生物催化和生物降解的数据库及网址有哪些
一般来说所用的分析工具有在线跟下载的下面简要列举一些常用在线软件的使用1、使用VecScreen工具，分析下列未知序列，输出序列长度、载体序列的区域、可能使用的克隆载体都有哪些。一、步骤：
打开google首页，搜索VecScreen，进入VecScreen首页，复制序列，运行，Viewreport。
二、结果：
输出序列长度918bp，载体序列的区域456bp——854bp.
克隆载体：M13mp18phage，pGEM-13Zf()，pBR322，pRKW2。
2、使用相应工具，分析下列未知序列的重复序列情况，输出重复序列的区域、包含的所有重复序列的类型、重复序列的总长度及MaskedSequence。
一、步骤：
进入google首页，进入ICBI主页，对序列进行BLAST。得出序列是human的。
进入google首页，搜索，进入主页，进入，复制序列，DNAsource选择human，运行！点击超链接，在结果中选择
AnnotationFile：_1287631711.out.html
3、使用CpGPlot/CpGReport/Isochore工具，分析下列未知序列，输出CpG岛的长度、区域、GC数量、所占的百分比及Obs/Exp值。一、步骤：
进入google首页，搜索CpGPlot，进入CpGPlot主页，program中选择cpgreport复制序列，运行！
二、结果：
CpG岛的长度：385bp
区域：48——432；
GC数量：SumCG=297，百分数=77.14
Obs/Exp：1.01、4、预测下面序列的启动子，输出可能的启动子序列及相应的位置。一、步骤：
进入google首页，进入ICBI主页，对序列进行BLAST。得出序列是human的
进入google首页，搜索NeuralNetworkPromoterPrediction，进入主页，复制序列，选择eukaryote，运行！
二、结果：
位置：711—761，1388—1438，1755—1805；
5、运用SpliceSitePrediction工具分析下面序列，分别输出内含子－外显子剪接位点给体和受体的区域及剪接处位置的碱基。一、步骤：
进入google首页，进入ICBI主页，对序列进行BLAST。得出序列是human的
进入google首页，搜索SpliceSitePrediction，进入主页，复制序列。Organism选择Humanorother。其他默认，运行！
二、结果：
供体：
受体：
6、对下面序列进行六框翻译，利用GENESCAN综合分析(首先确定给定序列的物种来源)哪个ORF是正确的，输出六框翻译（抓图）和GENESCAN结果(包括predictedgenes/exons和predictedpeptidesequence(s)两个部分)。一、步骤：
进入google首页，进入ICBI主页，对序列进行BLAST。得出序列是Zea的
进入google首页；搜索NCBI，进入主页，选择allresources（A~Z），选择O，选择ORFfinder。复制序列，默认，运行！
二、结果：ORF图
三、步骤：进入google首页，搜索GENESCAN，进入主页，Organism:Maize，，其他默认，运行！
四、结果：
G7、进入REBASE限制性内切酶数据库，输出AluI、MboI、EcoI三种内酶的RecognitionSequence和Type。
一、步骤：进入google首页，googleinEnglish，搜索REBASE，进入主页，分别输入AluI、MboI、EcoI，运行！
在MboI中选择第一个，EcoI选择第二个。
二、结果：
ENSCAN图
8、使用引物设计工具，针对下列未知序列设计一对引物，要求引物长度为20-25bp，扩增产物长度300-500bp，退火温度为50-60℃。请写出选择的一对引物（ForwardPrimerandReversePrimer）、及相应的GC含量、引物的位点、Tm值和产物长度。一、步骤：进入google首页，搜索genefisher，进入主页，复制fasta格式，chechkinput，sunmit，；；设置一下引物长度为20-25bp，扩增产物长度300-500bp，退火温度为50-60℃；。
二、结果：
GC含量：
引物的位点：
Tm值：
产物长度：。
9、将下面的序列用NEBcutter2.0工具分析，用产生平末端及有四个酶切位点的酶进行酶切，并用抓图提交胶图（viewgel），要求1.4%agarose和Marker为100bpDNALadder。
一、步骤：
进入google首页，进入ICBI主页，对序列进行BLAST，得知是linear。
进入google首页，搜索NEBcutter2.0，进入主页，选择linear，运行！选择customdigest，，把“1”改为“4”，选择平末端，后digest。Viewgel。选择1.4%agarose和Marker为100bp。
