什么是简并引物？谢谢！
在实际应用中，研究人员会参考各种生物的密码子使用表，这有助于他们设计出更精准的简并引物，确保它们能有效地与目标序列配对，而不会被其他非目标序列混淆。简并引物的使用极大地提高了实验的效率和准确性，使得在遗传学和分子生物学研究中，科学家们能够更准确地解析和操纵遗传信息。
什么是引物
引物（primer），是一小段单链DNA或RNA，作为DNA复制的起始点，在核酸合成反应时，作为每个多核苷酸链进行延伸的出发点而起作用的多核苷酸链，在引物的3′-OH上，核苷酸以二酯链形式进行合成，因此引物的3′-OH，必须是游离的。
为什么PCR产物总在2000bp以上
简并引物是指多种引物的混合物，不止一种，可能是因为引物的原因，你的引物中没有刚好表达你设计的产物的。
求常用的植物actin基因序列或引物,山茶科的更好(查了文献没查到),文献...
植物大麦、玉米等actin 714bp F 5'-CTCGACTCTGGTGATGGTGTG-3’R 5'-TCGTACTCCGCCTTGGAGAT-3’括号是简并引物的意思，即合成引物时，该位置会随机添加其中一个：5‘-CAGATGGC（GT）GA（CT）GGTGAAGA（TC）AT-3’的一个可能是：5‘-CAGATGGC G GA C GGTGAAGA T AT-3’自己排列组合一下就...
如何设计简并引物?
揭示简并引物设计的艺术：精准构建分子桥梁 在生物学研究中，简并引物作为一种强大的工具，引领着从蛋白质到核酸序列的桥梁构建。它们不仅用于特定蛋白的研究，还助力于大规模分子扩增，确保了实验的高效性和准确性。下面，我们将深入探讨如何巧妙设计出这些关键的分子引路者。设计策略 首先，从NCBI的海洋中...
什么是简并pcr
简并PCR是根据目的蛋白的氨基酸序列推测DNA序列，由于氨基酸密码子具有简并性，即一个氨基酸可能有多个密码子，所以在设计引物时要考虑所有可能的情况，合成混合的简并引物。利用简并引物进行PCR，可扩增目的蛋白的基因序列。
如何设计引物
例如，丙氨酸的密码子GCU、GCC、GCA和GCG，生物学上为了简洁，使用字母"N"来代表UCAG这四个碱基。因此，当根据蛋白质序列设计DNA克隆的引物时，会利用这种兼并性。在引物序列中，特定的碱基可能会被简并碱基（如N）代替，以反映密码子的多样性。这种设计方法意味着，一个简并引物实际上是一组不同引物...
特殊引物的合成、分析验证
搜索一下“简并碱基”，都有单字符替换的，用那个标准的就可以了
什么是简并性
在量子力学中，状态和能级这两个术语有着不同的含义。状态是用波函数表示的，每个不同的波函数就是一个不同的状态。能级是用给定的能量数值表示的，每个不同的能量值就是一个不同的能级。若一个能级与一种以上的状态相对应，则称之为简并能级，属于同一能级的不同状态的数目称为该能级的简并度。...
能不能指点一下简并引物怎么设计
⑨ 引物3′端不可修饰。引物的延伸是从3′端开始的，不能进行任何修饰。3′端也不能有形成任何二级结构可能，除在特殊的PCR（AS-PCR）反应中，引物3′端不能发生错配。⑩ 引物3′端要避开密码子的第3位。如扩增编码区域，引物3′端不要终止于密码子的第3位，因密码子的第3位易发生简并，会...
实时荧光Taqman 探针设计的几个要点
在合成引物时,在合成到此位点时,就不是加入一个碱基,而是同时加入简并子所代表的多个碱基。这样,实质合成的引物是多条引物,只不过是在简并子位置碱基不同而已。但简并引物要考虑每条引物的Tm值,确保简并子所代表的不同碱基的不同引物Tm值相差不超过2℃。若超过2℃,在确保引物的3’端引物相同时,在Tm值较低...
