基因测序，门水平结果写的Bacteroidota是拟杆菌门吗？
好奇心驱使我深入探究这个问题，让我们一起来揭开这个微生物分类学的谜团。根据国际微生物分类学委员会（ICSP）的权威定义，拟杆菌门被正式认定为Bacteroidetes，如同一个科学界的约定俗成。然而，Bacteroidota这个术语并非一帆风顺，它曾被标注为异形同意词，即Bacteroidetes的一种别名，但其有效发表的合法性一度受到质疑。
最初的发布源自Whitman等人在2018年的一篇论文中，他们提出在国际微生物命名规则中引入后缀“-ota”以区分不同的菌门。然而，Bacteroidota的诞生并非毫无波折，它未能满足ICSP对于分类命名的严格标准，因此一度被视为无效命名。这背后的原因可能涉及到命名规则的复杂性，以及对微生物分类体系的严谨要求。
不过，时间仿佛是一位公正的裁决者。在2022年4月3日的更新中，我们了解到Bacteroidota的命运有所转变。经过了一系列的分类学修正，这个名称终于在2021年获得了正式的合法地位，ICSP的影响力再次显现，成功推动了这一分类学命名的转变。
值得注意的是，尽管Bacteroidota这个名字在官方层面获得了认可，但在学术界和实际应用中，你可能会发现一些地方仍然沿用传统的Bacteroidetes。这反映出科学界的动态性和不断更新的过程，每一个命名的变动都反映出微生物学研究的前沿进展。
总的来说，Bacteroidota与拟杆菌门的关系就像一场科学的演变剧，从一个争议的异形词到一个合法的分类学名词，它见证了微生物学领域严谨与创新的交融。在基因测序的世界里，这些细微的分类学变化可能对我们的研究结果产生深远影响。
如何分析基因测序结果(测序结果,基因,序列,基
测序结果与NCBI gene blast～看有没有突变是不是100%匹配等～
【派森诺项目文章】多组学整合,Microbiome发表重磅肠—脑轴研究!_百度...
微生物组测序结果显示，PD小鼠肠道微生物组成与对照组有显著差异（P<0.05），而OCN处理后，PD小鼠的微生物群落结构恢复到对照组的水平。从门水平上的微生物类群来看，PD小鼠与对照组也有显著差异。与对照组相比，PD小鼠的 Bacteroidetes 、S24-7、 Rikenellaceae、Erysipelotrichaceae 相对丰度显著降低...
基因测序结果的图怎么看
1. 假设你测的是一个基因的序列，如果已知这个基因的序列，则将你测序得到的基因序列与已知的序列相比对，分析看两者在哪个地方不对应，不对应的地方即为突变的地方。比对的软件有sequencher，或者去NCBI网站点击BLAST进行。2. 如果你测的是一个以前未知的序列，那么要测几个不同的单克隆，将测得的结...
为什么不同基因测序公司,提供的分析结果大相径庭
不同流程，差异有时天上地下，不夸张。这个问题，同样困扰国外学者，比如23andme公司，和decodeme公司等，甚至对于疾病相关基因位点，差异也是非常大。这也是诺奖得主很困惑的地方。总之，以测序水平硬件的飞速提高，和分析方法的不断优化，总会有更平衡的解决方案出来的。这速度远远超过了摩尔定律。
用qPCR验证RNA-Seq挑多少个基因合适
做完RNA-Seq测序之后，往往会用QPCR来验证一下结果。因为RNA-Seq测序数据得到的结果作为定量参考，参数的改变也会造成结果的不同。所以需要进行qPCR验证，表达水平的结果最终以实时定量PCR为准。一般需要验证基因的数目：20个左右 在验证时，往往会出现RNA-Seq测序结果和QPCR结果不一致的情况，遇到此类情况，...
基因检测断层是什么意思?
在基因检测中，由于受到限制性条件的影响，通常会发生一些不完整或不准确的结果，这被称为“断层”。断层的出现可能意味着在目前的技术水平下，无法充分解析并描述某些个体的基因组信息。然而，即使存在一些断层，基因检测仍然是一种极其有价值的工具，可以为我们提供有关遗传因素的重要信息。随着科技的不断...
微生物可以分成哪“三行八大类”啊?详细点!谢谢啊!
例如在门与纲之间可设超纲(Superclass);在纲与目之间可设亚纲(Subdclass)、超目(Superorder);在目...b)按照生物系统发育相关性水平来分群归类,其目标是探寻各种生物之间的进化关系,建立反映生物系统发育的...生物之间基因组的差异,因此结果更加可信.(1) DNA的碱基组成(G+Cmol%)DNA碱基因组成是各种生物一个...
为什么不同基因测序公司提供的分析结果大相径庭?
