分子进化与系统发育的目录
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第一章 进化的分子基础.
1．1 生命的进化树
1．2 进化机制
1．3 基因的结构与功能
1．4 DNA序列的突变
1．5 密码子使用频率
第二章 氨基酸序列的进化演变
2．1 氨基酸差异和不同氨基酸的比例
2．2 泊松校正(PC)和厂距离
2．3 自展法的方差和协方差
2．4 氨基酸的替代矩阵
2．5 突变率和替代率
第三章 DNA序列的进化演变
3．1 两个序列间的核苷酸差异
3．2 核苷酸替代数的估计
3．3 厂距离
3．4 进化距离的数值估计
3．5 核苷酸序列的对位排列
3．6 进化距离估计中有关序列间隔的处理
第四章 同义与非同义的核苷酸替代
.4．1 进化通径方法
4．2 基于Kimura双参数模型的方法
4．3 密码子3个不同位置的核苷酸替代
4．4 用于密码子替代模型的似然法
第五章 系统发育树
5．1 系统发育树的种类
5．2 拓扑差异
5．3 构树方法
第六章 系统发育推断：距离法
6．1 UPGMA
6．2 最小二乘(LS)法
6．3 最小进化(ME)法
6．4 邻接(NJ)法
6．5 用于系统发育重建的距离测度
第七章 系统发育推断：最大简约法
7．1 寻找最大简约(MP)系统树
7．2 MP树的搜索策略
7．3 一致树
7．4 分支长度的估计
7．5 力口权简约法
7．6 用于蛋白质数据的MP法
7．7 共享的遗传特征
第八章 系统发育推断：最大似然法..
8．1 ML法的计算过程
8．2 核苷酸替代模型
8．3 蛋白质似然法
0．4 ML方法的理论基础
8．5 给定拓扑结构的参数估计
第九章 系统树的精确性和统计检验
9．1 最优原理和拓扑结构误差
9．2 内部分支检验
9．3 自展检验
9．4 拓扑结构差异的检验
9．5 不同树树方法的优缺点
第十章 分子钟与线性树
10．1 分子钟假说
10．2 相对速率检验
10．3 系统发育检验
10．4 线性构
第十一章 祖先核苷酸与氨基酸序列
11．1 祖先序列推断：简约法
11．2 祖先序列推断：贝叶斯方法
11．3 祖先分支中的同义与非同义替代
11．4 趋伺进化和平行进化
第十二章 遗传多态性和进化
12．1 遗传多态性的进化意义
12．2 等位基因频率数据的分析
12．3 再分群体中的遗传变异
12．4 多个基因座位的遗传变异
12．5 DNA多态性
12．6 检测自然选择的统计检验
第十三章 用遗传标记构建群体树
13．1 等位基因频率数据的遗传距离
13．2 限制性酶的DNA序列分析
13．3 RAPD数据分析
第十四章 展望
14．1 统计方法
14．2 基因组计划
14．3 分子生物学与进化
参考文献
附录...
举例说明个体发育与系统发育的关系。
说明了蛙的个体发育重演了其祖先的进化过程，也就是个体发育简单而迅速的重演了它的系统发展，及其种族发展史。
胚前发育的个体发育与系统发育
个体发育中变异的发生、保留和淘汰，影响着系统发育；所以系统发育是一个经常有新东西产生、有旧东西淘汰的进化过程。由于物种的变异是一代代积累起来的，因此不同物种的胚胎愈是早期愈为相似。也就是愈是普遍性的特点在胚胎发育中出现愈早。愈是高等的生物，胚胎发育的经历愈长，它们所特有的特点在胚胎...
个体发育与系统发育间存在相似性吗?
人类胚胎发育的一些现象也表明了个体发育与系统发育间存在明显的相似性：第21天颈部体节出现，耳基板形成，第一鳃裂出现，咽肠下面形成两个心脏管。胚胎接近种系特征性发育阶段。第23天胚循环形成，胚体似乎要发育成一条“鱼”。脑部由几个脑叶（脑室收缩形成）组成，其中，最大的是最后部的菱脑，其次...
地球上,哺乳动物是如何进化出生殖系统的?
而这就是哺乳动物的进化方向，在这过程中，乳动物也由泄殖腔进化出来了单独的生殖系统，也就是对泄殖腔包含的功能进行了分工。也就是生殖与排泄两种功能和消化后沉渣的排出功能进行了分离，于是在生理结构上采用了消化系统单独一个排出口，也就是我们说的肛门；排泄系统的尿道和生殖孔道共用一个排出口，但...
分子进化与系统发育
1.5 密码子的使用频率：原因：1、tRNA丰度不同导致的（高表达）2、突变压。如不同基因组中GC含量不同，同时也影响了密码子的使用。突变压和净化选择共同影响了密码子的偏好性。不同的物种，碱基替换模式是不同的，主要体现在GC含量的不同，这给系统发育研究带来了困难。动植物中，GC含量变化范围很...
系统进化和系统发育是不是指同一个概念?
