PCR产物克隆的方法和优缺点

作者&投稿:晏米 (若有异议请与网页底部的电邮联系)
如何提高PCR产物克隆的效率~

【TA 克隆的优缺点】
1、优点:
(1)是目前克隆 PCR 产物最简便、快捷的方法。
(2)不需使用含限制酶序列的引物,不需将 PCR 产物进行优化,不需把 PCR 产物做平端处理,不需在 PCR 扩增产物上加接头,即可直接进行克隆。
(3)TA克隆选择灵活,如果一个位点不好使用,同一批质粒还可以用其他酶再切,随时可以扩增。
(4)方便下游作业,比如说要连接两端PCR产物,先克隆会比较方便一些。
2、缺点:
(1)PCR产物的酶切和判断比较困难。
(2)另外酶切连接过程本身也相当地费时费力。
【TA 克隆】TA 克隆方法( Original TA Cloning Kit )即利用 Taq 聚合酶同时具有的末端连接酶的功能,在每条 PCR 扩增产物的 3` 端自动添加一个 3`-A 突出端。利用 TaKaRa 的 T 载体,直接高效地连接 PCR 产物。随着基因组计划的进行,以及分子生物学技术、基因芯片技术在生命科学研究、生物工程和医学等领域的应用,对 TA 载体的需求量会逐步扩大。

一、缺点:
1、PCR产物的酶切和判断比较困难。
2、另外酶切连接过程本身也相当地费时费力。
二、优点:
1、克隆PCR产物较简便、快捷的方法。
2、不需使用含限制酶序列的引物,不需将 PCR 产物进行优化,不需把PCR产物做平端处理,不需在 PCR 扩增产物上加接头,即可直接进行克隆。

扩展资料:
T-A克隆由于在PCR过程中,使用的DNA聚合酶不同,往往分为2种情况:
1、使用高保真的DNA聚合酶,如pfu酶,由于其不能在扩增产物的3末端加上A,得到的DNA序列为钝端,因此,需要在回收纯化后进行加A的过程,通常是以PCR回收产物为模板,加上一定量的普通Taq酶和反应液,加入dATP(或dNTP), 72℃ 10分钟,然后将加A产物直接用于TA连接。
2、使用不同的Taq酶,在PCR扩增循环结束后,加上72℃ 10分钟一个过程,Taq酶可以在扩增产物的3末端加上A,因此PCR产物回收纯化后可以和T载体直接连接。
参考资料来源:百度百科-T-A克隆

我来回答一下吧:
1.T/A cloning
这种克隆方式利用的是,一般PCR所用的DNA聚合酶具有在PCR产物3‘端添加一个碱基A的特性,也就是说,实际上常规PCR的产物并不是平末端的,而是有一个突出的A碱基,为了对PCR产物进行高效的克隆,人们开发出了一种专门用于PCR产物克隆的载体--T载体,T载体是一个线性化的载体,其末端是一个突出的T,正好与PCR产物上突出的A配对,所谓的T/A克隆就是将带有突出A尾巴的PCR产物与T载体连接,然后转化宿主菌的克隆,这种克隆效率非常高,很容易成功,应用也非常广泛,常用于下游克隆操作前的PCR产物测序鉴定和方便对PCR产物进行酶切处理。

2.Restriction stick end cloning
翻译过来就是限制性粘末端克隆,就是在PCR扩增引物的设计过程中,在引物中添加特定的酶切位点,这样经过PCR扩增后,得到的片段两端就带有需要的限制性酶切位点,对PCR产物进行酶切后,就可以直接与目的载体进行连接,实现克隆。这种方式省略了T/A克隆,一步到位,但是由于酶切位点位于片段末端,常常导致酶切效率较低,需要较长时间,必须设计好保护碱基。

3.Blunt-end cloning
所谓的平末端克隆,就是用Klenow片段将PCR产物末端突出的A碱基补平,然后与带有平末端的载体进行平末端克隆,平末端克隆效率很低,这种方式一般应用的很少,只是当PCR扩增所用的酶是高保真聚合酶如Pfu时,因为这种酶不会再PCR产物末端添加额外的碱基,PCR产物为平末端的,这时可能会用到平末端克隆,其实对这种PCR产物进行一个加尾处理,再进行T/A克隆,可能更加简单一些,呵呵。


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