如何对大量基因的启动子元件进行分析

作者&投稿:偶熊 (若有异议请与网页底部的电邮联系)
如何分析基因启动子的~

一般都是通过serial deletion这个办法的。 分为以下几个步骤: 克隆目的基因上游数千碱基对的DNA序列 把序列插入到一个表达载体的启动子位置。转染细胞后,测表达产物的表达量 逐渐缩短插入序列的长度

1。启动子是位于结构基因5ˊ端上游的一段DNA序列,能够指导RNA聚合酶同模板正确结合,活化RNA聚合酶,启动基因转录。
2。35s启动子,是花椰菜病毒的启动子,是一种强启动子,被广泛应用于转基因植物中,对它进行改造的许多启动子可以有效提高外源基因的表达水平。同时对该启动子的一些元件进行串联,也可以有效提高外源基因的表达水平。
3。35s启动子包括TATA盒子、CAAT盒子、反向重复序列和增强子核心序列四个部分。

在基因组中先把你那个基因找出来,看看是在什么位置,然后拿到这个基因的上游区序列(1kb~5kb),这个范围自己定,然后(1)启动子数据库中去找(2)把这部分序列拿去做启动子预测,或者是你有motif的话就更好,预测的时候加进去

祝你好运


什么是“人类基因组”计划,你对生物“克隆”技术有何看法
简单的说一下.人类基因组计划是于1990年正式启动,其主要目标是计划拨款30亿美元,用15年(1990--2005)时间完成人类基因组30bp全部序列的测定,而且要在2001年完成全部染色体的“工作草图”。该计划是堪与阿波罗登月计划和曼哈顿原子计划惊世壮举,是当代生命科学中的一项伟大的科学工程。关于生物克隆技术...

基因是否含启动子
启动子实际上是一些转录酶的结合位点以及转录调控因子的靶位点,当基因转录时,转录酶识别结构基因上游的识别位点,与双链结合,并解旋,并开始DNA-RNA配对。形成的初始mRNA上可能有一段结构基因前的序列,经过mRNA的成熟过程剪切后形成只含表达基因的mRNA。

向分子生物学的大神求解
操纵子的调控机理是:当在培养基中只有乳糖时由于乳糖是lac操纵子的诱导物,它可以结合在阻遏蛋白的变构位点上,使构象发生改变,破坏了阻遏蛋白与操纵基因的亲和力,不能与操纵基因结合,于是RNA聚合酶结合于启动子,并顺利地通过操纵基因,进行结构基因的转录,产生大量分解乳糖的酶,这就是当大肠杆菌的...

基因工程中的启动子和Ori之间的关系和概念区分
根据基因工程的方向而定,在比如基因疗程、蛋白质、荷尔蒙(如胰岛素)的生产方面,启动子可以让宿主细胞(host cell)的RNA聚合酶把基因对应的多肽链转录出来。在生成DNA库时或者需要让宿主细胞大量分裂,形成大量的相同基因时,那么Ori可以让重组DNA 复制,形成很多很多的一模一样的重组DNA。还有疑问欢迎...

原核生物的基因表达过程必须依赖启动子的调节作用。对吗?
正确。启动子是位于基因序列上游的特定DNA序列,包括调控元件,如启动子结合位点和调控序列,可以被转录因子识别和结合,定位到基因的起始点,从而确定基因的转录起始位点。

基因组、功能基因组、人类基因组计划有什么区别?
后来进一步发现了基因的语言即遗传密码设想ATGC。以孟德尔学说为开端的遗传理论发展到以DNA分子结构为基础的分子遗传学,使我们对遗传规律有了确切了解,但是目前,基因理论仍存在许多复杂情况。 (2)。人类基因组计划 1.启动:1986年,提出人类基因组计划——测出人类全套基因组的DNA碱基序列 1900年,美国国会批准“人类...

6.解释σ因子是怎样选择专一性启动子共有序列而启动不同基因表达的(考...
【答案】:6.σ因子对不同基因的启动子同源序列有特异选择性。不同的σ因子与核心酶结合形成不同的全酶,启动相应基因表达。如果一些σ因子不是组成型而是受环境或发育信号所诱导的,则细胞会表现出差异的基因表达。在形成内生孢子的细菌中孢子形成的调节就是一个极好的例子。

启动子对基因有没有专一性
启动子对基因没有专一性。启动子对基因没有专一性,同一增强子可以影响不同类型启动子的转录。例如当含有增强子的病毒基因组整合入宿主细胞基因组时,可能够增强整合区附近宿主某些基因的转录。当增强子随某些染色体段落移位时,也能提高移到的新位置周围基因的转录。

基因工程应用的笔记
操作过程大致归纳为:获取目的基因(例如血清白蛋白基因)→构建基因表达载体(在血清白蛋白基因前加特异表达的启动子)→显微注射导入哺乳动物受精卵中→形成胚胎→将胚胎送入母体动物→发育成转基因动物(只有在产下的雌性个体中,转入的基因才能表达)。关于工程菌的学习,也可结合基因工程操作程序,予以...

