如何通过已知的目的蛋白肽段序列设计引物来获取目的基因

作者&投稿:丙于 (若有异议请与网页底部的电邮联系)
对于不知道序列的目的基因 如何来设计它的引物~

不知道序列,知道是什么基因的话,可以根据物种之间的同源性在保守区域设计引物,然后再用race等技术扩全长,如果基因名字什么都不知道的话。。。那就图位克隆。。

“基因序列”就是"基因核苷酸序列“
设计引物就是直接根据基因序列来设计的
不用知道全长,只要基因两段的序列就能设计引物了。

不必对序列做任何处理,直接设计引物即可啊。
1. 对提出的总RNA逆转录时,mRNA对应的cDNA有一条链与mRNA序列相同,为有意链,一条反向互补(reverse compliment, rc), 为模板链。你在纸上一画应该就清楚了,以mRNA序列(有意链)中ATG开始的20个碱基作为正向引物,以模板链TCA(TGA的反向互补序列)开始的20个碱基作为反向引物即可。

2.由于扩增Coding sequence对引物的位置要求严格(从ATG到TGA)因此设计的引物的评分通常较低(已形成引物二聚体或者有较为严重的错配),有时这会影响目标产物的扩增。我有时会先设计一对引物,这对引物分别在5'和3'UTR区域,用软件设计,要保证引物好用;这样以cDNA为模板进行扩增后,再以此产物为模板用ATG到TGA的一对引物去扩增,这样就较大程度避免了错配,比较容易扩增成功。

不是应该通过设计兼并引物进行扩增吗?具体过程我没有做过,我觉得这里说的比较好
http://zhidao.baidu.com/link?url=aGvFd6Wnt4sZOEZR4_TSH08FS7wTqKOrEgS1ZGHG-1S4ni-RNqAGH0ZlAeG6vb6CDboy6jhBfSzg8BA-idEiE_


chip-chip原理
这种方法的目的是揭示蛋白质与DNA之间的相互作用信息。ChIP-chip技术在生物研究中广泛应用,如高通量筛选特定反式因子的靶基因,寻找反式因子的体内结合位点,以及研究RNA在基因表达调控中的作用。当ChIP技术与DNA芯片和分子克隆技术结合,可以实现对已知蛋白质未知DNA靶点的高通量筛选,同时揭示反式作用因子...

获取目的基因的方法有哪些
适应于编码小分子多肽的基因。3、从mRNA合成cDNA。采用一定的方法钓取特定基因的mRNA,再通过逆转录酶催化合成其互补DNA(cDNA),除去RNA链后,再用DNA聚合酶合成其互补DNA链,从而得到双链DNA。4、利用PCR合成。如已知目的基因两端的序列,则可采用聚合酶链反应(PCR)技术,在体外合成目的基因。

如果有人在研一的时候教我这样做实验就好啦(GST pull-down)
技术简介 GST pull-down实验基于GST(谷胱甘肽-S-转移酶蛋白)与谷胱甘肽(GSH)结合的特性,通过将已知蛋白X与GST融合表达,形成GST-X蛋白。GST-X蛋白能与GSH-磁珠结合,若体系中存在与X蛋白互作的蛋白Y,则会形成磁珠-GSH-GST-X-Y复合物,从而实现与X蛋白互作蛋白的分离与检测。技术优势 该技术在...

什么是目的基因自身环化
目的基因自身环化的发现 目的基因自身环化的发现是通过对基因家族进行序列比对发现的。首先是基于人类基因库以及其他物种基因库的数据库,找到已知的目的基因。然后,通过在同一物种或不同物种的基因库中搜索与其高度相似的序列,对这些序列进行比对和分析,本质上是一种演化树重建的过程。通过比对,发现了一些...

...亲和层析从一稀蛋白混合物中纯化出目的蛋白,上述三种层析的顺序怎么...
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研究蛋白质之间相互作用的实验方法?
牢固型相互作用以多亚基蛋白复合体常见,最好通过免疫共沉淀(Co-IP) 、Pull-down技术或Far-western法研究。Pull-down技术用固相化的、已标记的饵蛋白或标签蛋白(生物素-、PolyHis-或GST-),从细胞裂解液中钓出与之相互作用的蛋白。通过Pull-down技术可以确定已知的蛋白与钓出蛋白或已纯化的相关蛋白...

目的蛋白的鉴定方法有哪些?
1、若是溶液中的蛋白质可用双缩脲试剂 先加入双缩脲试剂A(质量浓度为0.1g\/ml的NaOH溶液);后加入双缩脲试剂B(质量浓度为0.01g\/ml的CuSO4溶液),顺序不可颠倒,溶液显紫色则说明是蛋白质。2、某些蛋白质遇到硝酸会变黄,例如人的皮肤,实际上是蛋白质变性。3、若是固体,可通过燃烧闻气味来...

蛋白质电泳问题
问题关键是:蛋白浓度!我们的蛋白本身易降解,且纯化率低,蛋白浓度很低,再加上透析、除盐等复杂步骤,脆弱的蛋白又被大量稀释,那么增加初始蛋白来源不就可以了么?将原始菌液扩大好几倍,最后将蛋白进一步浓缩再跑胶,于是看到了漂亮的目的蛋白带~~~另:我不认为你的蛋白样品成分会影响电泳(除非...

真核原核表达系统的优缺点?
该项技术的主要方法是将已克隆入目的基因DNA片段的载体(一般为质粒)转化细菌(通常选用的是大肠杆菌),通过IPTG诱导并最终纯化获得所需的目的蛋白。其优点在于...目前,已发现有质粒的细菌有几百种,已知的绝大多数的细菌质粒都是闭合环状DNA分子(简称cccDNA)。细菌质粒的相对分子质量一般较小,约为细菌染色体的0.5%~3%...

已知酶切位点怎么获得基因
(1)对已定序列的DNA分子,只需要用已知识别序列的限制性内切酶进行一次或几次切割,分离纯化所需要的DNA片断,与 适当载体连接。 (2)对已知定位的目的基因,只要根据目的基因两侧的已知的酶切识别位点,一次就可以获得。 (3)即使含目的基因的DNA分子未定序或定位,也只须通过酶切分析,随后再通过部分酶切,...

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浦北县18151589971: 考研题 微生物 请高人帮忙 先谢了 有一段已知序列的小分子抗菌肽,论述如何采用生物工程的技术进行表达? -
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浦北县18151589971: 抗体制备必须蛋白质全长吗 -
查查先友: 不需要.通常根据目标要检测的部分设计一段肽段,或者就过表达一段就行.用全长很多是为了方便,直接过表达一个蛋白,纯化一下,就去免疫动物了.如果为了提高特异性的话,还是可以有选择的确定抗原的大小的.如果非常具体是哪一段,用软件设计后,直接合成肽段,也不用表达蛋白了.把肽段再连到载体蛋白(KLH,BSA等)上,就可以去免疫动物了.

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