小样本+大样本实验分组设计思路

作者&投稿:相详 (若有异议请与网页底部的电邮联系)
~ 在准备进行测序实验时,精心规划实验分组是确保实验成功的关键一步。实验设计根据样本量的差异,分为不同策略。以转录组为例,我们将探讨在农学和医学领域中,如何根据样本量差异来设计实验分组。

当样本量较小时,常见的实验设计方案包括发育周期、跨器官、野生型与突变体比较,以及处理时间/浓度梯度等。这些设计旨在深入研究特定条件或变异下的生物反应。

案例一涉及时间处理梯度,研究者对番木瓜果实应用乙烯受体抑制剂1-MCP处理,通过ATAC-seq和RNA-seq技术,揭示了乙烯和生长素信号在果实成熟机制中的整合作用。研究指出转录因子CpAGL18在控制果实成熟过程中扮演关键角色。

案例二探讨了猕猴桃品质调控的动态代谢组和转录组分析,通过11个不同发育阶段的样本研究,揭示了猕猴桃品质调控的基因组和转录调控网络,为优化猕猴桃品质提供了新视角。

案例三聚焦于鸡卵泡形成过程中的颗粒细胞动态,通过转录组、表观组数据的分析,揭示了颗粒细胞基因表达和染色质结构的动态变化,为了解鸟类生殖生物学提供了重要见解。

案例四关注BATF转录因子在CAR-T细胞中的作用,研究发现BATF的耗竭能增强CAR-T细胞对实体肿瘤的抗肿瘤活性,通过调节耗竭相关基因表达,促进了T细胞的长期存活和抗肿瘤功能。

当样本量较大时,农学研究可能侧重于群体遗传研究、跨/全器官图谱、泛物种+多器官等设计;医学研究则可能采用队列研究和泛癌分析等方法。这些设计旨在揭示不同生物体间的遗传差异和基因表达模式,以及器官间相互作用的复杂性。

案例五揭示了eQTLs在调控水稻基因表达和鉴定关键调控因子中的作用,通过分析来自世界各地的水稻品种,研究构建了基因组变异和转录组变异的大规模图谱。

案例六通过大规模基因组和转录组分析,阐明了高肉产量鸡的遗传基础,重点关注胸肌与地方鸡种或野生祖先鸡的差异,为遗传改良提供了重要信息。

案例七通过比较转录组分析,揭示了陆地植物器官发生和繁殖的保守程序,发现利用现有基因是进化新器官的主要机制,而雄性生殖高度专门化。

队列研究常用于疾病预后、临床试验等研究中,能够较好地揭示疾病病因与个体差异之间的关系。案例八探讨了哮喘气道转录组全关联研究,揭示了遗传驱动的气道粘液病理生物学,突出了MUC5AC基因在非炎症性粘液分泌中的作用。

案例九进行难治性转移性癌症的整合泛癌基因组学和转录组学分析,验证了多种耐药机制在治疗后的转移性肿瘤中的作用,为临床治疗提供了新的靶点。

综上所述,实验分组设计应基于研究目的和样本量,选择合适的方法,以深入探索生物反应的复杂机制。同时,大型基因组和人群队列项目所需的高通量测序服务,以及表观组学研究的深入分析,都是现代科学研究的重要工具。


什么是样本的大样本分析和小样本分析?
大样本z和小样本t的区别方法:总体中抽取的所要考查的元素总称,样本中个体的多少叫样本容量。一般的,样本的内容是带着单位的,例如:调查某中学300名中学生的视力情况中,样本是300名中学生的视力情况,而样本容量则为300。选取样本的过程叫作抽样,根据不同的对象,在抽样方法也有所不同。z检验适用...

统计学中,如何区分大样本z和小样本t
总体标准差用大样Z。如果不知道总体标准差,只知道样本标准差就只能用t检定了,一个是总体,一个是总体中抽部分样品,30是指总体非正态情况下,抽样需超过30,才能根据中心极限法保证计算的准确性。区别一:z检验适用于变量符合z分布的情况,而t检验适用于变量符合t分布的情况;区别二:t分布是z分布的...

