可缩短该步骤时间。变性时间过长损害酶活性,过短靶序列变性不彻底,易造成扩增失败。

3、引物退火;

退火温度需要从多方面去决定,一般根据引物的Tm值为参考,根据扩增的长度适当下调作为退火温度。然后在此次实验基础上做出预估。退火温度对PCR的特异性有较大影响。

4、引物延伸;

引物延伸一般在72℃进行(Taq酶最适温度)。但在扩增长度较短且退火温度较高时,本步骤可省略延伸时间随扩增片段长短而定,一般推荐在1000bp以上,含Pfu及其衍生物的衍生设定为1min/kbp。

5、循环数;

大多数PCR含25-35循环,过多易产生非特异扩增。

6、最后延伸;

在最后一个循环后,反应在72℃维持10-30分钟.使引物延伸完全,并使单链产物退火成双链。

参考资料来源:百度百科—实时荧光定量PCR




定量pcr中的ΔRn值指的是什么啊?
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月石肿节: 1、如果有标准曲线,按照标准曲线计算; 2、一般都是相对量,则用delta delta CT方法来计算; 3、引物或探针降解:可通过PAGE电泳检测其完整性; 4、模板量不足:对未知浓度的样品应从系列稀释样本的最高浓度做起; 5、看CT值是分析...

连州市15646973134: 实时定量PCR的结果分析 -
月石肿节: Sybergreen可以和所有核酸结合,没有特异性.所以要保证特异性的话,最好用其他的方法.扩增体系中加入模板DNA的体积,比如同时10微升的体系,对照组加1微升DNA,实验组加2微升DNA,则实验组的加样量是对照组的2倍.看CT值是分析荧光定量PCR最直观的一个数据,CT值一般在35左右就失去参考价值了,平时我们实验室用BIODAI-PCR荧光定量法测得的扩增曲线的起跳值基本在30左右

连州市15646973134: 如何分析荧光定量pcr实验结果? -
月石肿节: 如果是realtime做表达量,用excel的制图,将每个个体的Ct值平均数做出柱状图就可以了.如果你还做了标曲的话,就用制图中的散点图看R2值.其实这些功能做定量PCR的时候电脑程序应该会自动分析才对.具体情况具体分析.

连州市15646973134: 实时定量PCR的结果是怎样分析的?
月石肿节: PCR是聚合酶链式反应,通过反复的变性退火延伸,达到将微量DNA扩增检测的目的.目前实验室里多采用的是实时荧光定量检测,一起可以读取每次循环的荧光强度,并记录达到设定的阈值的循环次数.原始标本含有的DNA量愈多,达到阈值循环数愈小.通过已知浓度的标准品为对照,定量分析样本所含的目的DNA量.

连州市15646973134: 实时荧光定量pcr数据如何统计?近日做实时荧光定量pcr,得到了不同的ct值,只是计算了△△ct以及2 - △△ ct的值,但是我不知道如何使用spss进行统计分... -
月石肿节:[答案] 首先你这样做出来的统计没有意义. 应该是至少3次独立实验,而不是重复3次PCR. 如果3次试验,每次重复3次(取平均值算一次).然后先定各个基因在对照组的值为一,再算出其他组该基因的相对量,比如内参CT值一样(都是15),而TNF的...

连州市15646973134: 荧光定量PCR仪ABI7500数据怎么分析做完荧光定量,出来的数据项自己作图,但是横纵坐标和误差值都选哪些呢?不懂. -
月石肿节:[答案] 做绝对定量的话横坐标是初始模版的拷贝数,纵坐标是CT值

连州市15646973134: 实时荧光定量PCR的结果该怎样分析?为什么最好不用Syber Green? -
月石肿节:[答案] 如果有标准曲线,按照标准曲线计算.一般都是相对量.则用delta delta CT方法来计算.举例如下:对照组基因A的CT值为20,内参(比如βactin)CT值15.实验组基因A CT值18,内参CT值14.首先算加样量:delta CT=15-14=1.2的1次...

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月石肿节: 荧光定量我用罗氏的反应速度算是相当快的,在样本处理(提出核酸)后,放在荧光定量PCR仪器上一般需要30分钟~1小时左右.但是如果你的样本比如支原体的含量非常高,可能在没有运行结束已经可以看出结果了,但是如果说5分钟就出结果了,确实太快了点.如果是realtime做表达量,用excel的制图,将每个个体的Ct值平均数做出柱状图就可以了.如果你还做了标曲的话,就用制图中的散点图看R2值. 其实这些功能做定量PCR的时候电脑程序应该会自动分析才对. 具体情况具体分析.

连州市15646973134: 实时荧光定量pcr数据如何统计? -
月石肿节: 首先你这样做出来的统计没有意义. 应该是至少3次独立实验,而不是重复3次PCR. 如果3次试验,每次重复3次(取平均值算一次).然后先定各个基因在对照组的值为一,再算出其他组该基因的相对量,比如内参CT值一样(都是15),而...

连州市15646973134: 实时荧光绝对定量PCR实验数据分析哪个指标啊? -
月石肿节: ct,是从基线到指数增长的拐点所对应的循环次数,仪器中给出的ct就是你每个孔实际的ct值 ct mean,是你相同样品的几个重复的CT值得平均值 如果是做的相对定量,用CTmean的结果就可以了,计算方法就是R=2-ΔΔCt,现在很多仪器你只要设置的时候明确标出内参基因和目的基因,这个结果也是会有自带软件给计算出来的.如果你是做绝对定量,那更方便,你只要在仪器设置的时候把你的标准品含量依次输入,最后软件会自动生成标准曲线什么的,你最后只要分析og sq的结果就可以了.

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