细菌通用引物序列
16S RDNA作为通用引物,用于细菌总DNA 提取后跑PCR,扩增出的片段是多少...
150bp 我是用你的引物blast,找到相应的匹配结果。尽管菌种不同,但是对于你的引物而言,有两组序列(JN562715.2;JQ010853.1)均显示PCR结果为150bp,所以你的片段长度很可能就是150bp
我做的是分子鉴定真菌,用的是通用引物ITS1和ITS4,pcr扩增后只有marker有...
到底有没有条带;PCR扩增的程序有没有问题,或者引物是否有问题,可以找个对照DNA试试,相同扩增条件下,是否扩出条带,如果扩不出来就用可能是引物的问题,其次是引物的退火温度,很重要,直接影响条带有无和条带亮度。ITS1和ITS4是真菌的通用引物,一般是不存在引物设计问题的。
...区引物与16SrDNA 基因序列的扩增采用细菌通用引物之间有什么区别呢...
V3区是在通用引物所扩增的序列的一部分。V3区引物的变异性相对于通用引物27F\/1492R而言更高。
请问细菌16SRDNA 测序,测出来的序列里面找不到引物,序列还可靠吗?
你拿到的测序结果,是从引物开始后面30-50个碱基以后开始的序列,引物序列是看不到的。这个和测序机器的性能有关。一般从引物开始的一小段序列出峰会很不稳定,有稳定峰图可以读出序列一般都是20-30个碱基之后了。你手头若是有峰图结果你看看最开始那段的峰图就知道了。如要知道你的全序列 在NCBI上...
菌种鉴定中用通用引物对供试菌进行16S鉴定后的一些问题.
首先要确定的是你要鉴定的供试菌是细菌还是真菌,细菌的话一般只需要做16s就可以,做真菌鉴定的话可以做18s也可以做ITS。
为什么一个菌能用真菌引物和细菌引物都能扩增出来
DNA污染。根据查询公开信息显示:细菌和真菌通用引物反应条件不一样,细菌至少1.5min去延伸,真菌1min足够了,还有要考虑循环次数,DNA污染这些都有可能增加杂带可能。
16s rRNA和16s rDNA的区别
2、16s rDNA:有多个区段保守性,根据这些保守区可以设计出细菌通用物,可以扩增出所有细菌的16SrDNA片段,并且这些引物仅对细菌是特异性的,也就是说这些引物不会与非细菌的DNA互补,而细菌的16SrDNA可变区的差异可以用来区分不同的菌。三、特性不同 1、16s rRNA:16S rRNA具有高度的保守性和特异性...
COI基因和通用引物的问题
通用引物:利用序列非常保守区域设计的引物 比如细菌16SrDNA,rep,真菌18SrDNA,ITS等 coi没找到,但是好像是和昆虫基因有关的
真菌通用引物ITS1 ITS4 条PCR的条件
94`3min, 94~30s, 55~1min, 72~2min,go to 2 30个循环,72~10min,4~0.屡试不爽,不放实验一下。
求助通用引物验证阳性克隆
做PCR都要考虑Tm值吧。M13引物一般是M13F, M13R;M13F(-47), M13R(-48)配对使用。如果做菌落PCR验证阳性克隆的话,如果只是把目的片段插入到多克隆位点处,这两对引物哪一对都可以的。如果是样品需要测序的话,由于接近引物的读出效果不好,如果克隆的位点接近CMS的两端,一般需要用M13F(-47), M13R...
兴城市白及回答:[答案] 27f-1492r 细菌16 S rDNA基因的V3区引物,通用引物F341(5'CCTACGGGAGGCAGCAG 3')和R518(5' ATTACCGCGGCTGCTGG 3') 16SrDNA 基因序列的扩增采用细菌通用引物 正向引物 5AgAgTTTgATCATggCTCAg-3 反向引物 5 -...
毅店18433212664问: 细菌16SrRNA序列全长通用引物是什么?有好多个版本,不知道哪个正确 - ?
兴城市白及回答: 如果目标细菌属于未知菌,建议先任选一个版本,如果能扩增出产物就可用,如果没有产物,再换.
毅店18433212664问: 细菌的PCR扩增为什么要使用细菌基因的16SrDNA通用引物? - ?
兴城市白及回答: 有的人喜欢在做细菌DNA的PCR扩增时,使用细菌基因的16SrDNA通用引物做PCR,主要是为了作为对照,可根据情况而定.
毅店18433212664问: 细菌16 S rDNA完整基因的通用引物?
兴城市白及回答: 27f-1492r 细菌16 S rDNA基因的V3区引物,通用引物F341(5'CCTACGGGAGGCAGCAG 3')和R518(5' ATTACCGCGGCTGCTGG 3') 16SrDNA 基因序列的扩增采用细菌通用引物 正向引物 5AgAgTTTgATCATggCTCAg-3 反向引物 5 -ggTACCTTgTTACgACTT-3
毅店18433212664问: 16s rRNA和16s rDNA的区别 - ?
兴城市白及回答: 一、指代不同 1、16s rRNA:是细菌上编码rRNA相对应的DNA序列,存在于所有细菌的基因组中. 2、16s rDNA:为核糖体的RNA的一个亚基,16SrDNA就是编码该亚基的基因. 二、功能不同 1、16s rRNA:对于核糖体蛋白的固定起到脚手...
毅店18433212664问: 芽孢杆菌16srDNA的通用引物是什么啊,急需,拜托啦! - ?
兴城市白及回答: 博凌科为-为你解答:用于16S rRNA基因扩增的细菌通用引物为K1: 5-aactgaagagtttgatcctggctc-3, K2: 5-tacggt taccttgttacgactt-3, 分别位于大肠杆菌16S rDNA 的2~25 nt 和1479~1500 nt .
毅店18433212664问: 细菌16S rDNA通用引物有哪些? - ?
兴城市白及回答: 常用一对引物:27F和1492R
毅店18433212664问: 什么叫做通用引物? 都有哪些? - ?
兴城市白及回答: 利用序列非常保守区域设计的引物 比如细菌16SrDNA,rep,真菌18SrDNA,ITS等
毅店18433212664问: 16S RDNA作为通用引物,用于细菌总DNA 提取后跑PCR,扩增出的片段是多少个bp呢? - ?
兴城市白及回答: 150bp 我是用你的引物blast,找到相应的匹配结果. 尽管菌种不同,但是对于你的引物而言,有两组序列(JN562715.2;JQ010853.1)均显示PCR结果为150bp,所以你的片段长度很可能就是150bp