X射线单晶体衍射仪的要求仪器
是一种大科学装置,设备大投资高,一般都需要政府投资,不是一般实验室所能具备的,需要申请立项才能使用。因此,如果能发展出高强度的实验室光源和极高灵敏度的探测器,使在一般实验室中也能测定生物大分子结构,则绝对是有益的。有许多生物反应的速度是相当快的,如血红蛋白与一氧化碳的结合,速度在纳秒级(10-9sec),要对这种反应进行动力学研究,既要有高强度脉冲光源,又要有快速切换的探测器以连续跟踪反应。现在已有了强脉冲光源,但探测器的切换速度却慢太多,需要作长时间的更大的努力。
此法用射线计数仪直接记录射线的强度。单晶衍射仪有线性衍射仪、四圆衍射仪和韦森堡衍射仪等,其中以四圆衍射仪(图4),(见彩图)最为通用。所谓四圆是指晶体和计数器藉以调节方位的四个圆,分别称为φ圆、圆、w圆和2θ圆。φ圆是安装晶体的测角头转动的圆;圆是支撑测角头的垂直圆,测角头可在此圆上运动;w圆是使圆绕垂直轴转动的圆,2θ圆与w圆共轴,计数器绕着这个轴转动。这四个圆中,w圆、φ圆和圆用于调节晶体的取向,使某一指定的晶面满足衍射条件,同时调节2θ圆,使衍射线进入计数器中。通常,四圆衍射仪配用电子计算机自动控制和记录,可以精确测定晶格参数,并将衍射点的强度数据依次自动收集,简化了实验过程,而且大大提高了数据的精确度。因此,它已成为当前晶体结构分析中强有力的工具。
回摆法的装置如图3,样品的转轴垂直于入射单色X射线,围绕转轴安装园筒状底片或在晶体后方,垂直于入射线安装平板底片。若晶体的某一晶轴(如a或b,c)与转轴平行,则在园筒状底片上会出现平行直线,平板底片则出现上下对称的双曲线。若让晶体在一个不大的角度范围(如10)内做摆动,则能产生的衍射数量不多,衍射点不会重叠。使摆动范围连续变动,一套完整的衍射数据需由一套(如几十张)摆动照片组成,其数量与晶体的对称性有关。
回摆法是一种早就发明的衍射方法,它的记录介质过去用的是照相底片,很不方便,因此用得不多。二十世纪九十年代发展出一种称为影象板(image-plate IP)的记录介质,由于其灵敏度高,记录的强度准确,且使用方便,实验时间短,获得了推广,应用到回摆法,使回摆法获得新生,成为测定单晶体结构的主要方法。以后又出现了新型探测器电荷偶合器件(charge-couple device CCD),其性能在一些方面更优于IP,有成为主要探测器的趋势。 1. 选择大小适度,晶质良好的单晶体作试样,收集衍射数据。
2.指标化衍射图,求出晶胞常数,依据全部衍射线的衍射指标,总结出消光规律,推断晶体所属的空间群。
3. 将测得的衍射强度作吸收校正,LP校正等各种处理以得出结构振幅|F|。
4.相角和初结构的推测。常用推测相角的方法有派特逊函数法及直接法。 从派特逊图上可以比较容易地得到晶体中所含重原子的位置坐标,可依此计算各衍射的相角
αHKL,将此αHKL去与实验测得的结构振幅|FHKL|结合生成FHKL,可据此计算电子密度图,可以定出更多原子的原子位置及修正已有的原子位置。再利用这些数据重新计算αHKL、FHKL及ρ(x,y,z),如此反复叠代多次推出完整的晶体结构。
直接法是利用结构振幅间的某些统计关系求出衍射相角的方法。在求出某些衍射的相角αHKL以后,把他们去与实验测得的|FHKL|配合生成FHKL,进而计算ρ(x,y,z),从中获得部分原子的位置,从此修正和扩充已有的相角,如派特逊那样反复叠代以得出完整的结构。 由派特逊函数或直接法推出的结构是较粗糙和可能不完整的,故需要对此初始结构进行完善和精修。常用的完善结构的方法称为差值电子密度图,常用的精修结构参数的方法是最小二乘方法,经过多次反复,最后可得精确的结构。同时需计算各原子的各向同性或各向异性温度因子及位置占有率等因子。
最终所得结果的优劣常用吻合因子R来衡量