其中大多数都是经过大量临床实验验证的，针对特定癌症、特定药物，其关联性是比较高的。在确定化疗方案之前先选择相关药物耐药基因进行筛查，可以有效提高化疗方案的成功概率。3. 通过采集母体血液进行胎儿染色体异常疾病（如唐氏综合症）无创筛查，准确率已经达到羊水穿刺等传统方法相同的水平。
测序相关知识总结
全基因组重测序是对基因组序列已知的个体进行基因组测序,并在个体或群体水平上进行差异性分析的方法。...转录组学(transcriptomics)是在基因组学后新兴的一门学科,即研究特定细胞在某一功能状态下所能转录出来...Scaffold N50可以作为基因组拼接的结果好坏的一个判断标准。 22.什么是测序深度和覆盖度? 测序深度是...
宏基因组差异微生物太多怎么办
比如宏基因组测序虽然分辨率高，但成本也高，普通科研人只能望而兴叹；扩增子测序技术成本低，相应的分辨率也一般，无法有效区分种水平的差异；花时间收集样本，结果发现存在“微量、降解”等质量问题，实验过程中样本还存在宿主污染，还怎么开展实验…那有没有一种既能提高检测分辨率，又可以节省成本的检测...
星往乳块： BAC是细菌人工染色体意思,之所以有BAC文库的出现,是因为基因组序列太长,测序,以及筛选基因等没有办法完成,所以将基因组片段随机打断成片段,连到载体上构建成一系列的重组子,这样当你需要特定的序列,只需要筛选出自己要...
云龙县17838243091： dna甲基化测序的数据怎么分析 - ？
星往乳块： bsp测序是dna甲基化检测的金标准.我想如果bsp能得到阳性结果,就没有必要再做msp了或其他了. 如果非得做msp,而且有连续的cpg区域,应该能看得出区别的,虽然u,m很可能都有条带.要得出漂亮结果,可能还得反复摸索条件.
云龙县17838243091： 根据基因测序结果如何区分基因型 - ？
星往乳块： 将你的测序结果与参考序列进行比对,当然前提你是知道你的参考序列的突变位置,如果你的参考序列上是A,而测出来的结果是T,那就是一个突变型,还有可能就是杂合突变.
云龙县17838243091： 目前结核分枝杆菌耐药性检测方法有哪些? ？
星往乳块： 目前临床正在使用和研究的耐药性检测方法归纳起来,有表型检 测和基因检测两大类.表型检测方法有常规药敏试验方法、BACTE- CTB-960放射性液体培养基法、噬菌体生物扩增法、荧光素酶信号噬菌 体法(LRP)、MTT法、流式细胞仪(FCM)测定法等.基因检测方法有 直接测序法(DS)、聚合酶链反应-单链构象多态性分析(PCR-SSCP)、 PCR-限制性片段长度多态性分析(PCR-RFLP)、双脱氧指纹图法 (ddF)、反向系列探针杂交法(AiPA)、异源双链形成法(HDF)、随机扩 增多态性DNA(RAPD)基因分型技术等.
云龙县17838243091： 帮忙看一下 我的基因检测报告单 看不懂啊 跪求... - ？
星往乳块： 患者信息:女44岁 陕西 咸阳 病情描述(发病时间、主要...
云龙县17838243091： 测序 两端 不准确？
星往乳块： 因为测序的时候荧光标记的ddNTP是过量的,反应结束后一并沉淀下来干扰了小分子量的引物后面几个核苷酸的信号. 至于后面一般800bp以上的区段也是不可信的,这也是目前测序公司技术优劣的一个指标,技术好的能读到1100bp,技术差的可能只有500bp.原因就在于用的分离胶好不好,因为分子量越大,同样相差1个核苷酸所造成的影响越小.21个bp的片段和22个bp的片段可以分的比较开,而801bp和802bp就几乎贴在一起了,越到后面贴的越紧,最后就连成一片分不清谁是谁了. 具体从哪里到哪里可信要看测序结果的信号峰.强烈的单峰才是有效的.
云龙县17838243091： 论文中基因测序出现问题算造假吗 - ？
星往乳块： 基因测序出现问题分两方面,一方面是测序的正确率,另一方面是测序的错误.对于正确率如果要求很高可以测两次,可以保证序列的正确,如果是测序出现了问题,那么结果是错误的,是不应该出现在论文中的.
云龙县17838243091： 基因测序长读长,短读长 什么意思 - ？
星往乳块： 就是指测序过程一次测序的长度,短读长就是指一次测序的长度比较短
云龙县17838243091： 全基因组测序的研究结果 - ？
星往乳块： 这个可从佳学基因的不同项目的描术中找到答案.佳学基因的铂金至尊因解码采用全基因组测序,而肿瘤风险评估最初的版本是采用snp芯片法.按照佳学基因解的描述.全基因组测序,测的是全部序列,可以发现别人没有、您个人独有的基因序列变化.而芯片只能检测已知的变化,而且只能是有限的基因序列.尽客snp芯片法检测成本低,便获得的信息的完整性同全基因组测序相比差很远.如果您要做罕见疾病的病因查找或者是肿瘤发病原因的查找,应当选择佳学基因基于全基因组测序的铂金至尊基因解码基因检测.
