解释CDS、cDNA、EST、mRNA、ORF间的区别？
cDNA反转录DNA
是由RNA反转录得到的,结构上少了内含子,可以用来建立DNA 文库等
EST (Expressed Sequence Tag)表达序列标签 EST (Expressed Sequence Tag)表达序列标签—是从一个随机选择的cDNA 克隆，进行5’端和3’端单一次测序挑选出来获得的短的cDNA 部分序列,代表一个完整基因的一小部分,在数据库中其长度一般从20 到7000bp 不等,平均长度为360 ±120bp 。由于cDNA文库的复杂性和测序的随机性，有时多个EST代表同一基因或基因组，将其归类形成EST簇(EST clusteF)
CDS是Coding sequence的缩写，是编码一段蛋白产物的序列，是结构基因组学术语。
CDS是Coding sequence的缩写,是编码一段蛋白产物的序列,是结构基因组学术语
ORF开放阅读框是基因序列的一部分,包含一段可以编码蛋白的碱基序列,不能被终止子打断.当一个新基因被识别,其DNA序列被解读,人们仍旧无法搞清相应的蛋白序列是什么
CDS与开放读码框ORF的区别
（1）开放读码框是从一个起始密码子开始到一个终止密码子结束的一段序列；不是所有读码框都能被表达出蛋白产物,或者能表达出占有优势或者能产生生物学功能的蛋白.
（2） CDS,是编码一段蛋白产物的序列.
（3） cds必定是一个orf.但也可能包括很多orf.
（4）反之,每个orf不一定都是cds.
（5）Open reading frame (ORF) - a reading frame that does not contain a nucleotide triplet which stops translation before formation of a complete polypeptide.
Coding sequence (CDS) - The portion of DNA that codes for transcription of messenger RNA
ORF-----translation,CDS----transcription
translation 是理论上的,而transcription则显然是事实存在的.
cDNA为具有与某RNA链呈互补的碱基序列的单链DNA即complementary DNA之缩写
,或此DNA链与具有与之互补的碱基序列的DNA链所形成的DNA双链
EST (Expressed Sequence Tag)表达序列标签—是从一个随机选择的cDNA 克隆,进行5’端和3’端单一次测序挑选出来获得的短的cDNA 部分序列,代表一个完整基因的一小部分,在数据库中其长度一般从20 到7000bp 不等,平均长度为360 ±120bp .由于cDNA文库的复杂性和测序的随机性,有时多个EST代表同一基因或基因组,将其归类形成EST簇(EST clusteF)
mRNA携带遗传信息,在蛋白质合成时充当模板的RNA.
CDS的英文展开是coding sequences （编码区）。
ORF是理论上的氨基酸编码区，一般是在分析DNA核酸图谱中（主要是利用电脑程序）得到的。程序会自动在DNA序列中寻找启动因子（ATG或AUG），然后按每3个核酸一组，一直延伸寻找下去，直到碰到终止因子（TAA或TAG）。程序把这个区域当成ORF区，认为理论上可以编码一组氨基酸。
但问题是，在一个整体核酸序列中寻找ATG并不靠谱。因为寻找到的ATG很可能是两个氨基酸编码片段的尾和头的混合体。比如AACGCATGCAGC.
看上面这个小序列，如果以T为中心，会有三种编码组合的可能。即
（1）ATG（T在中心）电脑程序发现的启动因子的组合
（2）CAT（T在最右侧）
（3）TGC（T在最左侧）本例中实际核酸编码的组合。
这就是ORF三种框架的来源。实际上，DNA序列可以按六种框架阅读和翻译（每条链三种，对应六种不同的三联密码子）。
所以，我们说ORF只是理论上的编码区，与真实的情景可能并不一样。
而CDS是检查cDNA后得到的编码组合序列，和实际情景比较接近。
CDS是Coding sequence的缩写，是编码一段蛋白产物的序列，是结构基因组学术语
ORF开放阅读框是基因序列的一部分，包含一段可以编码蛋白的碱基序列，不能被终止子打断。当一个新基因被识别，其DNA序列被解读，人们仍旧无法搞清相应的蛋白序列是什么
CDS与开放读码框ORF的区别
（1）开放读码框是从一个起始密码子开始到一个终止密码子结束的一段序列；不是所有读码框都能被表达出蛋白产物，或者能表达出占有优势或者能产生生物学功能的蛋白。
（2） CDS，是编码一段蛋白产物的序列。
（3） cds必定是一个orf。但也可能包括很多orf。
（4）反之，每个orf不一定都是cds。
（5）Open reading frame (ORF) - a reading frame that does not contain a nucleotide triplet which stops translation before formation of a complete polypeptide.
