系统发育树为什么核酸构树支持率比蛋白构树高
在实际解答方式和对策方面，建议在构建系统发育树时，根据所研究的目的和研究对象的不同，选择合适的分子标记进行分析。如果研究对象的系统发育关系比较简单，可以选择较为保守的蛋白质序列进行构建，如果研究对象的系统发育关系比较复杂，可以选择核酸序列进行构建。
拓展说明：在构建系统发育树时，除了选择合适的分子标记外，还需要考虑到构建方法的影响。不同的构建方法会对系统发育树的拓扑结构和支持率产生不同的影响，因此需要根据具体情况选择合适的构建方法。同时，也需要注意到系统发育树的构建是一个动态的过程，随着研究对象和研究方法的不断更新，系统发育树的结构也会不断变化。
核酸构建系统发育树支持率比蛋白质构建高的原因是因为核酸具有更高的进化速率和更多的变异位点。这些变异位点能够提供更多的信息，使得系统发育树的支持率更高。
具体来说，核酸序列比蛋白质序列更容易发生点突变、插入和删除，因此在相对较短的时间内，核酸序列就能发生更多的变异。此外，核酸序列中有四种碱基，而蛋白质序列中只有20种氨基酸，因此核酸在变异时具有更多的选择余地，从而能够提供更多的信息。
在实际解答时，我们可以通过比较核酸和蛋白质序列的进化速率和变异位点数量来判断哪种构建系统发育树的方法更为可靠。此外，我们还可以使用不同的算法来构建系统发育树，以确定哪种算法在特定的情况下最为适用。
总之，核酸序列构建系统发育树的支持率比蛋白质序列高，这是由于核酸具有更高的进化速率和更多的变异位点。在实际应用中，我们需要综合考虑多种因素，并采用合适的方法来构建系统发育树。
系统发育树中核酸构树支持率比蛋白构树高的原因在于核酸序列的突变率更高，因此在较短的时间内会出现更多的不同点，这使得核酸序列更容易在不同物种之间出现差异。同时，核酸序列长短适中，可以在不同物种之间进行比较，具有更好的可比性，而蛋白质序列则受到氨基酸限制，比较难以进行比较。
为了提高构建系统发育树的准确性和可靠性，可以采用多种构建方法，如最大似然法、最大拟然法、贝叶斯推断法等。同时，将多种构建方法结合起来，进行综合分析，可以得到更加准确的系统发育树。
此外，为了提高核酸序列的比较准确性，可以采用多种比对软件，如BLAST、ClustalW、MAFFT等，通过比对将不同物种的核酸序列进行比较，找出相应的同源序列，从而得到更加准确的系统发育树。
总之，系统发育树中核酸构树支持率比蛋白构树高的原因在于核酸序列的突变率更高，同时可以采用多种构建方法和比对软件，提高系统发育树的准确性和可靠性。
系统发育树是通过比较不同生物的基因或蛋白序列的相似性来推断它们之间的亲缘关系。在构建系统发育树的过程中，可以使用核酸序列或蛋白质序列来进行比较。通常来说，核酸序列构建的系统发育树支持率比蛋白质序列构建的系统发育树支持率高的原因如下：
1. 信息量更大：相比于蛋白质序列，核酸序列包含更多的碱基，因此信息量更大。这意味着通过比较核酸序列可以更准确地推断物种之间的关系，从而提高系统发育树的支持率。
2. 基因重组较少：由于核酸序列的碱基数目更多，因此在基因重组的过程中，核酸序列的可变性相对较小。相比之下，蛋白质序列受到基因重组的影响更大，因此可能会出现较多的误差和不确定性。
3. 突变率较低：在生物进化的过程中，核酸序列的突变率通常比蛋白质序列的突变率低。这意味着核酸序列能够更好地保留物种间的相似性，从而提高系统发育树的支持率。
总之，核酸序列构建的系统发育树支持率比蛋白质序列构建的系统发育树支持率高是因为核酸序列具有更大的信息量，基因重组较少，突变率较低等原因。
首先，核酸构树的进化速度通常比蛋白构树要快，这是因为核酸的突变率比蛋白质高，同时核酸构成的序列长度相对较短。这些因素都会导致核酸构建的系统进化树的支持率相对较高。
其次，核酸构树有更多的信息位点可供分析。由于核酸将基因信息编码为四种碱基，基因序列中存在的碱基组成和排列的变化比氨基酸的差异更多，因此核酸序列的扩增比蛋白质序列更方便，更简单。由于核酸序列相对短，分子时钟假设也更准确，随机噪声对结果的影响也较小。这些因素使得核酸序列的支持率相对更高。
最后，各类分子构建系统进化树时具有不同的分辨能力，核酸和蛋白质的分别有适用的情景。例如，在较短的时间尺度内，核酸序列构建的树可能可以更准确反映群体相互作用，而在更长的时间尺度内，蛋白质序列构建的树可能更加可靠。
总之，支持率的高低不仅取决于分析方法，还取决于分析的数据本身以及它所反映的生物学背景。
系统发育树为什么核酸构树支持率比蛋白构树高
核酸构树支持率比蛋白构树高的原因是因为核酸序列变异率相对比较高，可以提供更多的突变信息用于构建系统发育树。在分子进化研究中，核酸序列变异率远高于蛋白质序列变异率，因此，核酸序列更适合用于低级别分类，如物种和属级别的系统发育分析。而蛋白质序列相对保守，适合用于高级别分类，如纲和目级别的系统发...
