16srrna引物序列

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象舒15986539996问： 什么是 16SrDNA (rRNA)序列分析 - ？
克孜勒苏柯尔克孜自治州盐酸回答： 16SrDAN是编码原核生物核糖体小亚基rRNA(16SrRNA)的基因. 长度约为1500pb,是细菌分类学研究中最常用、最有用的“分子钟”,其序列包含10个可变区(variable region)和与之相同的11个恒定区(constant region),可变区因细菌而...

象舒15986539996问： 请问16srRNA在生物体中的功能是什么?? - ？
克孜勒苏柯尔克孜自治州盐酸回答： 一句话:16S rRNA序列在进化上是保守的,通常用来鉴定细菌等原核生物,并可进行进化分析. 详细的:16s rRNA广泛存在于原核生物的细胞中,其分子长度约为1.5kb左右. 相比其他分子,16S rRNA既保证了较大的信息量(如5S rRNA太短...

象舒15986539996问： 16srRNA是什么意思 - ？
克孜勒苏柯尔克孜自治州盐酸回答：[答案] 16S rRNA所对应的 16S rDNA基因在细菌基因组中具有高度保守性;对于同一种细菌其16S rDNA基因组的同源性应大于70 %.对16S rDNA而言,如果出现3个碱基以上的差异就可以断定细菌不属于同一种属;

象舒15986539996问： 选用16SrRNA或18SrRNA作为生物进化和系统研究有何优点? - ？
克孜勒苏柯尔克孜自治州盐酸回答： 因为16srna保守程度高,也就是说在不同生物间(从真核到原核)一般都有16srna存在,而且其序列比较相似物种之间差别不大,具有比较的价值.通过其序列的相似性程度可以利用生物信息学的方法建立进化树.选择16srrna进行研究的主要原因...

象舒15986539996问： 请问细菌16SRDNA 测序,测出来的序列里面找不到引物,序列还可靠吗? - ？
克孜勒苏柯尔克孜自治州盐酸回答： 你拿到的测序结果,是从引物开始后面30-50个碱基以后开始的序列,引物序列是看不到的.这个和测序机器的性能有关.一般从引物开始的一小段序列出峰会很不稳定,有稳定峰图可以读出序列一般都是20-30个碱基之后了.你手头若是有峰图结果你看看最开始那段的峰图就知道了.如要知道你的全序列 在NCBI上blast一下就知道了.

象舒15986539996问： 为什么说16SrRNA碱基序列是鉴别微生物之间具有亲属关系的依据?？
克孜勒苏柯尔克孜自治州盐酸回答： 16SrDNA序列测定只能作为微生物之间没有亲属关系的依据.如果要证明两种微生物之间具有较近的亲缘关系,除了16srDNA相似度高之外,在生理生化,形态特征等方面的依据更为重要. 若两种微生物的16srDNA相似度较远,则基本可以确定其亲缘关系比较远. 16srDNA是一段在进化上非常保守的序列,所以可以用来测序作为鉴定依据.

象舒15986539996问： TA克隆中连接产物为什么不能直接PCR想知道16SrRNA基因全序列,为什么不能把用通用引物扩增出的产物连到T载体后直接进行PCR,而要转化到大肠中... - ？
克孜勒苏柯尔克孜自治州盐酸回答：[答案] 连接产物产量少 大肠杆菌转化后提高产量 还可以保存连接后这一步的实验结果 如果要重复 直接提质粒就行 不用再次酶切 连接

象舒15986539996问： 高通量测序16srrna基因序列用什么基因数据库比对比较好 - ？
克孜勒苏柯尔克孜自治州盐酸回答： silva最好,其次greengene(很久没更新了),rdp官网也提供数据库;还有ncbi 提供了人工矫正过的16s database.

象舒15986539996问： 为什么选择16SrRNA基因作为微生物进化的遗传标记?？
克孜勒苏柯尔克孜自治州盐酸回答： 1、16SrRNA基因每种微生物都有. 2、16SrRNA结构和功能相对保守,在进化过程中变化相对较小. 3、虽然相对保守,但在不同的微生物中,16SrRNA基因序列还是存在差异的,一般来说,16sRNA序列越接近,菌种亲缘关系越近,同源性越大;反之,16sRNA序列差异越大,同源性越小.

象舒15986539996问： 为什么16srRNA序列分析可以做为生物之间是否具有亲属关系的依据 - ？
克孜勒苏柯尔克孜自治州盐酸回答： 因为同一居群内物种的16srRNA序列较为稳定,且不同居群间个体具有一定的多态性.

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