转录组研究技术主要有

作者&投稿:计薇 (若有异议请与网页底部的电邮联系)
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转录组研究技术主要有的如下:

1、表达序列标签技术:

通过PCR方法检测细胞在特定生理条件下表达的基因。

2、全长转录组测序技术:

能够检测细胞中所有基因的表达情况。

3、表达量分析技术:

主要用于定量分析基因的表达水平,其中qPCR是一种常用的技术。

4、序列比对法:

利用同源序列比对参考基因组上已知的基因的CDS序列来鉴定特定物种的基因。

5、差异表达分析:

通过RT-PCR、qPCR等方法比较两个样本组之间某一特定基因的表达差异。

6、RNA-Seq:

通过高通量测序技术,反映RNA的表达水平。

7、基因表达系列分析技术:

是一种高通量、大规模的基因表达分析技术。

8、微阵列技术:

用于大规模基因组表达谱研究、快速检测基因差异表达。

转录组简介与分类:

转录组简介:

广义上指某一生理条件下,细胞内所有转录产物的集合,包括信使RNA、核糖体RNA、转运RNA及非编码RNA;狭义上指所有mRNA的集合。在整体水平上研究细胞中基因转录情况及转录调控规律的学科。从RNA水平研究基因表达情况,特定的细胞、个体、组织在特定状态下转录出所有RNA。

不同生长发育时期不同。与基因组学区别,转录组是在特定的时间特定组织状态下转录出来的,不同的时间状态转录出来的RNA是不同的。转录组学是分子生物学的分支,负责研究在单个细胞,或特定类型的细胞,组织,器官或发育阶段的细胞群内所生产的各类RNA分子的类型和数量。

分类:

真核有参有基因组序列或注释信息可以查询:LncRNA CircRNA (lnc和circ需要参考基因组比对 SmallRNA 全转录组真核无参:SmallRNA原核转录组(需要参考基因组)判断是否有参考基因组,可以在各大数据库里查找,比如NCBI。




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怀化市17693261561: 提取的c级rna,od 260/280的比值均大于2,做转录组测序时有影响吗 -
旗向人参: 1、提取RNA测浓度时A260/A280大于3的原因可能是降解.2、一般对于DNA,纯净的时候比值是1.8,而对于RNA则是接近2.0.如果超过这个值,那么最有可能的就是核酸降解了,因为寡聚的核酸和核苷酸在260的吸收峰比长链核苷酸要大,所以会使比值上升.

怀化市17693261561: 我要做转录组测序和功能蛋白的基因,有什么好书或者建议 -
旗向人参: 组学omics,研究的是整体.按照分析目标不同主要分为基因组学,转录组学,蛋白质组学,代谢组学.基因组学研究的主要是基因组DNA,使用方法目前以二代测序为主,将基因组拆成小片段后再用生物信息学算法进行迭代组装.当然这仅仅是第一步,随后还有繁琐的.

怀化市17693261561: 转录组测序和RNA - seq的区别是什么 -
旗向人参: 转录组测序和RNA-seq是一样的,他们的关系如下: 1. 转录组测序的方法很多,而RNA-seq是当前转录组测序的一种测序方法,又称为二代测序,包括454,solexa等. 2. RNA-seq即转录组测序技术,就是把mRNA,smallRNA,and NONcoding ...

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