关瑾帮君： 简并引物是指代表编码单个氨基酸所有不同碱基可能性的不同序列的混合物.为了增加特异性,可以参考密码子使用表,根据不同生物的碱基使用偏好,减少简并性.
新余市13762233589： 简并引物是什么?设计的原则或原理是什么?在线等,急!!!？
关瑾帮君： http://baike.baidu.com/view/3796392.htm?fromTaglist 中文名称: 简并引物 英文名称: degenerate primer 定义: 获得序列未完全清楚的核酸的一种引物设计方案,特点是所设计的引物序列某位置的核苷酸可以分别是两个或两个以上不同的碱基,结果所合成的引物是该位置上不同序列的混合物. 应用学科: 生物化学与分子生物学(一级学科);方法与技术(二级学科)
新余市13762233589： 简并引物 设计软件 - ？
关瑾帮君： 简并引物设计的方法简并引物是指用来编码一段短肽序列的不同碱基序列的混合物.主要用来同源克隆未知的基因,或用来分析某一种基因多态性的一种方法.简并引物设计的常见程序如下:1. 利用N...
新余市13762233589： 什么叫简并序列 - ？
关瑾帮君： 分子生物学中,同一种氨基酸具有两个或更多个密码子的现象称为密码子的简并性(degeneracy).这样的序列就叫简并序列
新余市13762233589： 什么是基因文库? - ？
关瑾帮君： 首先理清基因文库的概念 他可不是基因库.“基因文库一个生物体的基因组DNA用限制性内切酶部分酶切后,将酶切片段插入到载体DNA分子中,所有这些插入了基因组DNA片段的载体分子的集合体,将包含这个生物体的整个基因组,也就是...
新余市13762233589： 能不能指点一下简并引物怎么设计 - ？
关瑾帮君： ① 引物应在核酸系列保守区内设计并具有特异性. 引物与非特异扩增序列的同源性不要超过70%或有连续8个互补碱基同源.② 产物不能形成二级结构. 某些引物无效的主要原因是引物重复区DNA二级结构的影响,选择扩增片段时最好避开二...
新余市13762233589： 设计引物的时候,我比对氨基酸序列,由于保守性很高,老师让我用核苷酸序列比对. - ？
关瑾帮君： 要设计简并引物是么? 最好还是使用CDS序列来做比对,然后根据保守区设计简并引物,CDS两端的非翻译区在物种间变化太大,不适合设计引物. 把获得各个物种的CDS做成fasta格式的,序列最好处理成纯序列格式的不含其它任何字符.然后用比对软件比对一下,如mega,DNAman或者是vector NTI里的比对工具都可以做比对. 在比对结果里找到非常保守的区域就可以设计简并引物了. 设计的简并引物可以根据经验公式自个算Tm值.不用计较打分的问题.因为你只能在保守区设计引物. 图是做的DNA序列比对,有保守区和不保守区.我觉得,引物的3'端最好位于最保守的区域.
新余市13762233589： 简并引物PCR是根据蛋白质的氨基酸序列设计一组混合引物来合成相...？
关瑾帮君： 对PCR产物测序需要怎么准备样品 把目的片段连接到T载体上,然后转化到感受态细胞中培养,鉴定阳性菌落,培养转化好菌落,将提取质粒再做一下鉴定(酶切或PCR).把阳性的质粒或菌液寄给测序公司就ok了.
新余市13762233589： 简并引物 特异引物 还有16s的引物有什么不同 用它们PCR出来的产物 看条带能看出来吗 - ？
关瑾帮君：[答案] 1、简并引物 :序列未完全清楚的核酸的一种引物设计方案,比如TGGC(x)AAT,则设计引物时(X)位置可分别用ATCG四条引物 特异引物 :这个不用说吧,就是序列清楚后自己根据上下要设计的普通引物 16s的引物:常被用于鉴定,一般引物可...