Coding sequence (CDS) - The portion of DNA that codes for transcription of messenger RNA
ORF-----translation, CDS----transcription
translation 是理论上的，而transcription则显然是事实存在的。
cDNA为具有与某RNA链呈互补的碱基序列的单链DNA即complementary DNA之缩写
，或此DNA链与具有与之互补的碱基序列的DNA链所形成的DNA双链
EST (Expressed Sequence Tag)表达序列标签—是从一个随机选择的cDNA 克隆，进行5’端和3’端单一次测序挑选出来获得的短的cDNA 部分序列,代表一个完整基因的一小部分,在数据库中其长度一般从20 到7000bp 不等,平均长度为360 ±120bp 。由于cDNA文库的复杂性和测序的随机性，有时多个EST代表同一基因或基因组，将其归类形成EST簇(EST clusteF)
mRNA携带遗传信息，在蛋白质合成时充当模板的RNA。
cDNA文库和部分基因文库的区别 cDNA文库就是部分基因文库吧?
cDNA文库是从mRNA反转录来的 所以只有CDS区和3’ 5‘UTR 没有内含子序列
如何设计基因cds序列的pcr引物
提取细胞总RNA然后用试剂盒反转录成cDNA，用cDNA作为模板扩增基因的CDS区，然后想要转染进细胞中。比如MYOD1基因，首先在NCBI找到它的mRNA序列，然后找到它的CDS序列，全部复制下来，在primer 5.0 中。正向引物直接从CDS的第一个核酸开始（比如18bp），反向引物从CDS最后一个核酸开始，向前选择序列（比如...
关于生物信息NCBI
1，.4是指version，版本。有时升级后有大的改变就版本升1 2， 有指明的。 写着cds的就是cds.cdna就是cdan.或是dna。等 3，cdna与cds的意思是通用的。不是说在NCBI就有特殊含义。不懂就百度或google之。4，是的。MRRAVFHRSLKIRMEDYAHGIPNNISCQYCHTQ 这个就是氨基酸序列 关于生物信息的问题 请到...
怎样在NCBI上查找基因的cDNA序列
以人的orc1基因为例，在搜索结果中选择mRNA和complete cds序列的结果都可以，如下 点击进入序列文件查看详情，以上图搜索结果18为例，点开后界面如下 向下找到cds标签 点击CDS跳出如下界面 棕色标记的序列就是cDNA序列，旁边有对应的氨基酸序列。如果搜索结果太多，可以在检索结果中按物种筛选，如下图红框。
用基因的什么序列,mRNA还是CDS,还是这
以mRNA为模板，经反转录酶催化合成DNA，则此DNA序列与mRNA互补，称为互补DNA或cDNA。提取出组织细胞的全部mRNA，在体外反转录成cDNA，与适当的载体常用噬菌体或质粒载体连接后转化受体菌，则每个细菌含有一段cDNA，并能繁殖扩增，这样包含着细胞全部mRNA信息的cDNA克隆集合称为该组织细胞的cDNA文库，基因组...
怎样在NCBI上查找基因的cDNA序列
登录NCBI后，在下拉框中选择核酸，然后输入你需要查找的基因，在显示的信息下面点击cds，就是该基因的mRNA，也就是cDNA的其中一条链
怎样利用转录组序列扩增cDNA全长?
根据基因CDS区域两端设计引物；CDS两端；是反转录加常规PCR；反转录是要用oligodT代替dNTP
用什么在线工具看基因组和cds
经反转录酶催化合成DNA以mRNA为模板，则此DNA序列与mRNA互补，所以cDNA文库具有组织细胞特异性、去除了内含子的cDNA。但对真核细胞来说，基因组含有的基因在特定的组织细胞中只有一部分表达，能够比较容易从中筛选克隆得细胞特异表达的基因，与适当的载体常用噬菌体或质粒载体连接后转化受体菌，并能繁殖扩增...