二、结果：
然后就是蛋白质的了一般都在expasy里swiss-prot适用于检索的computepi/mw求理论分子量分子量protparam物理化学性质protscale亲水性疏水性peptidemass分析蛋白酶和化学试剂处理后的内切产物
NCBI(www.ncbi.nlm.nih.gov)-GenBank数据库
数据库相似性搜索——核酸序列与核酸数据库比较（BLASTN）
蛋白质序列与数据库中蛋白质序列比较（BLASTP）
两序列比对（Aligntwosequences）
DNA序列分析——ORFFinder(www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/gorf.html)
分析实验序列外显子部分——GENSCAN（genes.mit.e/GENSCAN.html）
分析实验序列的可能酶切位点——NEBcutter2.0(tools.neb/NEBcutter2/index.php)
注：Customdigest--viewgel
限制性内切酶数据库——REBASE(rebase.neb/rebase/rebase.html)
设计引物扩增实验序列——Genefisher
Primer3
蛋白质序列分析及结构预测：
1.预测蛋白质的分子量及等电点:ExPASy（ComputepI/Mw）
2.分析蛋白质的基本物理化学性质：ExPASy（ProtParam）
3.分析蛋白质的亲水性和疏水性：ExPASy（ProtScale）
4.分析蛋白质在各种蛋白酶和各种化学试剂处理后的内切产物：ExPASy（PeptideMass）[*：kinaseK]
5.分析蛋白质的信号肽：ExPASy（SignalP）
6.预测蛋白质的二级结构：ExPASy（Jpred3）
多物种分子系统发育分析：EMBL（www.ebi.ac.uk/embl/)--Toolbox--Clustal2W
人脂联素蛋白质序列：NP_004788
人类胰岛素生长因子IB前体：P05019
生物催化的常见的生物催化剂——酶
按照国际生化协会公布的酶的统一分类原则,在上述六大类基础上,在每一大类酶中又根据底物中被作用的基团或键的特点,分为若干亚类;为了更精确地表明底物或反应物的性质,每一个亚类再分为几个组(亚亚类);每个组中直接包含若干个酶。 生物催化剂技术是化学生物技术的一个组成部分,作为化学合成的一种手段或工具的...
有没有哪种生物可以在自然状态下降解石油?
而且有种趋势是天然微生物的生物降解作用已成为消除环境中石油烃类污染的主要机制。 一、生物降解是指由生物催化的复杂化合物的分解过程。而在石油降解中微生物首先通过自身的代谢产生分解酶,裂解重质的烃类和原油,降低石油的粘度,另外在其生长繁殖过程中,能产生诸如溶剂、酸类、气体、表面活性剂和生物聚合物等有效...
影响污染物生物降解的因素?
光照、氧含量、污染物的量、催化剂的用量、PH值、阴离子阳离子的含量、其他添加剂的量
全生物降解是由哪些主要原料构成的?
一类为完全生物降解材料，如天然高分子纤维素、人工合成的聚己内酯等，其分解作用主要来自：①由于微生物的迅速增长导致塑料结构的物理性崩溃；②由于微生物的生化作用、酶催化或酸碱催化下的各种水解；③其他各种因素造成的自由基连锁式降解。另一类为生物崩解性材料，如淀粉和聚乙烯的掺混物，其分解作用...
生物处理中污染物的分解转化机制及可生化性的规律是什么?
生物处理中污染物的分解转化机制主要包括微生物对污染物的降解和转化。微生物通过一系列的酶促反应，将大分子有机污染物分解为小分子中间产物，最终转化为无害的物质，如二氧化碳、水或甲烷等。污染物的分解转化机制主要依赖于微生物的酶促反应。这些酶是由微生物分泌的，可以催化有机污染物的分解。不同...
与物理化学修复相比,生物修复有什么优缺点?
利用生物特别是微生物催化降解有机污染物，从而去除或消除环境污染的一个受控或者自发进行的过程，称为生物修复。优点：费用低；环境影响小；最大限度降低污染物浓度；处理其他技术难以应用的场地；生物修复技术可以同时处理受污染的土壤和地下水。缺点：微生物不能降解所有进入环境的污染物；生物修复需要具体...
可降解材料的分类有哪些?
按降解的外因因素来分，可分为：1.光降解材料：由于太阳光的作用而降解；2.生物降解材料：由于真菌、细菌等自然界微生物的呼吸作用或化能合成而降解,最终分解为二氧化碳和水；3.环境降解材料：在光、热、水、污染化合物、微生物、昆虫、机械力等自然环境条件作用下降解。影响材料降解性能的因素很多，具体...
哪里有石油降解的详细资料供下载?
而且有种趋势是天然微生物的生物降解作用已成为消除环境中石油烃类污染的主要机制。一、生物降解是指由生物催化的复杂化合物的分解过程。而在石油降解中微生物首先通过自身的代谢产生分解酶,裂解重质的烃类和原油,降低石油的粘度,另外在其生长繁殖过程中,能产生诸如溶剂、酸类、气体、表面活性剂和生物聚合物等有效化合...
