比较概述基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学的概念、研究方法、优缺点及应用设想

基因组学，转录组学，蛋白质组学哪个更有用~

组学omics，研究的是整体. 按照分析目标不同主要分为基因组学，转录组学，蛋白质组学，代谢组学。
基因组学研究的主要是基因组DNA，使用方法目前以二代测序为主，将基因组拆成小片段后再用生物信息学算法进行迭代组装。当然这仅仅是第一步，随后还有繁琐的基因注释等数据分析工作。
转录组学研究的是某个时间点的mRNA总和，可以用芯片，也可以用测序。芯片是用已知的基因探针，测序则有可能发现新的mRNA,
蛋白组学针对的是全体蛋白，组要以2D-Gel和质谱为主，分为top-down和bottom-up分析方法。理念和基因组类似，将蛋白用特定的物料化学手段分解成小肽段，在通过质量反推蛋白序列，最后进行搜索，标识已知未知的蛋白序列。
代谢组分析的代谢产物，是大分子和小分子的混合物，主要也是用液相和质谱。
总而言之，这些技术都想从全局找变量，都是一种top-down的研究方法，原因很简单：避免‘只缘身在此山中’的尴尬。
但因为技术局限，都各有缺点，尤其是转录组和蛋白组数据，基本上颠覆了以前一直认为的mRNA水平能代表蛋白水平的观念，因为这两组数据的重合度太低。
所以目前很多研究都开始使用交叉验证方法。
无论如何，都需要对数据进行分析，有经验的分析往往能化腐朽为神奇。

那年夏天Forever与转录组学和蛋白组学比较,代谢组学有以下优点：①代谢组学放大了基因和蛋白表达的微小变化,从而使检测更容易；②代谢组学的研究不需建立全基因组测序及大量表达序列 标签(EST)的数据库,且代谢产物的种类要远小于基因和蛋白的数目.③ 由于给定的代谢产物在每个组织中都是一样的,所以研究中采用的技术更为通用也更易被人们所接受.④ 生物体液的代谢产物分析可反映机体系统的生理和病理状态.通过代谢组学研究既可以发现生物体在受到各种内外环境扰动后的应答不同,也可以区分同种不同个体之间的表型差异,因此在国际医药、动植物、微生物等研究领域内得到了广泛应用.

组学omics，研究的是整体. 按照分析目标不同主要分为基因组学，转录组学，蛋白质组学，代谢组学。
基因组学研究的主要是基因组DNA，使用方法目前以二代测序为主，将基因组拆成小片段后再用生物信息学算法进行迭代组装。当然这仅仅是第一步，随后还有繁琐的基因注释等数据分析工作。
转录组学研究的是某个时间点的mRNA总和，可以用芯片，也可以用测序。芯片是用已知的基因探针，测序则有可能发现新的mRNA,
蛋白组学针对的是全体蛋白，组要以2D-Gel和质谱为主，分为top-down和bottom-up分析方法。理念和基因组类似，将蛋白用特定的物料化学手段分解成小肽段，在通过质量反推蛋白序列，最后进行搜索，标识已知未知的蛋白序列。
代谢组分析的代谢产物，是大分子和小分子的混合物，主要也是用液相和质谱。
总而言之，这些技术都想从全局找变量，都是一种top-down的研究方法，原因很简单：避免‘只缘身在此山中’的尴尬。
但因为技术局限，都各有缺点，尤其是转录组和蛋白组数据，基本上颠覆了以前一直认为的mRNA水平能代表蛋白水平的观念，因为这两组数据的重合度太低。
所以目前很多研究都开始使用交叉验证方法。
无论如何，都需要对数据进行分析，有经验的分析往往能化腐朽为神奇。

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顺义区13786881234： 论述蛋白质组学与基因组学的区别和联系 - ？
魏殃一清： 组学omics,研究的是整体. 按照分析目标不同主要分为基因组学,转录组学,蛋白质组学,代谢组学. 基因组学研究的主要是基因组DNA,使用方法目前以二代测序为主,将基因组拆成小片段后再用生物信息学算法进行迭代组装.当然这仅仅...

