琼脂糖凝胶电泳实验中DNA的浓度会产生什么影响?最低能够检测到多大含量的DNA?
目前为止,对身体低毒、稳定而灵敏度不输于EB的核酸染料只有sybr green ,和 gelred
这两个的优点都是低毒性,而且稳定性很高,但是sybr green 的灵敏度不如EB,且背景荧光很强,但普通的核酸检测都能做到; gelred 是目前市场上最好的核酸染料,号称无毒,而且耐热,无背景荧光,但是加入量多容易引起拖带,当然价格也挺贵的。
除此之外,国内有些不良商贩,拿AO(丫叮橙)做EB替代品,是剧毒致癌物质,且实验效果也不如EB。
取的DNA样品和标准样是和其它组合用的,电源也是和别得组合用,首先排除试剂和仪器问题,但最后在紫外灯下我的琼脂糖上没有荧光区域(加过EB了)而另一组有,但自然光下肉眼观察可以看到和深褐色杂质分离的蓝色物质.从右往左数2~5格中加入样(第二格为标准样)这是另一组的图,可以看到荧光(用了一样的样品,一样的电源)EB肯定是足量的(胶的颜色呈浅红色,EB已经过量了)
制备琼脂糖凝胶:按照被分离DNA分子的大小,决定凝胶中琼脂糖的百分含量;一般情况下,可参考下表:琼脂糖的含量(%) 分离线状DNA分子的有效范围(Kb)
0.3 60-5
0.6 20-1
0.7 10-0.8
0.9 7-0.5
1.2 6-0.4
1.5 4-0.2
2.0 3-0.1
琼脂糖凝胶的浓度一般从0.5%到~2都可以,1%最常用,这里单位是g/100mL。
这取决于你的琼脂糖的浓度,若浓度太高,则无法将DNA跑开,起不到分离的作用。与DNA的浓度和你所用的染料也有一定的关系。
琼脂糖凝胶电泳实验中是不是迁移距离越大越好,为什么?
琼脂糖凝胶电泳的目的是区分不同长度的DNA,而不是跑得越远越好。只有清楚区分不同DNA片段就好。
琼脂糖凝胶电泳原理
但由于其孔径相比于蛋白质太大,对大多数蛋白质来说其分子筛效应微不足道,现广泛应用于核酸的研究中。琼脂糖凝胶电泳是用琼脂糖作支持介质的一种电泳方法。其分析原理与其他支持物电泳最主要区别是:它兼有“分子筛”和“电泳”的双重作用。2、核酸是两性电解质,其等电点为pH2-2.5,在常规的电泳...
为什么琼脂糖凝胶电泳旁边跑没有点样,但是跑出来荧光?
4. **其他因素:** 其他因素,比如琼脂糖凝胶的制备过程中出现的问题,可能会导致凝胶本身产生荧光信号。要确定具体原因,可以考虑排除潜在的污染源,如更换试剂、减少样品处理过程中的接触,或者在相同条件下运行空白对照试验。如果问题仍然存在,可能需要进一步调查或者尝试不同的实验条件来解决。
凝胶电泳的工作原理及应用
它的核心原理基于分子的大小和电荷差异。分子在多孔琼脂糖凝胶中移动,由于凝胶的分子筛性质,较大的分子移动较慢,而较小的分子则移动较快。电泳过程中,样品被置于离子缓冲介质中,通过两极施加的电场驱动分子迁移。电荷强度和分子尺寸是决定其迁移速度的关键因素。常用的凝胶电泳如琼脂糖凝胶电泳,使用琼...
...中常说的Marker是什么?还有Loading Dye 在实验中起到什么作用?_百 ...
loading dye 是跑琼脂糖凝胶用来染DNA的染料,它是和loading buffer按一定的比例混合而成的.有的进口试剂buffer里已经加了loading dye的,就不用加了.试剂说明书都有说明的..琼脂糖凝胶电泳marker是用来做参考的,类似于标尺的作用。marker会跑出很多条带,对应带的片段长度是一定的(不 ...
琼脂糖凝胶电泳的原理及影响因素?
琼脂糖凝胶电泳是常用的生物化学实验方法,用于分离和分析DNA、RNA或蛋白质等生物大分子。琼脂糖凝胶电泳的原理是利用凝胶孔径大小的差异来实现生物大分子的分离。琼脂糖是一种多糖类物质,可以在水中形成凝胶状的网络结构,其中孔径的大小与琼脂糖的浓度成反比。当电场施加在凝胶上时,带电的分子会向电场...
电泳实验中什么叫上样缓冲液
loading buffer 的中文名字叫上样缓冲液,6kb的缓冲液中可以显示两条带,前面的紫蓝色的条带是溴酚蓝,在0.6%、1%、1.4%和2%琼脂糖凝胶电泳中,溴酚兰的迁移率分别与1Kb、0.6Kb、0.2Kb和0.15Kb的双链线性DNA片段大致相同。后面的蓝色条带是二甲苯氰,它在1%和1.4%琼脂糖中电泳时,其迁移...
简述tbe在琼脂糖凝胶电泳中的作用
缓冲液是生物学中常使用的核酸电泳缓冲盐溶液,主要用于 DNA的琼脂糖凝胶电泳。TBE 的主要成分是Tris- 硼酸盐与EDTA,缓冲能力强,适合较长时间电泳,分辨率较高,电泳小于1kb 的片段时分离效果好。TBE 缓冲液中的硼酸成分会影响 DNA回收效率以及后续的酶反应,若要进行DNA片段的琼脂糖凝胶电泳回收实验...
阿牛有话说:Goldview,用一个剧毒代替另一个剧毒!
