为什么镁离子浓度过高会引起PCR非特异性扩增

作者&投稿:底善 (若有异议请与网页底部的电邮联系)
PCR mg离子一般是什么浓度~

镁离子浓度一般用量1.5-2.0 mmol/L,Taq DNA聚合酶活性需要Mg 2+。Mg 2+浓度过低,会显著降低酶活性。Mg 2+浓度过高又使酶催化非特异性扩增增强。Mg 2+浓度还会影响引物的退火、模板与PCR产物的解链温度,从而影响扩增片段的产率。 Takara的mg离子的浓度一般是25mM的,20ul体系我们一般加1.2ul的MgCl2,效果挺好的

因为PCR是一种体外DNA扩增技术,会使引物发生现非特异性扩增;在模板DNA、引物和4种脱氧核苷酸存在的条件下,依赖于DNA聚合酶的酶促合反应;
将待扩增的DNA片段与其两侧互补的寡核苷酸链引物经“高温变性——低温退火——引物延伸”三步反应的多次循环,使DNA片段在数量上呈指数增加,从而在短时间内获得我们所需的大量的特定基因片段。

扩展资料:
PCR技术的相关介绍:
DNA模板--引物结合物在TaqDNA聚合酶的作用下,以dNTP为反应原料,靶序列为模板,按碱基配对与半保留复制原理,合成一条新的与模板DNA 链互补的半保留复制链,重复循环变性--退火--延伸三过程,就可获得更多的“半保留复制链”,而且这种新链又可成为下次循环的模板。
每完成一个循环需 2~4分钟,2~3小时就能将待扩目的基因扩增放大几百万倍。到达平台期所需循环次数取决于样品中模板的拷贝。PCR的反应动力学 PCR的三个反应步骤反复进行,使DNA扩增量呈指数上升。
反应最终的DNA 扩增量可用Y=(1+X)n计算。Y代表DNA片段扩增后的拷贝数,X表示平(Y)均每次的扩增效率,n代表循环次数。平均扩增效率的理论值为100%, 但在实际反应中平均效率达不到理论值。
反应初期,靶序列DNA片段的增加呈指数形式,随着PCR产物的逐渐积累,被扩增的DNA片段不再呈指数增加,而进 入线性增长期或静止期,即出现“停滞效应”,这种效应称平台期数、PCR扩增效率及DNA聚合酶PCR的种类和活性及非特异性产物的竞争等因素。大多数情况下,平台期的到来是不可避免的。
参考资料来源:百度百科-PCR扩增
参考资料来源:百度百科-PCR技术

浓度过高的话,taq酶活性会改变(具体怎么变的我就不懂了)从而导致非特异性扩展


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PCR mg离子一般是什么浓度
镁离子的量和dNTP的量相关,过量的dNTP会和镁离子结合,降低能有酶结合的游离镁离子的浓度。当dNTP的量正常时,一般镁离子的终浓度再1mM~3.5mM之间吧。如果你的重点是产物量就调高点,要是对特异性更在意就调低点

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镁离子在PCR中的作用
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张家港市15897305032: 为什么pcr引物中GC含量过多易出现非特异性条带 -
卞诞水王: 首先要明白GC之间是三个氢键连接,而AT之间是两个氢键连接.导致结果便是高GC含量的片段解链需要的能量高,TM值高.其次,退火时相对于正常引物而言,高GC含量引物更容易与互补序列配对,但是,与相近序列配对的可能性也比正常引物高,导致易出现非特异性条带.为防止特异性条带产生,最主要的就是引物的设计,如果无法避免高GC含量,可以通过优化反应条件以及反应体系来减少非特异性扩增.

张家港市15897305032: Mg2+离子浓度影响PCR扩增效率的机制? -
卞诞水王: 因为Mg2+是DNA聚合酶(Taq聚合酶)的必需激活剂! Mg2+浓度越高,聚合酶活性越强,过强就会出现非特异性扩增! Mg2+浓度越低,聚合酶活性越低,扩增效率也就越低,产物就越少! ================== 所以PCR扩增实验,需要根据实际情况,摸索适宜的Mg2+浓度!

张家港市15897305032: 基因的PCR扩增出现非特异扩增产物,何故? -
卞诞水王: 非特异性条带的出现,其原因:一是引物与靶序列不完全互补、 或引物聚合形成二聚体.二是Mg2+离子浓度过高、退火温度过低,及PCR循环次数 过多有关.其次是酶的质和量,往往一些来源的酶易出现非特异条带而另一来源的酶 则不出现,酶量过多有时也会出现非特异性扩增.其对策有:①必要时重新设计引 物.②减低酶量或调换另一来源的酶.③降低引物量,适当增加模板量,减少循环次 数.④适当提高退火温度或采用二温度点法(93℃变性,65℃左右退火与延伸).

张家港市15897305032: 镁离子在PCR中的作用镁离子对PCR产物的影响 -
卞诞水王:[答案] Mg离子的作用主要是 dNTP-Mg 与核酸骨架相互作用 并能影响Polymerase的活性,一般的情况下 Mg的浓度在0.5-5mM之间调整,同样要记住的是在调整了dNTPs的浓度后要相应的调整Mg离子的浓度 Mg2+离子浓度对PCR扩增效率影响很大,浓度过...

张家港市15897305032: 氯化镁在PCR中的作用
卞诞水王: 实际上是镁离子的作用.镁离子是Polymerase的激活剂.浓度过高可降低PCR扩增的特异性,浓度过低则影响PCR扩增产量甚至使PCR扩增失败而不出扩增条带.

张家港市15897305032: 在进行PCR时,模板浓度会导致反应的非特异性增加,怎么理解 -
卞诞水王: 由于模板浓度过高时,PCR体系内DNA与DNA之间,DNA与引物之间分子碰撞几率增大,所以可能会出现非特异性扩增,也会出现发卡结构

张家港市15897305032: PCR反应中的镁离子浓度是可以调节的吗? -
卞诞水王: 可以.一般来讲,适当调高镁离子浓度有助于提高Taq酶活性,也就是提高PCR效率,但会降低PCR特异性,也就是说可能会有更多杂带.适当降低镁离子浓度则可提高特异性.所以,在实...

张家港市15897305032: PCR mg离子一般是什么浓度 -
卞诞水王: 镁离子的量和dNTP的量相关,过量的dNTP会和镁离子结合,降低能有酶结合的游离镁离子的浓度.当dNTP的量正常时,一般镁离子的终浓度再1mM~3.5mM之间吧.如果你的重点是产物量就调高点,要是对特异性更在意就调低点

张家港市15897305032: 模板DNA过高是否会导致PCR产物减少 -
卞诞水王: 博凌科为-为你解答:会的.1.模板浓度过高,引物就更多的与模板结合而与PCR产物结合的少,是的前几个循环的扩增数较少;2. 过高的模板会螯合Mg离子,降低Taq酶的活性3..会产生非特异性扩增

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