NTSYS-pc2.10e如何构建有根树?看见一个论文是用这个软件的聚类树是有根的,跪求大佬指导?谢谢

作者&投稿:祁平 (若有异议请与网页底部的电邮联系)
你好 ,我的问题也是关于Ntsys-pc软件的,这个聚类分析产生的树是唯一的么?还是可以有不同的数?非常感谢~

我做的ISSR的聚类,会生成两个图,也就是会产生两个树状图,这两个图大部分是相同的,局部的聚类结果位置会有变化。

你的excel数据格式错误,
数据输入之后保存为Microsoft Excel 5.0/95工作薄(*.xls)格式,不然不识别。

NTSYSpc软件的使用:

(1) 利用NTSYS软件计算品种间遗传距离

1.将已赋值好的Excel文件放于桌面,假设命名为A.xls,保存为Microsoft office 5.0/95工作薄形式。Excel文件格式设成软件识别的模式,即A1=1,表示出现等位基因;B1=132,表示等位基因数,C1=189表示品种数;D1=0表示不出现等位基因。从A3开始,在第一列标上所有的SSR引物,从B2开始,第二行标上所有的品种名,由此得到一个数据矩阵。

2.双击NTSYS软件,选择file→edit file,选择A.xls文件,将出现NTedit1.2编辑器,点击file→sale file as选项,将导入的Excel文件转换为软件识别的格式,命名为A-1.NTS文件。

3.点击Ntsyspc2.1界面的“Similarity”,点击“Genetic distance”;在Input data file中输入A-1.NTS;在Output file中输入A-2.NTS,点击Compute;则计算好的遗传距离放在A-2.NTS文件中。

4.点击Ntsyspc2.1界面的output&transf→output→Input file,选择A-2.NTS,即可查看到品种间的遗传距离。

(2) 利用NTSYS软件构建树状图

1.双击NTSYS-PC,点击similarity→Qualitative data→Input data file,选择A-1.NTS文件,在Output file中输入B-2文件,点击Compute;

2.点击clustering→SHAN→input file,选择B-2→In case of ties改为Find→compute计算完成。

3.点击Graphics→tree plot→input file,选择B-2→compute,即可出现聚类图。

4.点击Tree Plot界面上的Options→plot Options;会出现一个对话框,里面可对聚类图进行页面显示等相关操作。点击Tree Plot界面上的Edit项,可进行复制等操作。

NTSYSpc软件的使用:


(1)用NTSYS软件计算品种间的遗传距离


  1. 将分配的Excel文件放在桌面上,假设命名为A.xls,保存为Microsoft office 5.0/95工作簿。Excel文件格式设置为软件识别的模式,即A1=1,表示出现等位基因;B1=132,代表等位基因数,C1=189,代表品种数;D1=0表示不存在等位基因。从A3开始,所有的SSR引物被标记在第一列,从B2开始,所有的品种名称被标记在第二行,从而获得数据矩阵。

2.双击NTSYS软件,选择文件→编辑文件,选择一个. xls文件,出现NTedit1.2编辑器。单击“文件”→“将文件作为选项出售”,将导入的Excel文件转换为软件可识别的格式,并将其命名为“A-1”。NTS档案。


3.点击Ntsyspc2.1界面中的“相似度”和“遗传距离”;在输入数据文件中输入a-1 . nts;输入A-2。NTS在输出文件,并点击计算;;然后将计算出的遗传距离放入A-2中。NTS档案。


4.单击Ntsyspc2.1界面的输出。



NTSYSpc软件的使用:


(1)用NTSYS软件计算品种间的遗传距离


  1. 将分配的Excel文件放在桌面上,假设命名为A.xls,保存为Microsoft office 5.0/95工作簿。Excel文件格式设置为软件识别的模式,即A1=1,表示出现等位基因;B1=132,代表等位基因数,C1=189,代表品种数;D1=0表示不存在等位基因。从A3开始,所有的SSR引物被标记在第一列,从B2开始,所有的品种名称被标记在第二行,从而获得数据矩阵。

2.双击NTSYS软件,选择文件→编辑文件,选择一个. xls文件,出现NTedit1.2编辑器。单击“文件”→“将文件作为选项出售”,将导入的Excel文件转换为软件可识别的格式,并将其命名为“A-1”。NTS档案。


3.点击Ntsyspc2.1界面中的“相似度”和“遗传距离”;在输入数据文件中输入a-1 . nts;输入A-2。NTS在输出文件,并点击计算;;然后将计算出的遗传距离放入A-2中。NTS档案。


4.单击Ntsyspc2.1界面的输出。




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