基因富集
优势富集效应的示例
优势富集效应举例 举个例子：就像北大、清华是全国的名牌大学，它们的管理水平、教学水平确实不错，但是更重要的原因不在这里。由于历史的原因，它们已经形成了巨大的优势富集效应，全中国的顶尖人才都被它们拿去了，还有政策、资金等多方面的支持，每年高考，全中国各地的文、理科状元差不多都被这两所大学...
元素富集因子定义与起源
元素富集因子，又名富集因子法，是一项用于揭示大气颗粒物中元素丰度特征的关键工具。它旨在衡量这些元素在颗粒物中的集中程度，以评估它们的来源，无论是自然还是人为产生的。这一概念最早由C.E.Gordn在1974年应用于大气颗粒物的研究，其后在1975年，Duce等人在探究大西洋北部30°高空物质组成时，采用...
污染物生物富集作用指
生物在生长过程中，从周围环境中吸收并逐渐在体内积累各种有毒有害物质。造成生物富集的原因主要有，环境污染，包括工业废水、废气、废渣等排放，以及农药化肥的过量使用等，还有人为因素，如危险废物随意倾倒、排放和丢弃，以及含重金属废水的无序排放等，而污染物生物富集作用是指生物在生长过程中，从周围...
元素富集因子的判断
EF值越大，富集程度就越高。近年来人们发现仅仅根据富集因子的大小，往往对污染问题不容易作出正确的判断，因为影响富集因子的因素很多，而有人提出富集因子相对地壳物质来说大于10才可认为该元素是富集了。即当EF>10时，表明样品中该元素相对于参考物质被富集或稀释，是由人为活动造成的，当EF≈1时，则...
Enrichment Factor (EF) Analysis - [富集因子法]
富集因子法常用于大气化学中，用于对大气中金属的自然起源和人类起源进行分类。通过富集因子(EF)分析，可以确定人为因素对颗粒物中相关元素浓度的影响。基于大陆地壳上层的平均化学成份，Al 作为地壳元素，可以被用作参考元素。地壳元素含量参考中国表层土壤元素含量。（Al，Fe和Ti等都可以作为参考元素）。公式...
GO富集分析、KEGG富集分析和GSEA的区别
GO是基因本体联合会所建立的数据库，旨在提供一个标准化的语义词汇系统，用于描述基因和蛋白质功能。GO富集分析主要用于了解差异基因在生物学功能、途径或细胞定位上的富集情况。它从细胞组分、分子功能、生物过程三个角度标准化描述基因产物，并通过分析确定基因可能参与哪些生物学概念。KEGG数据库则专注于理解...
富集培养名词解释
富集培养，亦称增殖培养、加富培养。是指利用不同微生物间生命活动特点的不同，人为地提供一些特定的环境条件，使特定种（类）微生物旺盛生长，使其在数量上占优势，更利于分离出该特定微生物，并引向纯培养。富集的方法主要有三种：选择能促进富集特定种（类）目的微生物生长繁殖的培养基或培养条件；选择...
生物放大和生物富集有什么区别?
简单来说 生物放大是指在同一个食物链上，高位营养级生物体内来自环境的某些元素或难以分解的化合物的浓度，高于低位营养级生物的现象。而生物富集作用是指生物体通过对环境中某些元素或难以分解的化合物的积累，使这些物质在生物体内的浓度超过环境中浓度的现象。两者的区别从名词上已经可以看出来了:生物...
农药和有毒物质富集是怎么的一回事???
生物富集现象。大多数农药、有毒物质不容易随着代谢排出体外，会在体内聚集。假设这些农药、有毒物质分布是随机均匀的，那么富集就会体现在食物链的各层的生物上，并随着捕食关系层层向上叠加。例如这样：现在地上一片草地，地上的草每一棵都有a量的农药，现在有只兔子过来吃草，吃了100棵，那么由于农药...
有害物质的富集会造成什么后果?
但有相当一部分污染物化学性质稳定，不易分解，在复杂的生态系统中不断迁移、转化、积累和富集，这种富集作用使污染物的浓度越来越高，最终造成危害。比如，美国旧金山的休养胜地——明湖，曾因使用滴滴涕使鱼类、鸟类大批死亡。滴滴涕通过食物链以惊人的速度在生物体内富集。如果将湖水中的滴滴涕浓度当作一倍...