跑胶实验中,EB(溴化乙锭)作为常用的核酸染料,在琼脂糖凝胶电泳中用于核酸染色。虽然EB被认定为强致癌剂,对生物体健康构成威胁,但它依然在实验室中广泛使用。原因包括其低廉的价格、良好的效果以及用户群体的安全意识相对缺乏。EB的广泛使用与潜在风险形成了一种明显的对比。然而,市场上确实存在替代方...
琼脂糖凝胶电泳的原理什么
琼脂糖凝胶电泳是一种利用琼脂糖作为支持物,结合电荷效应和分子筛效应分离DNA、RNA混合物的技术。其核心原理是,DNA分子在电场中会根据电荷状态和分子大小移动。当DNA处于高于等电点的溶液中(如碱性环境)时,它会带负电,向阳极移动。分子的迁移速度取决于其相对分子量,大分子移动较慢,小分子则快,...
佟坚华佗:[答案] 这是根据的DNA的浓度决定的,你的DNA的浓度大的话,你可以少上一点,DNA的浓度小的话,你 可以多上一点,一般我们上3-5微升就可以,就能检测到了,你要是照胶需要图片的话,你可以先少上点,看看情况,再做调整.
梅列区13381804022: 在琼脂糖凝胶电泳过程中,如何选择琼脂糖浓度? - ?
佟坚华佗:[答案] 琼脂糖凝胶浓度与线性DNA分离范围参数: 凝胶浓度(%) 线性DNA长度(bp) 0.5 1000~30000 0.7 800~12000 1.0 500~10000 1.2 ...
梅列区13381804022: 如何选择琼脂糖凝胶的浓度来分离DNA - ?
佟坚华佗: 总体原则是:分子量大的DNA,电泳时使用浓度较小的凝胶反之亦反.胶浓度越大,电泳速度越小;若胶浓度偏高,可能跑不动,条带缩在一起;若胶浓度过低,可能跑得太快,同样分不开.可参考下面的对应关系:凝胶浓度(%) 线性DNA长度(bp) 0.5 1000~30000 0.7 800~12000 1.0 500~10000 1.2 400~7000 1.5 200~3000 2.0 50~2000
梅列区13381804022: DNA琼脂糖凝胶电泳分析 - ?
佟坚华佗: 你好!可能是DNA提纯浓度不够,所以会出现拖尾,也有可能是配胶浓度不对,比如1.5%的gel你配成1%,也有可能是电泳时间或者电压、电流调的不对,条带还没有跑到指定位置.建议看相关文献,看别人跑相同的DNA或RNA的条件是什么,然后再根据自己的实验进行优化.
梅列区13381804022: 在做琼脂糖凝胶电泳时,如果胶的浓度不合适,会发生什么情况 - ?
佟坚华佗: 一般要根据要电泳分离的核酸的分子量大小:分子量大的核酸电泳时使用浓度较小的凝胶,分子量小的核酸电泳时使用浓度较大的凝胶.核酸在浓度越大的凝胶中电泳速度越小.如果胶浓度偏高,可能跑不动,如果胶浓度偏低,可能跑得太快,分不开.可以查到核酸分子大小与琼脂糖浓度范围的对应关系.
梅列区13381804022: 电泳时决定凝胶浓度的参数是什么 - ?
佟坚华佗: 待分离组分分子量大小. 琼脂糖浓度 一个给定大小的线状DNA分子,其迁移速度在不同浓度的琼脂糖凝胶中各不相同.DNA电泳迁移率的对数与凝胶浓度成线性关系.凝胶浓度的选择取决于DNA分子的大小.分离小于0.5kb的DNA片段所需胶浓度是1.2-1.5%,分离大于10kb的DNA分子所需胶浓度为0.3-0.7%, DNA片段大小间于两者之间则所需胶浓度为0.8-1.0%. 聚丙烯酰胺差不多. 原理: 浓度高的交联程度高,孔径小,适合分子量小的组分. 反之,交联程度低,孔径大,适合分子量大的组分.
梅列区13381804022: 琼脂糖凝胶电泳凝胶浓度是多少呢? ?
佟坚华佗: 琼脂糖凝胶电泳是用琼脂或琼脂糖作支持介质的一种电泳方法.对于分子量较大的样品,如大分子核酸、病毒等,一般可采用孔径较大的琼脂糖凝胶进行电泳分离.琼脂糖...
梅列区13381804022: 如何通过琼脂糖凝胶检测DNA(电泳的原理及影响因素)? - ?
佟坚华佗: 琼脂糖凝胶电泳是用琼脂糖作支持介质的一种电泳方法.其分析原理与其他支持物电泳的最主要区别是:它兼有“分子筛”和“电泳”的双重作用.琼脂糖凝胶具有网络结构,物质分子通过时会受到阻力,大分子物质在涌动时受到的阻力大,因此在凝胶电泳中,带电颗粒的分离不仅取决于净电荷的性质和数量,而且还取决于分子大小,这就大大提高了分辨能力.DNA分子在高于等电点的pH溶液中带负电荷,因此在电场中向正极移动. 影响因素的话,DNA的长度,结构,胶的浓度,电压等会对电泳造成影响.
梅列区13381804022: 用琼脂糖凝胶电泳怎么检测DNA质量 什么是标准 - ?
佟坚华佗:[答案] DNA如果降解或者混有其他杂质比如蛋白质、RNA的话,在电泳中可以检测的到. 线性的单一DNA样品一般是单条带,质粒的话可能会有2-3条带. 如果条带变宽、变暗、或者变成弥散的DNA条带,表示DNA非特异的降解.' 如果条带变成多条,表示...