sgRNA是什么东西

作者&投稿:成项 (若有异议请与网页底部的电邮联系)
谁能给我讲下5SRNA是什么东西~

本文系以Fox模型为兰本而设计的一种建立5S RNA二级结构的微型计算机方法。将5S RNA分子的核苷酸顺序作为信息输入,经Z—80微型计算机处理约4分钟后,即可建立在仅考虑二级相互作用的情况下,相当于Fox模型的具有最低自由能的二级结构。 本方法获得的结果与同样以Fox模型为兰本的其它方法所得到的结果相符。本方法简便、快速和费用低廉,易于推广应用。

sgrna是single guide RNA(单导向RNA)的缩写。在CRISPR/Cas9系统中sgRNA与gRNA是一个概念。

CRISPR(Clustered regularly interspaced short palindromic repeats)是原核生物基因组内的一段重复序列,是生命进化历史上,细菌和病毒进行斗争产生的免疫武器,简单说就是病毒能把自己的基因整合到细菌,利用细菌的细胞工具为自己的基因复制服务。
细菌为了将病毒的外来入侵基因清除,进化出CRISPR-Cas9系统,利用这个系统,细菌可以不动声色地把病毒基因从自己的基因组上切除,这是细菌特有的免疫系统。

扩展知识:
功能特点:
CRISPR是生物科学领域的游戏规则改变者,这种突破性的技术通过一种名叫Cas9的特殊编程的酶发现、切除并取代DNA的特定部分。这种技术的影响极其深远,从改变老鼠皮毛的颜色到设计不传播疟疾的蚊子和抗虫害作物,再到修正镰状细胞性贫血等各类遗传疾病等等。
该技术具有非常精准、廉价、易于使用,并且非常强大的特点。
CRISPR来自微生物的免疫系统,这种工程编辑系统利用一种酶,能把一段作为引导工具的小RNA切入DNA,就能在此处切断或做其他改变。以往研究表明,通过这些介入,CRISPR能使基因组更有效地产生变化或突变,效率比TALEN(转录激活因子类感受器核酸酶)等其他基因编辑技术更高。
虽然CRISPR有许多优点,在人类癌细胞系列中,它也可能产生大量“误伤目标”,尤其是对不希望改变的基因做修改。

你好知友!
shRNA是short hairpin RNA 的缩写。翻译为“短发夹RNA”。shRNA包括两个短反向重复序列,中间由一茎环(loop)序列分隔的,组成发夹结构,由pol Ⅲ启动子控制。随后在连上5-6个T作为RNA聚合酶Ⅲ的转录终止子。在活体中输送“小干扰RNA”(siRNA)的一种办法是,将siRNA序列作为“短发夹”克隆进质粒载体中。当送入动物体内时,该发夹序列被表达出来,形成一个“双链RNA”(shRNA),并被RNAi通道处理。然而,对成年小鼠肝脏中shRNA的表达的长期效应所做的一项研究为我们敲响了警钟。该研究结果表明,很多shRNA在小鼠中表达时是有毒的。这种经常是致命的毒性似乎是由shRNA与内生微RNA之间为与Exportin-5结合所展开的竞争造成的。Exportin-5是一个参与将分子输送出细胞核的因子。人们对开发基于shRNA的疗法非常感兴趣,而此前几乎没有证据表明shRNA在活体中有很强毒性。
体内表达shRNA(短发夹RNA)的设计
shRNA
  1. 克隆到shRNA表达载体中的shRNA包括两个短反向重复序列,中间由一茎环(loop)序列分隔的,组成发夹结构,由pol Ⅲ启动子控制。随后再连上5-6个T作为RNA聚合酶Ⅲ的转录终止子。

2. 两个互补的寡核苷酸两端须带有限制性酶切位点。
3. Stratagene发现29个寡核苷酸较之原先推荐的23个寡核苷酸可以更有效地抑制目的基因。
4. 在启动子下游的酶切位点下方紧连一个C,使插入片段和启动子有一定空间间隔以确保转录的发生。
5. ShRNA目的序列的第一个碱基必须是G以确保RNA聚合酶转录。如果选择的目的序列不以G开头,必须在紧连正义链的上游加一个G。
6. shRNA插入片段中的茎环应当靠近寡核苷酸的中央。不同大小和核苷酸序列的茎环都被成功的运用过。其中包含一个独特的限制性酶切位点的茎环利于检测带有shRNA插入片段的克隆。在比较了众多不同长度和序列的茎环,5'TCAAGAG3'序列最为有效。
7.5-6个T必须放置在shRNA插入片段尾部以确保RNA聚合酶III终止转录。
8.在正义链和反义链序列上不能出现连续3个或以上的T。这可能导致shRNA转录的提前终止。

祝顺利!有问题,请追问.有帮助,望采纳.

Single guide RNA,CRISPR基因编辑中所用到的单一序列的向导RNA。可通过体外转录方式合成,以及化学合成方式获得。sgRNA的品质是影响CRISPR/Cas9系统的编辑效果成败的关键因素之一,sgRNA的纯度(即品质)不好,对编辑的效率会产生很大影响,同时也会影响细胞的活性。化学合成相较体外转录方式合成的sgRNA具有几大优势,其中最主要的优势是在化学合成过程中对sgRNA 进行不同的化学修饰。包括通过在sgRNA的3’和5’端进行甲基(M)和/或甲基硫代(MS)修饰来提高sgRNA在体内的稳定性,防止其被体内的核酸外切酶降解,从而提高编辑效率;同时可以通过包括甲基膦酸脂(MP)在内的修饰提高编辑的特异性、降低脱靶效应;除此之外,化学合成的sgRNA纯度更高,转染后细胞的活性相较体外转录的sgRNA在转染后的细胞活性更高。



sgRNA(Small Guide RNA),即称为小向导RNA,是CRISPR基因敲除、敲入系统中的重要组成部分,早先发现的guide RNA由两部分组成——tracRNA和crRNA,两部分融合表达后,即sgRNA也能很好的行使guide的功能,与cas9蛋白结合,引导cas9酶靶向基因组DNA进行剪切。

single guide RNA 单导向RNA

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siRNA和guideRNA是同一种东西么?
gRNA分子是能通过正常的碱基配对途径,或通过G—U配对方式与mRNA上的互补序列配对,编辑前的mRNA分子中删除A,由gRNA和mRNA形成了一个杂合分子,可以为插入U提供模板,这样被删除的A又重新插入杂合分子中的mRNA部分。完成后,guideRNA解离,mRNA用作翻译模板。

scramblesiRNA什么东西?涉及了哪些生物技术
gRNA分子是能通过正常的碱基配对途径,或通过G—U配对方式与mRNA上的互补序列配对,编辑前的mRNA分子中删除A,由gRNA和mRNA形成了一个杂合分子,可以为插入U提供模板,这样被删除的A又重新插入杂合分子中的mRNA部分.完成后,guideRNA解离,mRNA用作翻译模板.

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说说经典的语言,名句
4 To reform a man, you must begin with his grnadmother.--Victor Hugo 要改造一个人,你得从他的祖母开始。--维克多·雨果 5 To give up one's freedom is to give up one's qualification of being a man--Rousseau 放弃自已的自由,等于放弃自已的做人的资格。--卢梭 6 Gratitude ...

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