式中,w为权重因子,下标o,c表示实测值,计算值。 生物大分子结构的测定,从原理上讲与小分子(无机物,有机物,配合物等)无异,但由于分子大也带来一定的特殊性,需要有一些不同于小分子的方法。
大分子的特点是分子量大,原子多,但原子序数小,多数是C,H,O,N等轻元素,故散射能力低,不易收集到高角的衍射点,这会使电子密度图的分辨率降低。还因他晶胞大,所含原子数目多,需确定的结构参数就多,这与分辨率低有矛盾。另外,大分子晶体在X射线的照射下易于损坏,如何缩短实验时间也成为一个重要问题。
大分子由于分子量大,要求使用较大体积的单晶体,如对于分子量为5000的蛋白质分子,就要有大于0.3mm3的单晶体。但因其分子大,结晶就困难,而且很易结晶成孪晶,这不合用。得到合用的晶体是整个大分子结构测定中关键的一步,常说有了良好的晶体,结构测定一半的问题已解决了。
一般用回摆法收集衍射数据,用IP或CCD作探测器,可以在几个小时内完成数据收集工作。
关于相角问题,在解小分子结构中目前最常使用的直接法还不能用于大分子,而派特逊法,由于大分子缺少重原子也无法使用。目前是用基于派特逊法的几个方法来解决相角问题的。 有时,几个不同的生物大分子是由相同的结构单位以不同方式连接而成的; 同一种生物大分子如在不同的条件中结晶,有可能得到不同的结晶,是为多结晶现象; 还有些生物分子,他们是由共同的分子祖先进化而得,因此其中有相当部分是相同的。对于这些类的生物分子,他们的派特逊图常有很大的相似性。因此,在求解某生物大分子结构时,如能找到与他有类似的结构,且结构已测定的生物大分子结构时,则可按最大重叠原理找出待测物和已知物的派特逊图之间的关系,从而得出未知物衍射的位相,进而解出结构。若已知物和待测物是同晶化合物,则可利用差值电子密度图来解出结构,更为简单。
若在已知结构的大分子结构数据库中找不到与待测物有类似结构的分子结构时,就不能使用此法,要使用以后的方法。 这种方法是设法把对X射线散射能力大的重金属原子,如Hg,Pb,Se等引入生物分子中,作为标识原子。这种置换入重原子的大分子应与无重原子时的原晶体有相同的晶胞参数和空间群,且绝大多数原子的位置相同,故称同晶置换。从这些含重原子晶体的衍射数据,利用基于派特逊法的方法可解出重原子的位置,据此算出其结构因子和相角,进而利用相角关系计算出没有重原子的原晶体的相角,解出结构。
经常使用不只一种重原子进行置换,以得几种同晶置换衍生物,称多对同晶置换法。同晶置换
衍生物越多,可正确定出的相角也越多。 晶体衍射中有一条弗里德耳定律,就是说不论晶体中是否存在对称中心,在晶体衍射中总存在着对称中心,也即有FHKL=FHKL。但是当使用的X射线波长与待测样品中某一元素的吸收边靠近时,就不遵从上述定律,也即FHKL≠FHKL。这是由电子的反常散射造成的,利用这一现象可以解决待测物的相角问题。一般,这一方法常与重原子同晶置换法结合使用。
在收得同晶置换物的衍射数据后,改变入射线波长至靠近重原子的吸收边处,再次收集数据,这套数据是存在反常散射的,可利用这两套数据来求位相。有如多同晶置换法,如采用几个不同波长的X射线,对所含不同元素收集几套反常散射数据,则可得更正确、更完整的相位信息,是为多波长反常衍射法(MAD),是目前解分子生物大分子的重要方法。实验室X射线光源不易使用这一方法,因要改变X射线波长是很困难的,而对于同步X射线光源,改变波长是相当方便的,因此常被使用。
X射线衍射仪探测器的主要性能
X射线衍射仪是一种用于研究物质结晶结构的仪器,它的探测器具有以下主要性能:1. 灵敏度:探测器的灵敏度指的是它对入射X射线的响应能力。较高的灵敏度意味着可以检测到较弱的衍射信号,从而获得更准确的研究结果。2. 分辨率:探测器的分辨率决定了其能够区分出不同衍射峰的能力。较高的分辨率意味着...
