10x+genomics建库原理
作者&投稿：巨萧 （若有异议请与网页底部的电邮联系）
徐殃13859323771问： 宏基因组学的介绍 - ？
桦南县林青回答： 宏基因组学(Metagenomics)又叫微生物环境基因组学、元基因组学.它通过直接从环境样品中提取全部微生物的DNA,构建宏基因组文库,利用基因组学的研究策略研究环境样品所包含的全部微生物的遗传组成及其群落功能.它是在微生物基因组学的基础上发展起来的一种研究微生物多样性、开发新的生理活性物质(或获得新基因)的新理念和新方法.其主要含义是: 对特定环境中全部微生物的总DNA(也称宏基因组,metagenomic)进行克隆,并通过构建宏基因组文库和筛选等手段获得新的生理活性物质;或者根据rDNA数据库设计引物,通过系统学分析获得该环境中微生物的遗传多样性和分子生态学信息.
徐殃13859323771问： 基因测序后建库还有必要性吗 - ？
桦南县林青回答： 1. 基因测序后建库还有必要性吗2. 库,不仅仅指DNA文库,还有cDNA文库.即使说DNA文库也是有必要建的,可以研究较长一段染色体DNA的多个基因功能上的关联性
徐殃13859323771问： 10x genomics单细胞转录组为什么只能获得3'端转录本信息 - ？
桦南县林青回答： 要看情况,总体的测序深度是否够高,如果某个基因或转录本的reads数目仅有1-2条,我们一般认为其确实存在,但是表达量无法准确估计.所以在下结论的时候一般以readscount;1的认为有表达,但是以FPKM;1为可信的表达量,低于该值的表达量可能是不
徐殃13859323771问： 噬菌体展示的噬菌体展示技术的局限性 - ？
桦南县林青回答： (1)在噬菌体展示过程中必须经过细菌转化、噬菌体包装,有的展示系统还要经过跨膜分泌过程,这就大大限制了所建库的容量和分子多样性.目前,常用的噬菌体展示文库中含有不同序列分子的数量一般限制在10. (2)不是所有的序列都能在噬...
徐殃13859323771问： 功能基因组学的基本研究思路与基本方法是什么?为什么说它与细胞生物学的发展密切相关? - ？
桦南县林青回答： 你的这个问题太大了,几乎是没有标准答案的.功能基因组学包含的范围太广, 转录组, 蛋白质组这些都属于功能基因组的范围.简单说研究思路就是, 找到这个基因了,------看看这个基因表达什么蛋白------这个蛋白是做什么用的-----在生物体的层面看看这个蛋白的功能,是不是与其他蛋白有协同或者拮抗作用.但是现在蛋白质组有蛋白质组独特的研究思路和方法. 药物基因组有药物基因组的侧重点和研究方法.功能基因组是从一个大的层面上来研究基因的, 因此也跟细胞生物学相关联了. 作为一个知识来讲,大概就是这点内容, 但是作为一道考题来说. 真不知道该怎么给你回答,我觉得除了你们老师, 这些做功能基因组学研究的人基本上答不出这么大的问题.
徐殃13859323771问： 微生物基因建库怎么做 - ？
桦南县林青回答： cDNA 文库的构建 1.1 cDNA 文库构建的基本原理与方法 cDNA 文库是指某生物某发育时期所转录的全部 mRNA 经反转录形成的 cDNA 片段与某种载体连接而形成的克隆的集合.经典 cDNA...
徐殃13859323771问： 怎么学好cadence allegro SPB - ？
桦南县林青回答： 可以看看教学视频,学习下基础的东西,推荐你一个视频,网页链接 主要内容:1、讲解OrCAD原理图软件的建库、绘制工程、生成网络表、疑难解答、技巧等一系列操作; 2、演示Cadence Allegro建立常见的类型焊盘、不规则焊盘、封装等; 3、详细讲解多层板涉及到的各种规则,比如物理规则、间距规则、DDR3差分对、等长、区域规则、XNET等; 4、演示从布局、布线、铺铜、出Gerber的整个系统流程、实用技巧和注意事项; 5、讲解一系列高级软件操.
徐殃13859323771问： 在用protel画原理图的时候怎么添加集成电路,比如说lm1875 - ？
桦南县林青回答： 首先要确认这颗器件已经在你的器件库里,如果没有的话需要先给它建一个库.原理图的建库比较简单,基本上就是一个方框加管脚定义,哪个脚是什么信号就行了,最后给它定义一个器件名,你就可以在画图的时候添加这颗器件了.
徐殃13859323771问： 关于基因测序的几个问题!？
桦南县林青回答： 根据一些文献的支持,先片段化,效果较好.因为这样的随机性比先合成要好. 2.加入index只是为了区分每个上机样品,便于分析.对结果没有什么目的和影响 3.如果技术试验流程没有问题的话,有的时候是因为物种本身的特殊性,诸如,杂合度过高,重复序列过高.
徐殃13859323771问： 什么是功能基因组学 - ？
桦南县林青回答： 基因组(Genome)是指一个细胞或者生物体所携带的一套完整的单倍体DNA(部分病毒是RNA)序列.基因组学(Genomics)则是指对所有基因进行基因组作图、核苷酸序列分析、基因定位和基因功能分析的一门学科.功能基因组学(...
