蛋白质组学实验设计、质控与分析
(1) 常用流程
(2) 样品
(3) iTRAQ/TMT项目设计
体外等重同位素标记定量技术，可同时比较多个样本之间的蛋白表达量差异（通常10个样本以下）。
基本原则 ：
(4) Labelfree项目设计
Labelfree是通过比较肽段母离子质谱峰强度，分析不同来源样品蛋白的表达量差异。该技术无需昂贵的同位素标记做内标。
基本原则 ：
（5）DIA项目设计
DIA是数据非依赖性采集定量技术，它将质谱整个全扫描范围分为若干个窗口，高速循环地对每个窗口中的所有离子进行选择、碎裂及检测，从而无遗漏、无差异地获取样本中所有离子的全部碎片信息。DIA无需指定目标肽段，扫描点数均匀，利用谱图库即可实现定性确证和定量离子筛选，并可实现数据回溯。
基本原则 ：
（6）各定量技术比较
从数据采集模式来说，iTRAQ/TMT和Labelfree都是传统的DDA扫描，即在每个扫描周期内，只采集丰度最高的10-20个母离子信号的子离子碎片，其他信号的子离子信息丢失，因此覆盖率低、随机性高、重复性相对低；DIA扫描则在每个扫描周期内，将质量区间设置为多个区段window，每次采集window内所有母离子信息及其碎片（扫描速度足够快），因此具有高覆盖度、高重复性的特点。
（7）搜库软件
（1）色谱质控
进行蛋白质组学的研究，可从以下角度来分析：
（2）功能层面
几种推测cdna编码的蛋白质的方法
虽然生物信息学的方法能预测基因及其蛋白质产物的结构、功能和定位,但是所有预测在未被实验证实以前都是不可靠的。因此必须把二者有机地结合起来,在生物信息学方法提供的信息的基础上指导实验设计,实验所得结果才是最准确的。・941・王涤平等:利用互联网预测cDNA蛋白质产物的结构和功能表2 常用的生物学数据库和...
更深入地思考单细胞测序的原理 | 单细胞测序(系列二)
未来的发展趋势倾向于时空多组学技术，强调基于单细胞测序的核心能力，以实现全面的生物学问题研究。阅尔基因提供包括多组学科研服务，旨在协助研究者完成从问题提出到高水平文章发表的全流程服务，涵盖生物学意义挖掘、实验设计、生信分析、数据整合等。有兴趣合作的研究者可通过公众号后台留言联系我们。
医学课题题目参考
2、收集和整理资料：在确定了研究问题后，需要收集相关的文献资料和数据，并进行整理和分析。可以通过图书馆、数据库、网络等途径获取所需的资料，同时要注意筛选和评估资料的可靠性和适用性。3、制定研究计划：根据研究问题和目标，制定详细的研究计划，包括研究方法、实验设计、数据采集和分析等方面的内容...
奥维森科技:多组学技术助力研究新型杀线虫剂对松材的保护作用机理!_百度...
通过多组学技术，他们发现chiricanine A通过抑制曲霉和ST的合成，减少ROS积累，从而抑制松材线虫（PWN）的致病性，并影响寄主松树（Pinus massoniana）吸引媒介昆虫JPS的能力。实验设计中，研究者通过宏基因组测序和代谢组学分析，发现ST通过调节基因表达，影响ROS生成和挥发性有机化合物（VOC）的积累。高浓度...
PNAS近红外研究:跨感觉通道可塑性促进人工耳蜗的移植效果
此微信公众号致力于科普fMRI,结构像,白质高信号分析,PET,DTI,QSM,ASL,BOLD-CVR,影像组学,菌群,EEG\/ERP,FNIRS,眼动等相关知识,欢迎大家学习交流讨论。 英国国立卫生研究所诺丁汉生物医学研究中心的Carly A. Anderson 等人在《美国国家科学院院刊》 (PNAS)上发表了一项研究,发现跨感觉通道可塑性促进人工耳蜗的移植...
简述组学技术在中药资源研究中的应用意义
完整的植物代谢组学研究流程包括实验设计、样品采集、样品处理、样品制备、检测分析、数据处理、代谢途径分析或代谢网络分析等。目前在检测技术方面，主要是基于核磁共振，液质联用以及气质联用 等高灵敏、高通量、高分辨率的分析平台对样品进行检测，从而得到海量数据。植物在生长发育过程中产生数以万计的小...
两因素混合实验设计的基本特点有哪些
有学 生不熟悉的（a1）和学生熟悉的（a2）.这 是一个2×3两因素混合设计。 8名五年级学生被随机分为两组，一组学 生每人阅读三篇生字密度不同的、主题熟 悉的文章，另一组学生每人阅读三篇生字 密度不同、主题不熟悉的文章。实验实施 时，阅读三篇文章分三次进行，...
持家蛋白的名词解释?
蛋白质组学技术服务认准北京青莲百奥，相对定量高度准确，适用各类复杂的实验设计。质谱联盟，为广大客户提供适合的科学研究整体解决方案，助力科研新发现。qinglianbio.com广告 蛋白组学价格找吉凯基因，临床样本处理专家，蛋白组学平台 值得一看的蛋白组学相关信息推荐 人源全蛋白组学价格筛选相互作用蛋白...