"大样本随机双盲试验"是什么意思?
“大样本随机双盲试验”是现代医学判断疗效的“金标准”大样本:试验选取的样本数要尽可能多。因为统计学的“大数原则”告诉我们,样本越大,统计结果越能稀释掉那些特例(例如某些人免疫系统特别强或特别弱),也就越能逼近真实情况。随机:样本选取遵循随机原则。这样可以有效避免病人由于病情轻重而导致的...

"大样本随机双盲试验"是什么意思?
1. “大样本随机双盲试验”是现代医学用来判断疗效的“金标准”。2. 在这个试验中,选取的样本数量要尽可能多。因为统计学中的“大数原则”指出,样本越大,统计结果越能消除掉那些特例的影响,从而越接近真实情况。3. 试验样本的选取需要遵循随机原则,这样可以有效避免由于病人病情轻重不同而导致的痊愈...

随机化分组样本量越小效果越好吗
不是。随机化分组样本量并不是越小越好。样本量越大,样本的代表性越强。在统计学中,样本量越大,样本的统计分布就越接近总体分布。因此,大样本量能够更好地反映研究总体的特征和状况,提高研究的代表性和可信度,效果越好。而如果样本量过小,会因为时间或经费的限制而无法进行充分的实验,从而影响...

生物硕士论文需要多少个实验样本
1. 为了确保统计分析的有效性,生物硕士论文中的实验样本数量通常需要达到至少30个,这样的样本量才能被认为是大样本,从而使统计分析结果具有较高的可信度。2. 然而,样本数量的确切数量还取决于研究中的变量数量。一个经验原则是,样本数量至少应比变量数量多一个,这样可以确保在统计分析中有一个自由的...

笔迹鉴定可以作为法律依据吗
法律主观:笔迹鉴定也就是通常所说的文件检验,一般都需要有符合鉴定要求和条件的、能与检验材料(检材)进行相互比较检验的样本材料。 一、收集样本材料的方法及途径 (一)笔迹鉴定 ,笔迹样本分为自然(平时)样本和实验样本,平时样本又分为案前样本和案后样本。收集的样本材料不但要有可比性,即相同...

生物硕士论文需要多少个实验样本
至少30个从统计上说,至少30才可以,才算大样本。但是还是要看变量数,原则上说样本数至少比变量数多一个,这些是样本的最低要求。对于研究生毕业论文,对数据样本的选择可以根据研究课题进行调整,通常分析的的问题越复杂需要的数据量就会越大。

关于TMT\/iTRAQ和DIA技术的选择?
我们知道,TMT\/iTRAQ子离子标记定量和DIA非标定量是目前蛋白质组最常用的两项技术。一般而言,小样本量,如10样本以上的项目推荐采用TMT\/iTRAQ;大样本量的项目推荐采用DIA。为什么呢?DIA技术因为全采模式被吹上了天,其实应用并没有传说中那么广,只能说是趋势。DIA绝非万能,技术的选择要视情况而定。...

怎么分别司法鉴定中检材与样本的区别
鉴定材料包括鉴定检材和鉴定样本。一、鉴定检材一般是指诉讼活动或者其他争议中的用以证明事情真实性的证据材料,通过鉴定确定其些专门性的问题。当需要鉴定并依法委托鉴定时,都属于司法鉴定中的检材。司法鉴定的文书类检材一般包括笔迹类检材和文书图像类检材等。笔迹类检材,主要是指各种书写的笔迹资料,...

椒江区13182203858: 主试验组和试验组有什么区别? -
自怎希静: 可能就是实验组和对照组,一般小样本实验样本数每组不要少于5只,以免抽样误差,每组动物之间的个体差异要小,同窝更好.要双盲分组(不受研究人员主观意图的影响)追问:重复给药毒性试验中,每个剂量组动物数,啮齿类一般不少于15...

