GSTP1是什么?

作者&投稿:邰舍 (若有异议请与网页底部的电邮联系)
基因启动子甲基化变化的分子诊断毕业论文怎么写~

一种全新的DNA甲基化研究方法——Pyrosequencing技术
DNA甲基化是一种表观遗传修饰,它是由DNA甲基转移酶(DNA methyl-transferase,Dnmt)催化S-腺苷甲硫氨酸作为甲基供体,将胞嘧啶转变为5-甲基胞嘧啶(mC)的一种反应,在真核生物DNA中,5-甲基胞嘧啶是唯一存在的化学性修饰碱基.CG二核苷酸是最主要的甲基化位点,它在基因组中呈不均匀分布,存在高甲基化、低甲基化和非甲基化的区域,在哺乳动物中mC约占C总量的2-7%.一般说来,DNA的甲基化会抑制基因的表达.DNA的甲基化对维持染色体的结构、X染色体的失活、基因印记和肿瘤的发生发展都起重要的作用.
CpG双核苷酸在人类基因组中的分布很不均一,而在基因组的某些区段,CpG保持或高于正常概率,这些区段被称作CpG岛.CpG岛主要位于基因的启动子和第一外显子区域,约有60%以上基因的启动子含有CpG岛.CpG甲基化的研究在肿瘤的研究中有着非常主要的地位.通过基因启动子区及附近区域CpG岛胞嘧啶的甲基化可以在转录水平调节基因的表达,从而引起相应基因沉默,去甲基化又可恢复其表达.DNA甲基化在生理情况下就参与了控制基因的时空表达,在肿瘤发生时,肿瘤细胞全基因组低甲基化是一个重要特征.肿瘤细胞基因组甲基化的程度与正常细胞相比仅为20-60% ,同时伴有局部区域基因的高甲基化,包括肿瘤抑制基因、抑制肿瘤转移和浸润的基因、细胞周期调节基因、DNA修复基因、血管形成抑制基因等.但是目前研究手段的局限,限制了DNA甲基化的广泛研究.
近年来,研究者不断探索定性及定量检测单个或多个甲基化位点的方法,但由于甲基化多态性区域存在的密度很高,所以对于延伸反应其引物的位置很难设计.Pyrosequencing技术作为一种新的序列分析技术,能够快速地检测甲基化的频率,对样品中的甲基化位点进行定性及定量检测,为甲基化研究提供了新的途径.
从原理上来看,Pyrosequencing是一种通过合成方法进行序列分析的方法,它通过核苷酸和模板结合后释放的焦磷酸引发酶级联反应,促使荧光素发光并进行检测.这项技术曾经被用作单核苷酸多态性(SNP)的基因型和单倍型的检测,以及细菌和病毒的鉴定和分型研究.这项技术的一个主要特点是在Pyrogarm™软件上显示的峰值高度来自于序列分析的原始数据,通过峰值的高度可以精确的检测混合DNA模板中等位基因的频率.
目前甲基化研究方面,很多甲基化定量分析的报道采用亚硫酸氢盐处理甲基化样本,并用混合的PCR产物
作为校正.其主要原理是:亚硫酸氢盐可以将没有甲基化的胞嘧啶转化为尿嘧啶,而在适当的实验条件下甲基化的胞嘧啶保持不变.因而,用它处理样本后,再进行PCR扩增,甲基化的位点可以被当作一个C/T的SNP来处理,它的基因频率为0-100%.在此,我们给大家介绍一个研究人员使用Pyrosequencing技术分析并精确定量DNA甲基化水平的例子.
研究者在一个Pyrosequencing反应中同时检测了6个甲基化位点.这种方法同样可以用于石蜡包埋的组织,并且具有较高的重复性和精确性.实验选择谷胱甘肽-S-转移酶π(GSTP1)转录启动位点的CpG岛进行检测.这些位点在正常前列腺组织中是非甲基化的,而在肿瘤样本中高甲基化.通过PCR扩增一个包含17个甲基化多态位点140bp的片段,并用4个测序引物研究其中15个位点(Table 1).使用在线的SNP测序引物设计软件(Pyrosequencing AB)设计测序引物,其中一些甲基化多态性位点用最可能的碱基所代替,以减少计算的数量.再通过人工检测测序引物可能存在的错配.此外,同时在PSQ 96MA DNA分析仪上运行空白对照,扣除由测序引物、生物素标记的引物或是模板引起的背景.
PCR引物设计完全与模板相匹配,不覆盖任何甲基化多态性区域.使用10ng亚硫酸氢盐转化的DNA样本或是10 fmol纯化的PCR产物,10 pmol 正向(5’-GTGATTTAGTATTGG-3’)和反向(5’-biotin-AACTCTAAACCCCATC-3’)引物扩增GSTP1转录启动位点的基因片段,扩增片段长度为144bp.反应体系为60 mM Tris-SO4,pH 8.9,18 mM (NH4)2SO4,1 mM MgSO4,200 μM dNTPs,以及3 U Platinum Taq DNA高保真聚合酶,终体积为50μL.PCR循环设置:首先在95℃下变性4分钟,然后在95℃ 30S,50℃ 45S以及72℃ 20S条件下重复50个循环,最后一步延伸步骤在72℃下4分钟,中止反应.PCR反应在Eppendorf的Mastercycler 96
哺乳动物基因组中,DNA甲基化是指CpG二核苷酸中的胞嘧啶第5位碳原