生物技术信息技术
尽管生物技术和信息技术在表面看来可能各有侧重，但在新经济的背景下，二者并非相互排斥。事实上，它们相互支持，共同驱动着21世纪经济的快速发展。生物技术的进步，如基因编辑技术，为信息技术提供了新的研究材料和应用场景；而信息技术的发达，如大数据和云计算，又为生物技术的实验设计和数据分析提供了强大...
全转录组的测序和芯片技术
对于初学者或在实验设计上寻求深入的学者，全转录组的测序是一个未被充分挖掘的领域。虽然多组学研究已经广泛应用于癌症等领域的差异分析，但对全转录组的单样本测序，包括非编码基因，仍需专业技能和深度理解。如果你希望在这个领域有所突破，可能需要深入文献调研并寻求专业的生信服务来协助你的测序和数据...
尉莺通窍： 概念 蛋白质组学(Proteomics)一词,源于蛋白质(protein)与 基因组学(genomics)两个词的组合,意指“一种基因组所表达的全套蛋白质”,即包括一种细胞乃至一种生物所表达的全部蛋白质.蛋白质组本质上指的是在大规模水平上研究蛋...
官渡区14713854833： 蛋白质组学常用的研究方法？
尉莺通窍： 酵母双杂交系统、抗体芯片、LCM技术、mic Solution Inc、SPR技术、色谱分离技术、双相电泳技术、有机质谱等等. LCM技术获得的细胞可以用于蛋白质样品的制备. 蛋白质样品中的不同类型的蛋白质可以通过二维电泳进行分离. 胶染色后...
官渡区14713854833： 蛋白质组学主要包括哪些分析技术及各自特点 - ？
尉莺通窍： 双向凝胶电泳的原理是第一向基于蛋白质的等电点不同用等电聚焦分离,第二向则按分子量的不同用SDS-PAGE分离,把复杂蛋白混合物中的蛋白质在二维平面上分开.由于双向电泳技术在蛋白质组与医学研究中所处的重要位置,它可用于蛋...
官渡区14713854833： 蛋白质组的研究内容 - ？
尉莺通窍： 蛋白质组学是系统生物学的重要研究方法.李赫25vL熂 | 发布于2016-05-27 07:11 评论
官渡区14713854833： 什么是蛋白质组学? - ？
尉莺通窍： 这个概念最早是在1995年提出的,它在本质上指的是在大规模水平上研究蛋白质的特征,包括蛋白质的表达水平,翻译后的修饰,蛋白与蛋白相互作用等,由此获得蛋白质水平上的关于疾病发生,细胞代谢等过程的整体而全面的认识. 目前,...
官渡区14713854833： 关于蛋白质组学检测结果分析求助 - ？
尉莺通窍： 1.蛋白质鉴定:可以利用一维电泳和二维电泳并结合Western等技术,利用蛋白质芯片和抗体芯片及免疫共沉淀等技术对蛋白质进行鉴定研究.2.翻译后修饰:很多mRNA表达产生的蛋白质要经历翻译后修饰如磷酸化,糖基化,酶原激活等.翻译...
官渡区14713854833： 下表是林蛙受精卵在不同温度下发育成成蛙的性别情况.为验证温度只影响林蛙的性别,而不影响其性染色体,设计了如下实验:受精卵的性染色体组成 个体... - ？
尉莺通窍：[答案] 从表中可看出,在20℃下受精卵的性染色体组成为XX的个体,成蛙表现为雌性,受精卵的性染色体组成为XY的个体,成蛙... 可以避免偶然因素影响实验结果,从而保证实验结果更精确. (5)染色体是由DNA和蛋白质组成的,是细胞内容易被碱性染...
官渡区14713854833： 设计一个简单的实验方案,验证组成染色体的成分有DNA和蛋白质. - ？
尉莺通窍： 2、稀释的蛋清水溶液 染色体提取液 DNA提取液 3、双缩脲试剂 二苯胺试剂 (4)、变为紫色 蛋白质 变为蓝色 染色体中含有DNA 第二步,1号试管加入染色体提取液,2号试管加入等量DNA溶液 第三步,向两个试管中加入等量双缩脲试剂,水浴 第四步,比较两试管颜色变化.3、若1号管出现紫色 都出现紫色
官渡区14713854833： 设计实验证明蛋白质结构与功能的关系 - ？
尉莺通窍： 蛋白质是功能性大分子.每一种蛋白质都有特定的一级结构和空间结构,这些特定的结构是蛋白质行使蛋白质功能的物质基础,蛋白质的各种功能又是其结构的表现.蛋白质的任何功能都是通过其肽链上各种氨基酸残基的不同功能基团来实现的...
官渡区14713854833： 按分子识别元件来分类,生物传感器怎样分类 - ？
尉莺通窍： 生物特异分子识别包含2方面的含义,一是DNA即基因方面的识别,而是蛋白质方面的识别.在医学检验方面的应用主要有:1. 分子生物传感器在医学检验中的应用2. 3. 分子生物传感器是利用一定的生物或化学的固定技术,将生物识别元件(酶...