椒江区13182203858: 如何设计一个被试间的实验 -
自怎希静: 一般的实验都需要30个被试以上,30人以上才能看成是大样本,信度才可靠. 不过你这个实验找30个被试只怕有些困难,自闭症儿童应该没有那么好找的.不过小样本也有小样本的解决办法,那就是做被试内设计,既每一个被试都经过所有处理水平.文献中采用十几个被试,大概也是用这样的处理方式(被试内设计对人数要求比被试间设计低很多).感觉十几个也可以了,可根据实验情况,用正常儿童做对照组吧.

椒江区13182203858: 一堆大头针有上千枚,你怎样用天平称出它们的数量?写出实验方案与步骤
自怎希静: 1、先取出一个小样本,即一定数量的大头针(如100枚,用天平称重并记录数据A; 2、再称出所有大头针重量,记录数据B; 3、大头针数量N=100*(B/A)枚. 4、结果如果带小数就四舍五入.所得精确度跟你取的样本大小有关,取得越小越精确.

椒江区13182203858: 生物实验设计 -
自怎希静: 一、明确实验目的 实验目的是设计实验的纲要,只有明确实验目的,我们才能设计合理的变量.根据目的又可以分为:验证性实验:如:“请利用提供的实验材料和用具,验证胰高血糖素具有升高血糖的作用”.这样的实验将来预期的结果是确...

椒江区13182203858: 一个好的实验设计应考虑到哪5点? -
自怎希静: 做高中生物实验设计应注意 设计实验时候要注意细节: 例如 1、把样本分组、标记.注意要单一变量比较 2、注意观测现象的比较(注意要用单一变量比较),运用书本的知识点. 3、写实验结果要分情况说明,该说的就说,题目不要求的可以...

椒江区13182203858: 大样本和小样本对假设检验在解题上的区别(就是在何种情况下应该用t分布,什么情况是z分布) -
自怎希静: t分布,主要用于样本较小(样本容量<30)的情况,利用样本的标准差作为分母,多用于标准差未知的情况.z分布,主要用于样本较大(样本容量>30)的情况,利用标准正态分布来推断差异概率的方法,多用于标准差已知的情况.当样本量足够大时,t分布近似于z分布.

椒江区13182203858: 如何进行样本量计算 -
自怎希静: 原发布者:yh2006231.估计样本量的决定因素1.1资料性质计量资料如果设计均衡,误差控制得好,样本可以小于30例;计数资料即使误差控制严格,设计均衡,样本需要大一些,需要30-100例.1.2研究事件的发生率研究事件预期结局出现的...

椒江区13182203858: 小样本研究与抽样研究有什么区别? -
自怎希静: 其实我觉得差别蛮大的…… 小样本是指样本范围本身就小,抽样是样本范围不小,但从中抽取一部分.所以就算样本容量是一样的,其研究对象的范围还是不一样的吧…… (其实我是看到空间新鲜事而来打酱油的……)

椒江区13182203858: 某研究者随机抽样两个样本进行分析,如何对该资料进行统计描述和统计推断? -
自怎希静: 根据总数来言:在总数小于30 左右的时候,两个样本可以作为数据参考,根据实际运作 做统计模型. 大于30,两个 样本则太少,不可进行推断,因为错误机率太大.参考 F检验

椒江区13182203858: 相关样本平均数差异显著性检验的检验统计量公式是什么 -
自怎希静: 相关样本 (一)配对组: 1、大样本检验统计量公式:Z=D/ p.135(7.12) 大样本检验统计量公式的使用条件:抽取样本人数n≥30; 2、小样本检验统计量公式:t=D/ p.133(7.9)[举例三] (二)同一组对象: 1、大样本检验统计量公式:Z=D/ p.135(7.12) 大样本检验统计量公式的使用条件:抽取样本人数n≥30; 2、小样本检验统计量公式:t=D/[举例四]

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