怎样得到一种基因的cDNA
度搜索NCBI gene，搜索，然后将你想查找的基因名称输入，在一长串信息中找到CDS，在接下来出现的表格中选择你要查找基因（主要是为了选择物种），然后在接下来的页面找到基因的各种亚型对应的mRNA序列编号，点一下就会在页面下方的mRNA序列上显示出CDS序列，点进去 ...
已知cds序列如何知道长度
手动计算CDS序列的长度。方法是数出CDS序列中碱基的数量，即A、T、C、G四种核苷酸的数量之和。2、使用生物信息学软件：生物信息学软件可以对DNA序列进行分析和处理，可以自动计算CDS序列的长度。常用的软件包括NCBIBlast、EMBOSS、CLCDNAWorkbench等，这些软件可以导入CDS序列文件，进行序列长度的计算。
兴匡感苏： CDS是Coding sequence的缩写,是编码一段蛋白产物的序列,是结构基因组学术语 ORF开放阅读框是基因序列的一部分,包含一段可以编码蛋白的碱基序列,不能被终止子打断.当一个新基因被识别,其DNA序列被解读,人们仍旧无法搞清...
桃源县15864401485： 解释CDS、cDNA、EST、mRNA、ORF间的区别?为什么不是所有读码框都能被表达出蛋白产物,或者能表达出占有优势或者能产生生物学功能的蛋白? - ？
兴匡感苏：[答案] CDS是Coding sequence的缩写,是编码一段蛋白产物的序列,是结构基因组学术语ORF开放阅读框是基因序列的一部分,包含一段可以编码蛋白的碱基序列,不能被终止子打断.当一个新基因被识别,其DNA序列被解读,人们仍旧无法搞...
桃源县15864401485： 生物信息学中cds是什么意思 - ？
兴匡感苏： blast n. 爆炸; 一阵(疾风等); (吹奏乐器、哨子、汽车喇叭等突然发出的) 响声; 突如其来的强劲气流; vt. 击毁,摧毁; 尖响; 裁判高声吹哨; 枯萎:使枯萎; vi. 爆炸; 吼叫; 枯萎:枯萎; 攻击:严厉批评或猛烈攻击; [例句]There is a risk that toxic chemicals might be blasted into the atmosphere. 爆炸后有毒化学物质可能会进入大气层.生物信息学中应该是枯萎的意思.
桃源县15864401485： pubmed中的CDS是指coding sequence和cDNA有什么区别吗?在Pubmed中查到mRNA的序列应该就是cDNA的序列吧,因为我没有看到U(尿嘧啶)? - ？
兴匡感苏：[答案] mRNA反转录后就是cDNA,CDS也就是orf,翻译蛋白的部分 5'utr-CDS-3'utr 就是cDNA了嘛,cDNA包含有CDS
桃源县15864401485： 关于生物信息NCBI - ？
兴匡感苏： 1,.4是指version,版本.有时升级后有大的改变就版本升12, 有指明的. 写着cds的就是cds.cdna就是cdan.或是dna.等3,cdna与cds的意思是通用的.不是说在NCBI就有特殊含义.不懂就百度或google之.4,是的.MRRAVFHRSLKIRMEDYAHGIPNNISCQYCHTQ这个就是氨基酸序列 关于生物信息的问题 请到 yunbio.com 交流.
桃源县15864401485： 分子克隆中CDS是什么意思 - ？
兴匡感苏： 是coding sequence 的意思,编码序列,基因中能翻译出氨基酸的那段序列.
桃源县15864401485： 蛋白质编码区 -- CDS的英文全称是什么 - ？
兴匡感苏： Coding Sequence
桃源县15864401485： cds的学术语 - ？
兴匡感苏： 【英文缩写】CDS 【英文全称】Sequence coding for amino acids in protein 【中文解释】蛋白质编码区 【缩写简介】Sequence coding for amino acids in protein(includes stop condon) CDS是Coding sequence的缩写,是编码一段蛋白产物的...
桃源县15864401485： EST是什么? - ？
兴匡感苏： EST一般指美国东部时间. 美国东部时间,是指西五区时间,以位于西五区的纽约、华盛顿等城市为代表.美国横跨西五区至西十区,共六个时区.每个时区对应一个标准时间
桃源县15864401485： genbank中的CDS是什么意思 - ？
兴匡感苏： CDS(Coding Sequence)特征域被认为是DNA生成蛋白质的翻译指令,利用CDS特征域构建外显子-内含子数据库(Exon-Intron Database,EID)是研究内含子起源、进化和功能的重要手段
