如何配置超级计算机

作者&投稿:英娇 (若有异议请与网页底部的电邮联系)
超级计算机是如何配置的~

超级计算机就是指国家指挥中心的那种计算机,并不是家庭的顶级配置计算机!~

今天咱们来看看天河2号超级计算机怎么搭出来的。

天河二号由国防科技大学和浪潮合作研制,2013年至2014年蝉联全球超级计算机第一名。不过性能是拿钱堆出来的,造价25亿人民币,一天满负荷运转要耗电费40万元。看看下面的配置就知道为什么花这么多钱了。从这么多CPU看得出来,CPU厂商是多么喜欢超级计算机。不过美国政府对中国禁运高端CPU之后,Intel的销售估计都要哭死了。

怎么从一个个芯片组装成一台超级计算机?看下图。16000个计算节点,其实就是主板,汇集成32个Frame,再组成4个Rack,最后组成了超算系统。

超级计算机的基础节点包括三种:16000个计算节点,4096个管理节点,256个IO节点和64个存储服务器。
先看看最小的组件:计算节点。2 个Intel Ivy Bridge CPU + 3个 Intel Xeon Phi 。CPU之间用QPI总线互联,一般NUMA架构是这么做的。每个CPU有自己的DIMM内存,一共64GB。还通过PCIex16连到内部高速互联网络,GDDR5内存。GDDR5内存有一个专门的CPU管理。两个万兆网卡估计是管理用的。这样一个节点计算性能最高可以到3.432Tflops,

计算节点物理上坐落于计算刀片服务器。如下图,蓝色的是Xeon Phi处理器,黑色的估计就是Ivy Bridge CPU,所以一个刀片服务器包含了两个节点。

再来看看用国产飞腾CPU搭建的管理节点,性能是144GFlops。飞腾CPU是国防科大研制的,目前有几种型号,天河2号采用的FT-1500基于 Sparc V9架构。为了便于商业化推广,飞腾还推出了兼容ARM64位指令集的FT-1500A系列。FT-1500A目前包括4核和16核两款产品。其中4核处理器芯片主要面向桌面终端和轻量级服务器应用领域,面向服务器应用领域的是16核处理器芯片。据称,FT-1500A系列处理器与Intel 2010年的处理器性能相当 。

来看看这颗基于Sparc架构的FT-1500架构。采用40nm工艺,1.8GHz,16核,功耗约65瓦。计算架构采用了SIMD(Single Instruction Multiple Data),一条指令可以同步让多组数据执行。如下图,一个CPU有四个DDR3接口,IO带宽很高。

天河2号有256个IO节点和64个存储服务器,总共存储容量12.4PB。既然是超级计算机,自然要使用高性能的固态硬盘SSD,每个IO节点有2TB的SSD,IO带宽达到5GB/s,从下图可以看出1个2TB SSD由5个400GB 小SSD组成,那估计每个的带宽是1GB/s。IO节点对外有两种接口:高速互联接口和Infiniband QDR存储网络接口。阿呆猜想高速互联网络是用来输出数据给计算节点,IB接口是IO节点之间数据共享用的。采用了Hybrid hierarchy file system,H2FS,数据保存在每个节点本地,但是相互之间也能共享。

这么多节点怎么组成超级计算机呢?下面就是组网图。关键的设备是中间的13个交换机,每个交换机有576个端口!

更加难能可贵的是,高速互联芯片都是纯国产。包括网络路由芯片NRC和网络接口芯片NIC。
NRC采用90nm工艺,大小为17.16mm*17.16mm,2577个管脚,带宽为2.56 Tbps。这么多管脚估计也是为了增加端口数。
NIC也是90nm工艺,大小10.75mm*10.76mm,675个管脚。
说到超算,就不得不提制冷系统,这么一台庞大的机器,没有有效的制冷,估计就着火了。天河2号采用了紧耦合水冷系统,整台机器功耗17.6MW,加上制冷系统就是24MW。制冷用了27%的电。
天河有自己的软件架构,如下图。对用户来说,最重要的是用户的编程接口,有些用户为了搞个研究,写这个程序就得花上几年。很多时候政府推动的项目硬件给很多经费,设备都很不错,但是领导舍不得给软件投钱,毕竟展示效果没那么壮观,所以软件往往是短板,用户使用不便,先进设备的利用率就不高。
天河支持下列编程语言。值得一提的是OpenMC语言,比CUDA和OpenCL的抽象级别更高,在CPU等各种资源之上有一个统一的逻辑层。各种计算任务异步执行,同时分配到不同的设备上。
对管理者来说,这么多节点的资源调度和监控也是很重要的。如下图,每台机器安装了国产麒麟Linux操作系统,其实也是国防科大主导的。
我们搞存储的最关心的就是存储软件架构了。数据分为本地存储和共享存储,共享存储使用了超算流行的Lustre分布式文件系统,这种文件系统对于大文件访问性能不错。用户使用POSIX接口读写文件。不过数据密集型应用用Layout接口和Policy接口访问数据。
总结一下,一台超级计算机其实就是很多小计算机的集合,当然难点在大家的高速互联和同步。