遗传进化 | 献给求知若渴的您
遗传进化分析，让我们深入理解物种之间的演化关系。系统发育树描绘了物种间的演化史，而分子进化理论则通过核苷酸和氨基酸序列揭示了物种间的系统发生关系。群体遗传结构揭示了遗传变异在物种或群体中的分布模式，群体结构分析有助于理解进化过程。主成分分析在群体分层、outlier筛选、亚群进化关系等方面发挥作用，...
分子进化笔记(四): MEGA5构建系统发育树
为了美观，也是为了满足发表文章的要求，需要对进化树进行树形、字体、字号的修改。点击View，选择Options。弹出窗口中，在Tree标签中可以修改枝与枝之间的距离（Taxon Separation）、枝长（BranchLength）和树宽（Tree Width），调整至美观即可。Branch标签中，可以选择勾选“Hide values lower than %”，一...
系统发育(Phylogeny)简介
现在我们来说把phylogeny等同于用分子数据建树是片面的第二点原因,那就是重建生物系统发生关系也并不等同于建二歧树。目前普遍使用的二歧树是经济适用树,是我们向现实妥协的结果,并不能完全反映真实的系统发生关系,比如杂交成种现象就没办法用二歧树表示。真实的系统发生关系更像是网状的,存在各种复杂的情况。 我们...
已知一段序列,要建立系统发育树,通过blast怎样查询相似度最高菌种的...
第一步：点击下方的 Blast 第二步：选择 nucleotide blast，即核酸比对。第三步：出现下面页面，在框框里输入你的序列，下面有选项（老鼠的，人的，其他的），根据情况自己选择一个。第四步：点击最下方的BLAT，就开始比对了。第五步：大概等几分钟后会出现一下比对结果，以及最相近的菌株。
如何构建系统发育树
无论是基于距离的系统发生树重建方法，还是基于特征的系统发生树重建方法，都不能保证一定能够得到一棵描述比对序列进化历史的真实的树。一般地，对于某个数据集，如果用一种方法能推断出正确的系统发生关系，则用其它流行的方法也能得到较好的结果。但是，如果模拟数据集中序列的变化很大，或不同的分支变化...
核marker是什么意思?
核marker广泛应用于物种识别、群体遗传学、亲缘关系分析、分类学研究等领域。在基因组学中，核marker可以用于构建系统发育树、研究基因组演化和基因家族等。常见的核marker包括ITS、rbcL、matK等。这些marker可以通过PCR扩增、高通量测序等方法进行分析，较为常用的分析软件有MEGA、PAUP*、MRBAYES等。核marker...
进化树问题
软件上都有说明的。学过生物信息学的对此应该觉得是很容易的吧（话说能用到这个的就只有和进化还有分类有关的了）。距离就是在每个核苷酸位点上，与一条序列相比，另一条序列上的核苷酸被替代的几率为多少，几率越大，则距离越大。系统发育树是基于序列之间的距离，根据某些算法来进行构建的。那个概率...
怎样找到菌的相似序列,怎样做细菌系统发育树?
如果Bootstrap的值太低,则有可能进化树的拓扑结构有错误,进化树是不可靠的。对于进化树的构建,如果对理论的了解并不深入,作者推荐使用缺省的参数。需要选择模型的时候(例如用NJ或者ML建树),对于蛋白序列使用Poisson Correction模型,对于核酸序列使用Kimura-2参数模型。另外需要做Bootstrap检验,当Bootstrap值过低时,所...