涞源县力平回答： 基因集富集分析 (Gene Set Enrichment Analysis, GSEA) 的基本思想是使用预定义的基因集(通常来自功能注释或先前实验的结果),将基因按照在两类样本中的差异表达程度排序,然后检验预先设定的基因集合是否在这个排序表的顶端或者底端富集.基因集合富集分析检测基因集合而不是单个基因的表达变化,因此可以包含这些细微的表达变化,预期得到更为理想的结果. GSEA分析有三个特点: 分析的基因集合而不是单个基因; 将基因与预定义的基因集进行比较; 富集分析;
资瑗19853253074问： 怎么在全基因组测序中扩展目的基因 - ？
涞源县力平回答： 是扩增把?一般叫做特定的基因的富集. 现在主要通过2种方法来富集,一种是建好DNA文库后,通过探针进行特定基因富集,另外一种就是PCR对特定区域扩增,保证扩增区域的完整性的同时保证扩增区域的均一性.PCR扩增有两种方法,1个是多重PCR,一个反应有多对引物,还有一种单个PCR然后再汇总.
资瑗19853253074问： GO 和 KEGG 的区别 - ？
涞源县力平回答： 一直都搞不清楚这两者的具体区别,只知道是将基因富集到代谢上. 前者是功能注释,即每个基因可能参与哪些pathway terms 或者 GO terms,没有阀值的. 后者是功能富集,即基因集(多个基因)可能显著的集中在哪些功能上面 例如选择P...
资瑗19853253074问： 如何通过PCR证明ChIP富集有效 - ？
涞源县力平回答： 一般要通过两方面的实验验证:首先要选择几个MARKER基因进行扩增,看扩增质量如何;其次要扩增你的目的基因,看不同重复实验中的富集效果是否一致.要综合以上两点,通过PCR判断富集的DNA纯度,浓度是否符合实验要求.
资瑗19853253074问： 基因在每个pathway中的富集程度是怎么统计的 - ？
涞源县力平回答： 富集度又称加浓度.富集铀中235U的丰度.按富集度富集铀可分成低富集(低浓)、中富集(中浓)、高富集(高浓)和超富集(超高浓)铀. 各国对富集铀的划分标准不尽相同,根据国际原子能机构 (IAEA) 规定,235U含量小于20%为低富集铀.不同富集度的富集铀用途不同,一般轻水堆的燃料富集度在5%左右,快堆(如钠冷快堆)的燃料富集度较高,为20%左右.而用于武器的富集度至少在90%以上.
资瑗19853253074问： 目的基因测序出现突变怎么解决 - ？
涞源县力平回答： 目的基因测序出现突变怎么解决 如果您的目的基因本身不存在突变,可以重新进行实验再进行测序排除自身实验造成.如果测序的基因疑问位点是单一峰图一般不会是测序存在疑问.一般PCR扩增可能造成,克隆载体也可以发生突变.其次测序准确性问题.测序准确性可以双向测序确保.
资瑗19853253074问： 如何理解基因富集分析以及富集的意思 - ？
涞源县力平回答： Thislectureintroducesthenotionofenrichmentanalysis,whereonewishestoassignbio-logicalmeaningtosomegroupofgenes.Whereasinthepasteachgeneproductwasstudiedindividuallytoassignitfunctionsandrolesinbiologicalprocesses,therenowexistto.
资瑗19853253074问： 生物论文中的fold enrichment是什么意思 - ？
涞源县力平回答： Fold Enrichment = 就是富集倍数[生物学专用词汇,表示数值单位] 例如:1.用干扰RNA质粒转染细胞,然后对转染前后的细胞标本进行了ChIP-qPCR实验,最后计算得到转染前的富集倍数[Fold enrichment] 为30,转染后的[Fold enrichment]富...
资瑗19853253074问： 如何在dna样品中,除去残留物质 - ？
涞源县力平回答： 1,宏基因组提取;提取的样品DNA必须可以代表特定环境中微生物的种类,除需严格遵循取样规则外,取样中应尽量避免对样本的干扰,缩短保存和运输的时间,使样品尽可能代表自然状态下的微生物原貌,获得高质量环境样品中的总DNA是...
资瑗19853253074问： 富集倍数Fold Enrichment的计算方法 - ？
涞源县力平回答： 在做完 GO富集 之后,我们可以得到这样的富集分析结果,在结果里可以看到有两列是GeneRatio和BgRatio. GeneRatio:是一个分数,分子是富集到这个GO条目上的gene的数目,分母是所有输入的做富集分析的gene的数目,可以是差异表...