把各种部件连成一台完整的超级电脑的方法如下:
1.首先要确定硬件部件和所需要的资源
需要一个头节点(head node),至少一打的计算节点(compute node),一台以太网交换机,一个电源分配单元(power distribution unit)和一个服务器机架。计算一下电力消耗,冷却需求和占地需求。同样,你需要确定你的私有网络的IP地址段,节点的命名,预计使用的软件包以及搭建 服务集群所用的技术(后面会有更多解释)。
2.建立计算节点
需要自己组装计算节点,或者你也可以使用预配置的服务器。
●选择一款能够最大化空间、冷却和能源消耗效率的机架式服务器;
●或者,可以使用一打左右闲置的过时服务器——它们集合在一起工作的性能要比它们独立运行时的总和还多,而且还能省你一大笔钱!整个系统的处理器、网络适配器、主板应该是同一型号的,这样才能达到最佳运行效能。当然了,还要给每个节点配内存和硬盘,并且至少给头节点配一台光驱。
3.将服务器装在机架上
安装的时候从下面开始,这样可以避免机架头重脚轻。你可能会需要朋友的帮助才能完成这件事——这么多的服务器将非常的重,把它们放到机架的滑轨上会非常困难。
4.在机架顶端安装以太网交换机
现在来配置交换机:允许9000字节的大的帧,将IP地址设置为你在第一步里面确定的静态地址,关闭例如SMTP嗅探这样不必要的路由协议。
5.安装能源分配单元
根据目前你的节点的最大需求,可能220V就能满足你的高性能计算需求了。
6. 一切都安装妥当之后,就可以开始配置环节了
Linux是高性能计算集群(HPC Cluster)操作系统的事实标准,这不仅因为Linux是科学计算的理想环境,也是由于在数以百计甚至千计的节点上安装的时候,Linux不会产生任何花费。设想一下,在如此多的节点上安装Windows会花掉你多少钱呢?
●从更新主板BIOS的固件开始,将所有节点的BIOS固件都更新至最新的版本;
●在每个节点上都安装好你喜欢的Linux发行版,头节点需要安装队图形界面的支持。比较流行的选择,包括CentOS、OpenSuse、Scientific Linux、RedHat以及SLES;
●使用Rocks Cluster Distribution来搭建计算集群。除了它已经安装好计算集群需要使用的所有工具外,Rock还提供了一种通过PXE和RedHat的“Kick Start”来进行批量部署的方案。
7. 安装消息传送界面、资源管理器以及其他必须的库
如果上一步里你没有选择Rock做为你的节点的操作系统,那么现在你需要手动设置并行计算机制所必需的软件。
●首先,你需要一个便携的bash管理系统,例如Torque Resource Manager,这些软件允许你划分以及分配计算任务;
●如果安装了Torque Resource Manager,那么你还需要Maui Cluster Scheduler来完成设置;
●其次,需要安装消息传送界面(message passing interface),用来在不同的计算节点的进程之间共享数据。
最后,不要忘了用多线程的数学库及编译器来编写计算任务。
8.将所有的计算节点接入网络
头节点负责将任务分配到计算节点,计算节点再把结果返回回来,节点间的消息传递也是如此,所以当然是越快越好了。
●使用私有网络将集群中的所有节点互联起来;
●头节点其实还充当局域网里的NFS、PXE、DHCP以及NTP服务器;
●将该网络从公网中分离出来,这样可以保证该网络中的广播报文不会影响到其他的网络;
9.对集群进行测试
在你把你强大的Top500计算集群交付给客户之前,你还要测试一下它的性能。HPL(High Performance Lynpack)评测软件包是测试集群的计算速度的常见选择。你需要从源代码编译它,编译的时候根据你选择的架构,打开所有可能的优化选项。

超级计算机的标准是CPU处理速度,其它硬件都一般,它是由多个CPU同时工作组成的,完全不适合个人用户使用,就算你钱多到没地方用,买回来也只是台废铁...国外也有人用1000M交换机+家用电脑配过一台很便宜的超级电脑,当时是以100美元的价格买1GHz的速度,总体速度好像是20GHz左右

超级计算机就是指国家指挥中心的那种计算机,并不是家庭的顶级配置计算机!~

这个东西估计就复杂多了吧,一般人肯定不了解的.
据说处理器核心就十几万个,你要设计对应的主板和系统来配置这些核心,如何一共工作,另外输入输出的控制方式,都是需要单独设计.普通人估计很少有人知道.

超级计算机 只是指的运算速度,不要被误解


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