不是，系统进化是以突变为基础进行的不可预见的发展过程，而系统发育是按照遗传基因的确定程序可预见的发展过程
分子进化与系统发育的目录
用于密码子替代模型的似然法第五章 系统发育树5．1 系统发育树的种类5．2 拓扑差异5．3 构树方法第六章 系统发育推断：距离法6．1 UPGMA6．2 最小二乘(LS)法6．3 最小进化(ME)法6．4 邻接(NJ)法6．5 用于系统发育重建的距离测度第七章 系统发育推断：最大简约法7．1 寻找最大简约(MP)...
如何从基因系统发育树关系看待物种的进化历程
1.系统发育（Phylogeny）：是指一群有机体发生或进化的历史 2.系统发育树(Phylogenetic tree):就是描述这一群有机体发生或进化顺序的拓朴结构，根据系统发育树的具体表达形式,可分为基因树、物种树 3.基因树(Gene tree):当一个分子系统树是根据某一个基因数据构建而来的,称为基因树4.物种树(Species t...
什么是个体发育和系统发育?
个体发育与系统发育，是推动生物进化的两种不可分割的过程，系统发育是建立在个体发育的基础上，而个体发育又是系统发育的环节。个体发育可反映系统发育过程的某些特性，如有些高等植物，甚至一些裸子植物个体中精子具有鞭毛，反映了系统发育中经历了水生和有鞭毛细胞的阶段。一方面，个体发育由系统发育所决定，...
生物名词解释:系统发育
系统发育（phylogeny）是与个体发育相对而言的，它是指某一个类群的形成和发展过程。大类群有大类群的发展史，小类群有小类群的发展史，从大的方面看，如果研究整个植(动)物界的发生与发展，便称之为植(动)物界的系统发育
戢侍固元： 不是,系统进化是以突变为基础进行的不可预见的发展过程,而系统发育是按照遗传基因的确定程序可预见的发展过程
资溪县15529954884： 高中生物的目录 - ？
戢侍固元： 必修一:分子与细胞 第一章:走进细胞 第一节:从生物圈到细胞 ; 第二节 细胞的多样性和统一性; 第二章:组成细胞的分子 第一节 细胞中的元素和化合物; 第二节 细胞活动的主要承担者; 第三节 遗传信息的携带者 第四节 细胞中的糖类和...
资溪县15529954884： 推荐一本介绍生物谱系树(系统树、进化树)的书,打算用来做参考文献,急急急 - ？
戢侍固元： 图书信息中文名: 分子进化与系统发育 原名: Molecular Evolution and Phylogenetics 作者: Masatoshi Nei, Sudhir Kumar 这本书有中译本,还是不错的
资溪县15529954884： 如何构建系统发育树 - ？
戢侍固元： 原发布者:sunny双子510系统发育树民大生科内容提要一.系统发育树的介绍二.系统发育树的构建方法及原理三.系统发育树的构建软件一.系统发育树的介绍1.系统发育树的定义:在研究生物进化和系统分类中,常用一种类似树状分支的图形来...
资溪县15529954884： 生物进化论的要点:(1): (2): (3) : (4): (5): 求高手解答! - ？
戢侍固元： 生物进化论的要点:(1)生物都有遗传和变异: (2)生物体能适应一定的环境,也能影响环境: (3) 生物体都有生长发育和生殖的现象: (4)地理隔离产生新物种: (5)物竞天择,适者生存:
资溪县15529954884： 什么是生物进化论学说 - ？
戢侍固元： 其中心是物竞天择,适者生存 生物进化论,简称进化论,是生物学最基本的理论之一.进化(Evolution),是指生物在变异、遗传与自然选择作用下的演变发展,物种淘汰和物种产生过程.地球上原来无生命,大约在30多亿年前,在一定的条件下,形成了原始生命,其后,生物不断的进化,直至今天世界上存在着170多万个物种.生物进化论最早是由查尔斯·罗伯特·达尔文提出的,其在著《物种起源》时有详细的论述.进化论有三大经典证据:比较解剖学、古生物学和胚胎发育重演律
资溪县15529954884： 生物进化论? - ？
戢侍固元： 物竞天择,适者生存.生物进化论,简称进化论,是生物学最基本的理论之一.进化(Evolution),是指生物在变异、遗传与自然选择作用下的演变发展,物种淘汰和物种产生过程.地球上原来无生命,大约在30多亿年前,在一定的条件下,形...
资溪县15529954884： 什么样的基因适宜物种进化的系统发育关系分析? - ？
戢侍固元： 从物种的一些分子特征出发,了解物种之间的生物系统发生的关系,通过核酸蛋白序列的同源性比较进而了解基因的进化以及生物细统发生的内在规模律. 同源性是指从一些数据中推断出发的两个基因或蛋白质序列具有共同先祖的结论,属于质...
资溪县15529954884： 某种生物的系统发育与进化是指什么? - ？
戢侍固元： 系统发育与进化是指孤立生物所具有的某一个单一的器官或系统,研究其进化过程的方法.多用与解剖学上确定亲缘关系和进化程度.ps.你要写哪方面的论文啊?就是系统进化的?
资溪县15529954884： 构建进化树如何选择参比序列?构建进化树如何选择参比序列,可信度太 ？
戢侍固元： 序列比对建议用ClustalX 建NJ或MP树,用MEGA就可以了,非常方便 若要建ML树推... 作者推荐读者可参考由Masatoshi Nei与Sudhir Kumar所撰写的《分子进化与系统发育...