顺义区13786881234： 比较基因组学的概述 - ？
魏殃一清： 模式生物基因组研究揭示了人类疾病基因的功能,利用基因顺序上的同源性克隆人类疾病基因,利用模式生物实验系统上的优越性,在人类基因组研究中的应用比较作图分析复杂性状,加深对基因组结构的认识.“一个物种的不同器官之间的差...

顺义区13786881234： 基因组学、功能基因组学、蛋白质组学以及转录组学的 - ？
魏殃一清： 请问你是什么问题.亲基因组学系统研究基因功能和结构及其相互关系的学科,在HGP人类基因组计划之后提出. 功能基因组学是前者的一部分. 蛋白质组学,是研究细胞、组织、个体内所有蛋白质的功能、结构及其相互作用网络的学科,比如离子通道阀、免疫蛋白、 转录组学,首先要明白一个概念,从基因的dna编码,到蛋白质的氨基酸编码,中间需要rna 的转录这一步.因此转录组学是研究 RNA转录后的变化发展及与DNA、蛋白质的对应关系的学问.其实很多时候是以项目来分了,比如克隆了、chip技术了;直接用这三个名词的个人研究比较少,那些都一般是国际协作的大项目.

顺义区13786881234： 什么叫转录组、转录组学?研究转录组学有何意义 - ？
魏殃一清：[答案] 广义转录组是指生命单元(通常是一种细胞)中所有按基因信息单元转录和加工的RNA分子(包括编码和非编码RNA功能单元),或者是一个特定细胞所有转录本的总和.它的研究对象就是这些RNA与蛋白质分子和它们所组成的基因功能网络以及它...

顺义区13786881234： 基因组学、蛋白质组学、转录组学、代谢组学研究的独特性(每门学科用不超过5个字表述)？
魏殃一清： 基因组学-功能基因;蛋白质组学-差异蛋白;转录组学-RNA量变;代谢组学-次生代谢物.

顺义区13786881234： 什么是基因组学? - ？
魏殃一清： 科技名词定义中文名称:基因组学 英文名称:genomics 定义1:研究基因组的结构、功能及表达产物的学科.基因组的产物不仅是蛋白质,还有许多复杂功能的RNA.包括三个不同的亚领域,即结构基因组学、...

顺义区13786881234： 与转录组学和蛋白组学比较,代谢组学有何优点? - ？
魏殃一清：[答案] 那年夏天Forever与转录组学和蛋白组学比较,代谢组学有以下优点:①代谢组学放大了基因和蛋白表达的微小变化,从而使检测更容易;②代谢组学的研究不需建立全基因组测序及大量表达序列 标签(EST)的数据库,且代谢产物的种类要远小于...

顺义区13786881234： 比较基因组学都需要研究哪些内容 - ？
魏殃一清： 结构基因组学(分析基因的结构和序列信息)、功能基因组学(批量研究基因的功能和互作)、比较基因组学(通过近源物种研究该物种的基因信息).

顺义区13786881234： 什么是比较基因组学,简述它们在遗传学中的应用 - ？
魏殃一清： 比较基因组学:在基因组图谱和序列分析的基础上,对已知基因和基因的结构进行比较,了解基因的功能,表达调控机制和物种进化过程的学科. 比较基因组学(Comparative Genomics)是基于基因组图谱和测序基础上,对已知的基因和基因组结构进行比较,来了解基因的功能、表达机理和物种进化的学科.利用模式生物基因组与人类基因组之间编码顺序上和结构上的同源性,克隆人类疾病基因,揭示基因功能和疾病分子机制,阐明物种进化关系,及基因组的内在结构.

顺义区13786881234： 基因组学反映了什么是可以发生的,转录组学反映的 - ？
魏殃一清： 基因组学是研究生物基因组的组成,组内各基因的精确结构、相互关系及表达调控的科学.基因组学、转录组学、蛋白质组学与代谢组学等一同构成系统生物学的组学(omics)生物技术基础. 基因组研究应该包括两方面的内容:以全基因组测序为目标的结构基因组学(structural genomics)和以基因功能鉴定为目标的功能基因组学(functional genomics),又被称为后基因组(postgenome)研究,成为系统生物学的重要方法.