高中生物选修3复习内容。
因为目的基因在表达载体中得到表达并发挥作用,还需要有其他控制元件,如启动子、终止子和标记基因等。必须构建上述元件的主要理由是:(1) 生物之间进行基因交流,只有使用受体生物自身基因的启动子才能比较有利于基因的表达;(2) 通过cDNA文库获得的目的基因没有启动子,只将编码序列导入受体生物中无法转录;(3) 目的基因...

名山县13976671769: 基因启动子的GUS分析 -
资肥阿昔:[答案] 可以将你要研究的基因启动子与GUS基因融合构建载体,转烟草、拟南芥等作物进行报道基因的时空表达分析.

名山县13976671769: 如何分析扩增的基因含有启动子和信号台序列 -
资肥阿昔: 将扩增得到的基因进行测序,得知序列信息后,进行如下操作: 1. 如果这个基因的来源物种已经完成了全基因组测序,那么恭喜你,你只需进入NCBI网站,把自己得到的序列与网站数据库中该物种的序列进行BLAST,就会得知这个基因的全部信息,包括外显子、内含子等等; 2.如果没有,仍然进入上述网站,将自己的序列进行BLAST分析,找到其它物种中与之同源的基因,参照那个基因进行分析; 3.还有一种不保险的方法,就是利用启动子预测软件、蛋白分析软件进行分析,因为毕竟是软件,所以有时候分析结果是错的,有时候是对的.

名山县13976671769: 怎样寻找基因启动子区? -
资肥阿昔: 基因启动子位于基因转录起始位点的上游几kb的区域内,一般来说启动子区域具有一定的保守序列特征,另外,启动子区域一般还具有比较高比例的GC含量,这些高GC含量的区域组成一些GC岛;如果一个新的基因在不能确定其启动子的情况下,最好在设计PCR引物时,多设计几对,最大限度地将新基因的启动子区域囊括在这些PCR里面..如:你可以分析一下,得到高GC含量的区域,然后在涵盖这个区域设计一系列的引物,然后PCR.

名山县13976671769: 怎么研究基因启动子上游的一段序列是不是基因表达的调控序列 -
资肥阿昔: 可以将序列克隆到体外进行表达,通过基因表达的量来进行判断: 1. 首先将上游序列带启动子序列克隆到一些报告基因的载体中,例如luciferase的基因,首先观察构建后,luciferase是否能够表达.然后再通过突变或截短启动子上游的区域,来...

名山县13976671769: 原核表达载体序列如何分析,从哪个启动子开始翻译分析? -
资肥阿昔: 简要的说,pet系统的T7启动子最著名,以pet系列来说,找到启动子之后,再找rbs区域,这个是核糖体结合区,找到了之后,从离rbs最近的一个Met开始翻译,3个碱基为一个读码框,遇到UAA,UGA,UAG之后翻译结束,载体一般都由终止密码子,有时候也在引物里人为添加终止子,还有不明白的可继续问,

名山县13976671769: 如何查找一个基因的启动子序列 -
资肥阿昔: 定义:启动子是参与特定基因转录及其调控的DNA序列.包含核心启动子区域和调控区域.核心启动子区域产生基础水平的转录,调控区域能够对不同的环境条件作出应答,对基因的表达水平做出相应的调节. 区域:启动子的范围非常大,可...

名山县13976671769: 如何找一个基因的启动子序列 -
资肥阿昔: 几个途径:1. 查文献有无发表的结果2. 用软件分析,比如promoter predict3. 系列切取,克隆待测序列后,使用promoter activity assay来证实关键序列在哪个部位

名山县13976671769: 如何确定原核生物基因的启动子? -
资肥阿昔: 启动子一般是某个基因表达开始的一段长度大约30~~50bp碱基的片段,能够于RNA聚合酶结合,是基因顺利表达.

名山县13976671769: 如何找一个基因的启动子 -
资肥阿昔: 一是查找相关文献,即别人跟你做同一个基因,可能克隆过他的启动子,你可以在其基础上做相关的功能研究;怎样查找一个基因的启动子??原核生物的.:tiger19: 去一些网站上输入你的序列,软件在线分析你的启动子,如果你的序列可以在一些文献中找到的话,看看别人分析的启动子,然后Blast之后,在分析分析...芸香菜(站内联系TA)如果基因是已知的话,软件分析它的ORF,一般以ATG前的1500bp的序列记为启动子.行者,有路(站内联系TA)好 谢谢行者,有路(站内联系TA)请问高手可以用什么软件分析启动子?行者,有路(站内联系TA)能不能给推荐些软件?谢谢了!

本站内容来自于网友发表,不代表本站立场,仅表示其个人看法,不对其真实性、正确性、有效性作任何的担保
相关事宜请发邮件给我们
© 星空见康网