什么叫做苯胺生物降解性
什么叫做苯胺生物降解性 苯胺呈碱性,与酸易生成盐。其氨基上的氢原子可被烃基或酰基取代,生成二级或三级苯胺及酰基苯胺。当苯胺进行取代反应时,主要生成邻、对位取代产物。苯胺与亚硝酸反应生成重氮盐,由此盐可制成一系列苯的衍生物和偶氮化合物。 工业上主要采用两种方法生产苯胺:①由硝基苯经活性铜催化氢化制备,此...
淡蓝色环境室内空气治理复合触媒技术如何应用?
技术四：生物化工 “复合触媒”复合加入特殊植物提取液，可与污染源反应产生高分子网状物质，消除二次污染，更可加强其迅速除臭及消除异味的作用。技术五：NS BIO生物技术 萃取大自然土壤的微生物，由特殊环境综合驯养出环境适应力最佳的微生物群，以生物降解的方式直接将污染物催化成二氧化碳、水等无害物...
窄珠冬凌： 1、乳酸有很强的防腐保鲜功效,可用在果酒、饮料、肉类、食品、糕点制作、蔬菜腌制以及罐头加工、粮食加工、水果的贮藏,具有调节 pH 值、抑菌、延长保质期、调味、保持食品色泽、提高产品质量等作用. 2、调味料方面,乳酸独特的酸...
黄州区19412599700： 生物柴油是怎么回事,能解答一下吗? - ？
窄珠冬凌： 生物柴油的主要成绩其实就是脂肪酸甲酯,2113目前国内的主要5261原料是地沟油,植物油炼油残渣,动物油脂.其主要工艺就是高温高压法.现在的技术4102比较成熟了,但生产出的脂肪酸甲酯多要进行勾兑才1653能销售(与柴油按一定比例勾兑),如果没有50万以上的资金最好不要搞这个,风险版大,现在原料的价格已权经被炒的很高了,失去投掷的意义.
黄州区19412599700： 生物柴油的主要成分是什么 和柴油由什么区别 - ？
窄珠冬凌： 生物柴油是清洁的可再生能源,它以大豆和油菜籽等油料作物、油棕和黄连木等油料林木果实、工程微藻等油料水生植物以及动物油脂、废餐饮油等为原料制成的液体燃料,是优质的石油柴油代用品.生物柴油是典型“绿色能源”,大力发展生...
黄州区19412599700： 什么是工具酶 - ？
窄珠冬凌：[答案] 在基因工程中起到特定功能的酶的统称. 可粗略的分为限制酶,连接酶,聚合酶和修饰酶四大类.其中,以限制性核酸内切酶和DNA连接酶在分子克隆中的作用最为突出. 限制酶: 生物体内能识别并切割特异的双链DNA序列的一种内切核酸酶.它可以将...
黄州区19412599700： 印染废水的处理方法有哪些? - ？
窄珠冬凌： 如果是方法的话就很多了,我之前开题报告有写过...印染废水先经过格栅、筛网、沉砂、调节水量及水质、降温等预处理,以除去悬浮物和可直接沉降的杂质,改善废水水质,确保后期处理的进行.预处理只是把废水中的悬浮物和浮石渣除...
黄州区19412599700： PMA和PHA的区别 - ？
窄珠冬凌： pha聚羟基脂肪酸酯是由很多细菌合成的一种胞内聚酯,在生物体内主要是作为碳源和能源的贮藏性物质而存在,它具有类似于合成塑料的物化特性及合成塑料所不具备的生物可降解性、生物相容性、光学活性、压电性、气体相隔性等许多优秀性能.聚羟基脂肪酸酯在可生物降解的包装材料、组织工程材料、缓释材料、电学材料以及医疗材料方面有广阔的应用前景,但只有降低PHA 的生产成本后才可能大规模应用.丙二醇甲醚醋酸酯(PMA)是一种高级溶剂,其分子中既有醚键,又有羰基,羰基又形成了酯的结构,同时又含有烷基.在同一分子中既有非极性部分,又有极性部分,这两部分的官能团既相互制约排斥,又各自起到其固有的作用.因此,对非极性物质和极性物质都有一定的溶解能力.
黄州区19412599700： 臭氧氧化三卤甲烷反应方程式 - ？
窄珠冬凌： 臭氧氧化三卤甲烷反应方程式 目前文献中考虑用来去除三卤甲烷和三卤甲烷先驱物质的技术,计有:氧化、暴气(aeration)、吸附、树脂、澄清(如混凝、直接过滤等)、原水控制、pH调整、降低加氯量、改变加氯点(changing the point of ...
黄州区19412599700： 印染废水处理后还有黄色怎么样脱色 - ？
窄珠冬凌： 印染废水一般处理药剂是在前段加硫酸亚铁,脱色效果相当好,缺点:污泥量大,过量会导致出水黄色;而楼主的水解酸化HRT稍微短了点,一般在15小时以上,效果比较好,接触氧化对去除...