X衍射仪和单晶X衍射仪的区别??
X射线衍射仪可以分为X射线粉末衍射仪和X射线单晶衍射仪。在传统的X射线衍射仪器中,单晶衍射仪及粉晶衍射仪功能各别,如四圆单晶衍射仪,如果所挑选的晶体颗粒不是严格的单晶体(该单晶体用于准直X射线,即获得单色的X射线),则无法进行后继的测试研究,而粉晶衍射仪也不能进行单晶数据收集。 http:\/...
国产x射线衍射仪
国产X射线衍射仪是一种用于材料分析的仪器。答案:国产X射线衍射仪是一种利用X射线在物质中的衍射现象来研究物质结构的高精度仪器。它通过测量X射线在物质中产生的衍射花样,可以获得物质的晶体结构、晶格参数、晶体缺陷、应力分布等方面的信息。广泛应用于冶金、陶瓷、矿物、金属、高分子材料等领域。详细...
x射线衍射法测什么
X射线源、蛋白质品体和检测器。一细束X射线打到蛋白质晶体上,有一部分直接穿过晶体,其余的向不同方向衍射。X线片可以接受衍射光束,感光乳剂的发黑程度与衍射光束的密度成比例。经计算机可绘制三维电子密度图。微区XRD 当需要测试某一个小区域的XRD图谱时,可用微区XRD测试。因为仪器限制,通常区域最...
通过测试可以直接得到化合物准确结构的仪器是什么?
通过测试可以直接得到化合物准确结构的仪器主要有核磁共振(NMR)仪器和X射线晶体衍射仪器。核磁共振(NMR)仪器:核磁共振技术利用核自旋的性质,通过测量磁共振现象来确定分子结构。通过核磁共振谱图可以得到化合物的准确结构、化学环境以及分子的各个原子之间的化学键。X射线晶体衍射仪器:X射线晶体衍射技术利用...
X射线衍射仪工作原理是什么?
对于晶体材料,当待测晶体与入射束呈不同角度时,那些满足布拉格衍射的晶面就会被检测出来,体现在XRD图谱上就是具有不同的衍射强度的衍射峰。对于非晶体材料,由于其结构不存在晶体结构中原子排列的长程有序,只是在几个原子范围内存在着短程有序,故非晶体材料的XRD图谱为一些漫散射馒头峰。X射线衍射...
请教如何确定晶体生长方向
如何根据高分辨相来判断晶体生长方向 X-射线单晶衍射仪对晶体进行定轴,确定晶体的极轴。
无定形样品的X射线衍射图谱应当是什么样子
馒头峰,一个小鼓包。由X射线衍射的原理知,只要是晶体的试样,用X射线衍射仪测得的图谱就会有衍射峰。如果样品是纯粹晶体,X射线衍射谱图是基线平直的衍射峰。如果样品是非晶体、无定形的,就是不规则的一些像山包、丘陵、土堆一样的隆起,这是样品无规则结构对X射线造成的X射线散射的结果,总之它...
X射线粉末衍射仪的介绍
振动着的电子是次生X射线的波源,其波长、周相与入射光相同。基于晶体结构的周期性,晶体中各个电子的散射波相互干涉相互叠加,称之为衍射。散射波周相一致相互加强的方向称衍射方向,产生衍射线。X射线对于晶体的衍射强度是由晶体晶胞中原子的元素种类、数目及其排列方式决定的。X射线衍射仪是利用X射线衍射法...
x射线衍射、x荧光、直读光谱3种仪器,都有哪些区别,原理是什么?检测领 ...
