如何利用MolAid化学数据库据查询有机化合物的晶体结构?

作者&投稿:羿柔 (若有异议请与网页底部的电邮联系)
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MolAid 作为化合物检索及智能一体化数字合成平台,支持查询物质、化合物反应,涉及化学合成、药物及生物等信息。其中,晶体信息,是 MolAid的特色功能之一。此功能不仅提供相关晶体数据,还包含 3D 晶体模型,帮助我们快速了解分子的立体结构。

究晶体结构的意义

有机化合物的晶体结构在许多领域中具有广泛的应用。

有机化合物的晶体结构在药物晶型研究中起着核心作用。通过深入理解晶体结构与药物性质之间的关系,可以优化药物设计、提高药物质量、确保疗效和安全性,最终为患者提供更好的治疗选择。

  • 研究有机化合物的晶体结构,可以了解它们的电子结构、光学性质、导电性和磁性等特性,在光电子学、光学器件、传感器和光催化等领域具有重要应用。

  • 晶体结构可以提供活性位点的信息,帮助科学家理解催化反应的机理以及反应中可能发生的分子间相互作用。

  • 研究晶体结构,可以了解分子的排列方式、氢键和π-π相互作用等关键特性,这对于设计新型的分子识别探针和晶体材料具有重要意义。

  • 有机化合物的晶体结构对于理论化学研究也非常重要。晶体结构可以用于验证和验证理论模型的准确性,为理论计算提供准确的起始结构。

如何查看 3D 晶体结构图

想要看某个化合物的晶体3D模型,可以先在检索框输入化合物相关信息(cas、中英文名称、绘制结构、其他编码等),在结果列表选择目标物,再点击“物质信息”进入详情页,左侧栏选择“晶体信息”,右上角点击“查看3D结构图”即可查看化合物空间结构。部分化合物无法查看3D 晶体结构图。

展示图以“阿司匹林”为例

图片来源:MolAid

图片来源:MolAid

3D 结构样式切换

将光标放置于3D 展示界面,单击鼠标右键,会出现如下图选项,可根据已有选项自行选择视图、样式、颜色、对称性等。

图片来源:MolAid

常用操作介绍

在展示界面,我们可以通过几项简单操作,详细查看 3D 结构——

3D 展示界面可以任意拖动、调节大小。

1. 旋转结构式

在 3D 展示界面,使用鼠标左键按住结构式旋转,结构式会以鼠标接触点为原点进行旋转。

2. 放大/缩小画面

在 3D 展示界面滑动鼠标滚轮,可以任意调整画面缩放比例。

保存与下载

MolAid 与其他平台最大的不同便在于,我们支持分子3D 结构的保存与下载,并且操作简洁,省时省力,毫不费心。

如下图所示,若需要导出3D 结构,选中该结构后,单击鼠标右键,选择“文件”,再进一步选择“Export”,便可筛选自己心仪的导出格式,一键选择即可下载查看。

图片来源:MolAid

MolAid更多功能详解,敬请期待。




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