分子发育树的构建方法包括
系统发育树的构建步骤如下：1、数据准备：基因的核苷酸序列，SNP位点，蛋白的氨基酸。2、多序列比对：常用的软件包括MEGA，Clustal X，Muscle，Phylip。MEGA：是最常用的比对建树软件，优点是可视化图形界面，操作方便简单；但是比对速度慢，输出格式单一Clustal X：优点是图形界面，可输出多种格式（如phy）...
权治先奎： 比例尺是时间 数值是区别,也就是变化量
莲湖区17217606938： 怀孕三个月可以喝莲子雪耳红枣糖水吗 - ？
权治先奎： 完全可以的 比较养孕妇的身子 红枣树温性能有效的调节孕妇的生理状况 还可以缓解肚子痛
莲湖区17217606938： 如何构建系统发育树 - ？
权治先奎： 原发布者:sunny双子510系统发育树民大生科内容提要一.系统发育树的介绍二.系统发育树的构建方法及原理三.系统发育树的构建软件一.系统发育树的介绍1.系统发育树的定义:在研究生物进化和系统分类中,常用一种类似树状分支的图形来...
莲湖区17217606938： 生物进化论? - ？
权治先奎： 物竞天择,适者生存.生物进化论,简称进化论,是生物学最基本的理论之一.进化(Evolution),是指生物在变异、遗传与自然选择作用下的演变发展,物种淘汰和物种产生过程.地球上原来无生命,大约在30多亿年前,在一定的条件下,形...
莲湖区17217606938： 什么样的基因适宜物种进化的系统发育关系分析? - ？
权治先奎： 从物种的一些分子特征出发,了解物种之间的生物系统发生的关系,通过核酸蛋白序列的同源性比较进而了解基因的进化以及生物细统发生的内在规模律. 同源性是指从一些数据中推断出发的两个基因或蛋白质序列具有共同先祖的结论,属于质...
莲湖区17217606938： 建系统发育树时怎么样才能调高bootstrap值 - ？
权治先奎： 1. 准备序列文件 准备fasta格式序列文件(fasta格式:大于号>后紧跟序列名,换行后是序列.举例如下).每条序列可以单独为一个文件,也可以把所有序列放在同一文件内.核酸序列:>sequence1_name CCTGGCTCAGGATGAACGCT 氨基...
莲湖区17217606938： 什么是生物进化论学说 - ？
权治先奎： 其中心是物竞天择,适者生存 生物进化论,简称进化论,是生物学最基本的理论之一.进化(Evolution),是指生物在变异、遗传与自然选择作用下的演变发展,物种淘汰和物种产生过程.地球上原来无生命,大约在30多亿年前,在一定的条件下,形成了原始生命,其后,生物不断的进化,直至今天世界上存在着170多万个物种.生物进化论最早是由查尔斯·罗伯特·达尔文提出的,其在著《物种起源》时有详细的论述.进化论有三大经典证据:比较解剖学、古生物学和胚胎发育重演律
莲湖区17217606938： 如何从系统发育树或者CLUSTAL比对结果中看出核酸之间的差异性?急求?？
权治先奎： 我记得是寻找block,然后分析核酸序列之间的相似度为了找出序列中的Blocks,可以借助Gibbs抽样法,也就是在多重序列中找出体现序列特性的最低模型,经Gibbs抽样法或EM法等反复抽样分析,得到Blocks,则包含在Blocks的序列已经具有...
莲湖区17217606938： 怎样搭配食物才算是合理膳食呢? - ？
权治先奎： 牛奶是营养最为全面又最容易被人体吸收的食物之一,它含有提高人体免疫力的多种抗体,在人必需的各种营养素中独树一帜.日本在第二次世界大战后强制推行了多种政策,其中就有儿童每天都要喝一杯牛奶的规定.一杯牛奶强壮了一个民族...
莲湖区17217606938： 生物进化论的要点:(1): (2): (3) : (4): (5): 求高手解答! - ？
权治先奎： 生物进化论的要点:(1)生物都有遗传和变异: (2)生物体能适应一定的环境,也能影响环境: (3) 生物体都有生长发育和生殖的现象: (4)地理隔离产生新物种: (5)物竞天择,适者生存:
