手把手系列教程||使用EEGLAB2023版对脑电数据进行预处理

作者&投稿:始皆 (若有异议请与网页底部的电邮联系)
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手把手指导:EEGLAB 2023版脑电数据预处理实战


在探索神经科学的奇妙世界中,EEGLAB 2023版为我们提供了一套强大的工具。首先,确保你的计算环境已准备就绪:安装最新版本的Matlab(R2019a以上),并下载官方发布的EEGLAB 2023,或者通过公众号获取包含插件的资源。别忘了添加loadcurry插件,只需在File > Manage EEGLAB extensions中轻松完成。


接下来,我们以一个静息态EEG数据为例,1000Hz采样,可从公众号获取。使用loadcurry插件导入Neuroscan curry8格式的数据,如数据文件名sub1.cdt,记得设置KeepTriggerChannel为True,CurryLocations选择False。


预处理步骤


首先,对数据进行基本的处理:使用Tools > Change sampling rate功能,将数据降采样至500Hz,代码示例如下:


EEG = pop_resample(EEG, 500);

对于批量处理,记得编写脚本以节省时间,特别是当数据量大的时候。接着,对数据进行滤波:



  • 带通滤波:1-80Hz,使用Tools->Filter the data->Basic FIR filter,输入这两个频率值,确保滤波设置正确。

  • 陷波滤波:针对50Hz干扰,再次使用Filter the data,选择Notch滤波,清除50Hz的噪声。


接下来,根据需要剔除无关电极,如M1和M2,通过Edit->Select data,选择并删除这些不需要的电极,代码如下:


EEG = pop_select( EEG, 'rmchannel',{'M1', 'M2'});

在数据预处理的过程中,检查和处理坏导坏段至关重要。通过Plot->Channel data,调整时间范围和电极显示,发现并标记不良数据段,然后使用相应工具进行删除。


去伪迹与ICA应用


ICA(独立成分分析)是去伪迹的关键步骤。使用pop_runica工具运行ICA,注意识别眼动伪迹,如水平和垂直眼动。数据质量会影响伪迹提取的准确性,通过贝叶斯理论或经验判断,谨慎处理ICA成分。对于大量成分,推荐使用ICLabel插件,其能自动识别高达98%的眼动伪迹,并允许用户自定义阈值进行标记。


设置ICA阈值:从50%到90%不等,根据研究需求调整。部分不完全分离的ICA可能会导致脑信号损失,所以在分析时需留意。


完成ICA去伪迹后,可以对数据进行重参考,如全脑平均,代码如下:


EEG = pop_reref(EEG, []);

对于多被试数据,虽然预处理流程看起来复杂,但大部分步骤可以自动化。建议为每个阶段创建文件夹结构,如降采样、ICA处理、伪迹去除和重参考等,便于后期追踪和修改。


最后,确保你的数据清晰明了,按照以下步骤操作:



  1. 将cdt文件转换为set文件,500Hz采样,移除无用电极,存入 "_step1" 文件夹。

  2. 在_eeglab中检查和处理坏导、坏段,存入 "_preica" 文件夹。

  3. 从 "_preica" 文件夹读取set文件,运行ICA,结果存入 "_ica" 文件夹。

  4. 使用ICLabel处理并保存处理后的数据,自定义阈值去除伪迹。


在每一步操作后,都要检查数据状态,确保正确无误。记得用pop_subcomp(EEG, [], 0)进行伪迹去除,pop_reref(EEG, [])执行全脑重参考,eeg_checkset(EEG)检查数据,最后用pop_saveset(EEG)保存处理结果。至于获取教程数据,只需输入"EEG预处理数据"即可。


至此,预处理工作已经完成,你已经掌握了EEGLAB 2023版的基本操作。期待你在神经科学探索的道路上取得丰硕的成果。


Part4 感谢


感谢你跟随我们的EEGLAB 2023预处理教程,如果你发现任何问题或有改进的建议,欢迎随时指正。祝你科研之路顺利!




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