三、X射线衍射仪分为X射线粉末衍射仪和X射线单晶衍射仪。由于形成大单晶较为困难,X射线粉末衍射成为主流技术。单晶衍射能够揭示物质分子内部原子的空间结构,而粉末衍射虽也能分析结构,对于大分子如蛋白质等复杂结构的分析则具挑战性。X射线粉末衍射能够完成如下任务:1) 判断物质是否为晶体;2) 识别晶体...
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旬邑县18833553753: 关于衍射,衍射的实质是什么?为什么会发生衍射?发生衍射的条件?晶体衍射的客观条件? - ?
刁谈兰索: 衍射的实质:是光的干涉,是无穷多次波的相干叠加.衍射发生的原因:当光线遇到障碍物时,它将偏离直线传播,产生衍射现象.发生衍射的条件:衍射的基本条件是障碍物夹缝宽接近于波长.晶体衍射的客观条件:晶体X射线衍射 X-ray ...
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旬邑县18833553753: Ⅲ类非医用射线装置(衍射仪) 带放射源吗?管理上是否需要按照带放射源的装置来管理? - ?
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旬邑县18833553753: 什么是x射线衍射分析,分析仪器有哪些 - ?
刁谈兰索: X射线衍射相分析(phase analysis of xray diffraction)利用X射线在晶体物质中的衍射效应进行物质结构分析的技术.每一种结晶物质,都有其特定的晶体结构,包括点阵类型、晶面间距等参数,用具有足够能量的x射线照射试样,试样中的物质受激发,会产生二次荧光X射线(标识X射线),晶体的晶面反射遵循布拉格定律.通过测定衍射角位置(峰位)可以进行化合物的定性分析,测定谱线的积分强度(峰强度)可以进行定量分析,而测定谱线强度随角度的变化关系可进行晶粒的大小和形状的检测.
旬邑县18833553753: X射线粉末衍射仪是做粉末的衍射吗? - ?
刁谈兰索: X射线解析晶体结构的仪器有两种:粉末衍射仪和单晶衍射仪 (小角度散射仪除外,不能解析晶体的结构) 做材料的一般都用粉末衍射仪,而专门搞晶体的采用到单晶衍射仪.两者的功能区别很大的.普通的3kV粉末衍射仪大概200万左右,18kV的不大清楚;单晶衍射仪得接近400万,价格也差得远了
旬邑县18833553753: X衍射仪工作原理 - ?
刁谈兰索: X衍射仪是利用衍射光栅,而其是利用光的衍射原理使光波发生色散的光学元件.它是大量相互平行、等宽、等距的狭缝(或刻痕)构成.以衍射光栅为色散元件组成的摄谱仪和单色仪是物质光谱分析的基本仪器之一.光栅衍射原理也是晶体X射线结构分析和近代频谱分析及光学信息处理的基础. 添加评论
旬邑县18833553753: 晶体结构鉴定手段或方法,及各种方法的作用 - ?
刁谈兰索: X射线衍射分析、红外光谱分析 X-射线粉末衍射法是利用单色X-射线照射到粉末晶体或多晶样品上,所得的衍射图称为粉末图.用粉末图谱解决有关晶体结构等问题的方法称为X-射线粉末衍射法;通常用Debye-Scherrer照相法.其优点是所需样...
旬邑县18833553753: 粉晶X射线衍射仪主要由哪些部分组成呢? ?
刁谈兰索: 粉晶X射线衍射仪采用粉末状晶体或多晶体为试样的X射线衍射仪.主要由X射线发生装置、测角仪、探测记录装置和水冷却系统组成,新型的还带有条件输入和数据处理系统.测角仪是主要部分.做成平板状的试样,置于测角仪中心的样品架上,探测器(计数管)安装在测角仪圆周上.X射线管是固定的.X射线经由发射狭缝S1照射到样品上时,晶体中与样品表面平行的面网在符合布拉格条件时即可产生衍射,通过狭缝S2和接收狭缝S3被计数管接收.计数管在平面内扫描时,样品与计数管以1:2的速度同步转动,衍射线被依次记录并转换成电脉冲信号,经放大处理后,通过记录仪描绘成衍射图.此种仪器的优点是快而准确,是X射线分析的重要设备.