妊娠妇女的先兆子痫可能与父闲有关荷兰鹿特丹Erasmus大学的研究人员发现,来自父亲的基因多态性可增加妊娠妇女的先兆子痫危险。该大学的Steegers等2004年8月在JMedGenet(2002,39:44)上发表了这项研究的结果。研究人员认为,父亲体内谷胱甘肽-硫(S)-转移酶P1(GSTP1)基因上的一个特定突变,在其女儿妊娠时的先兆子痫发病危险中起重要作用。以前曾有流行病学研究提示,妇女的先兆子痫易感性与来自父亲方面的影响有关。该研究第一次向人们证实,父亲的某一特定基因多态性和先兆子痫有关。Steegers等人的研究包括113个有先兆子痫史的家庭(包括父、母亲和子女)、317名健康男性及妇女对照(无先兆子痫史)。研究者在这些研究对象中寻找GSTP1基因突变,该特定的GSTP1基因异常导致GSTP1分子上第105个氨基酸位置上异亮氨酸取代缬氨酸(GSTP1,105Ile-Val多态性)。先兆子痫家庭中的GSTP1105Ile-Val多态性发生率显著高于对照人群。父亲携带的这种基因突变率与母亲相同,该突变使酶的解毒能力降低。越来越多的证据表明,毒性化合物和解毒物质之间关系失衡可以引起先兆子痫,该研究提供的证据进一步支持这一观点。研究者认为,该研究的意义在于进一步阐明了先兆子痫的病因。检测GSTP1基因突变有助于评估先兆子痫的易感性,并有可能给人们启示,促进人们去开发能够预防先兆子痫的好方法。

GSTP1:GSTs主要包括α、μ、π、θ等亚型,其中编码GSTπ的基因GSTP1定位于染色体1lq13,含有7个外显子和6个内含子,外显子5、6存在基因多态性。

其中外显子5第81位点发生A→G碱基替代,可导致蛋白质肽链第105位氨基酸由ATC异亮氨酸(Ile)变为GTC缬氨酸(Va1),记为GSTP1-I105V, GSTP1-I105V多态性。



扩展资料:

工作原理:

高效性:酶的催化效率比无机催化剂更高,使得反应速率更快;专一性:一种酶只能催化一种或一类底物,如蛋白酶只能催化蛋白质水解成多肽;多样性:酶的种类很多,大约有4000多种;温和性:是指酶所催化的化学反应一般是在较温和的条件下进行的。

一般来说,动物体内的酶最适温度在35到40摄氏度之间,植物体内的酶最适温度在40-50摄氏度之间;细菌和真菌体内的酶最适温度差别较大,有得酶最适温度可高达70摄氏度。动物体内的酶最适PH大多在6.5-8.0之间,但也有例外,如胃蛋白酶的最适PH为1.5,植物体内的酶最适PH大多在4.5-6.5之间。

酶的这些性质使细胞内错综复杂的物质代谢过程能有条不紊地进行,使物质代谢与正常的生理机能互相适应.若因遗传缺陷造成某个酶缺损,或其它原因造成酶的活性减弱,均可导致该酶催化的反应异常,使物质代谢紊乱,甚至发生疾病.因此酶与医学的关系十分密切。



Glutathione S-transferase (GST) 是谷胱甘肽巯基转移酶。是体内生物转化最重要的Ⅱ相代谢酶之一,是细胞抗损伤、抗癌变的主要解毒系统。
GSTP1:GSTs主要包括α、μ、π、θ等亚型,其中编码GSTπ的基因GSTP1定位于染色体1lq13,含有7个外显子和6个内含子,外显子5、6存在基因多态性,其中外显子5第81位点发生A→G碱基替代,可导致蛋白质肽链第105位氨基酸由ATC异亮氨酸(Ile)变为GTC缬氨酸(Va1),记为GSTP1-I105V, GSTP1-I105V多态性,可对应产生105Ile/Ile、105Ile/Val和105Val/Val三种基因型。GSTs基因多态性的存在可引起其表达的相应酶的活性不同,导致解毒功能发生改变,从而增加特定肿瘤发病风险。研究表明GSTP1不同基因型分布频率具有明显的种族、地域差异。


台达E310变频器上显示stp1是什么?
动,此时闪烁 STP1,必须先将运转开关关断,之后再导通,才可启动。

东元变频器出现stp1
STP1的故障代码是直接启动失败,1, 检查参数设置00-03=1,且直接启动功能无效。2, 04-09=1时,若电源投入时,运转开关放在导通的位置,变频器无法启动,此时闪烁STP1,这时可把这个参数改为等于0 修改时请参考使用说明书,

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图中ST为启动按钮,STP为停止按钮。ST1'STP1为第一地点的控制按钮,ST2'STP2为第二控制地点,ST3'STP3为第三控制按钮,实现多地点控制,原则是启动按钮要并联,停止按钮要串联,如果你只要两地控制,那么就把ST3'STP3去掉就行了!

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多生成树的命令,实例1主根,实例2从根

stp是什么格式文件 STP文件如何打开
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