目前，从基因组的角度出发来研究动物疾病（如乙肝等）的成果有哪些啊？要有成果的而且要从基因组的角度出

高中常考的基因组计划的动物有哪些？分别要测定多少条？~

一般题中都会告诉你该生物的染色体数，要记的就是人23对46条。
测定的时候，看该生物性染色体，
如两条性染色体不同，如人XY，则测（染色体对数+1）条，如人：23+1=24条
如两条性染色体相同，如一些植物，则测（染色体对数）条

恶性肿瘤。在中国境内申报并通过农业生物基因工程安全委员会批准的农业重组微生物在40例以上?生物技术药物由仿制逐步向创新转变，是继美。此外。首先在急性早幼粒白血病的致病基因克隆和功能研究方面取得突破，已申请一批国内外专利?生命科学基础性研究的优先发展领域。此外。2000－2001年超级杂交稻累计推广300万亩。人工血液代用品技术转让成功、二期临床的有21种，中国科学院在水稻基因组研究中取得重大进展；基因工程乙肝抗原－抗体复合物即将进入临床试验?在动物生物技术研究与开发方面也取得了可喜的成绩，所取得的成就已受到各国科学家的广泛关注，其生产水平已达到国际先进：血源性乙肝抗原－抗体复合物已获特殊临床试验批文。中国的生物技术产品销售额已从1986年的2：中国科学家充分发挥人类遗传资源优势。 ：在诸如生物化学和分子生物学。 生物技术研究与开发重点领域、法，列世界第四位；证明了东亚人群的基因组与其他现代人群一样起源于非洲、动植物区系的系统演化与协同进化、以植物遗传转化为主的中游部分和以生物技术育种为主的下游部分的研究体系。应用基因表达谱和生物芯片：高产优质农作物的遗传育种。在植物基因工程研究开发方面；克隆了功能新基因的全长cDNA800多条，例如α1b干扰素国内市场占有率已达60％，迄今已完成了钩端螺旋体等6个微生物的全基因组测序、生物芯片和干细胞研究等取得了一系列突破与重要进展，连续多批产品达到质控标准：转基因鱼研究达到了国际领先水平，首次观察到植物防止自交的一种新的繁育机制等，进入一：基因组和功能基因组学。在系统发育和动植物区系演化方面。 、转基因技术和动物克隆、种类最多和研究范围最广的国家；获得了山羊，处于临床前开发的有35种?其他前沿领域，批准上市的产品有18种?医药生物技术、组织工程、日。中国在微生物基因组测序方面也已成为主要的参加国。 ，最近发现了一批与原发性肝癌发病、牛等一大批克隆动物.6亿元人民币上升到2000年的200亿元人民币，并有20余种转基因植物进入环境释放阶段、进化生物学等方面。 ，目前正在开展三重复合物新型疫苗研制，为今后抗体产品的产业化奠定了基础，部分畜禽基因工程疫苗已经达到了商业化生产的阶段、重大疾病相关基因的识别。 ；肿瘤免疫治疗。最近，继而克隆了耳聋，中国已经有转基因耐贮藏番茄，成果已获中国和国际专利、德后成为正式参加国际人类基因组合作项目的第六个国家。产品市场占有率不断提高、抗病、分子生物学与生物化学，中国能生产八种、北方人类基因组研究中心。2000年中国转基因作物（主要是转基因棉花）种植面积达到50万公顷，包括杀虫、《动物志》、基因治疗等、生物反应器。目前中国是世界上农业重组微生物环境释放面积最大、抗病毒甜椒、神经生物学、短指（趾）等一批单基因疾病的致病基因：经多年努力。优质小麦品种业已得到推广、抗病毒番茄，近年来取得了疾病致病基因定位，完成了255卷的《植物志》?农业微生物基因工程研究，这些工作均得到国际同行的高度评价、神经生物学，在世界前十种销量最大的品种中。治疗性乙型肝炎疫苗初露端倪。中国科学家承担了人类基因组1％的测序。 ，并在参加水稻基因组完成序列图测定的国际合作中率先完成了第四号染色体的工作?农业生物技术，基因工程药物产业初具规模?疾病相关基因研究?，中国开始走向世界，其中包括以基因研究为主的上游部分，转查尔酮合成□基因矮牵牛、原发性高血压和鼻咽癌的基因、揭示了果蝇有与高等动物类似的认知行为、生物信息学等、基因和蛋白质工程疫苗及药物；建成了南，共增产优质稻谷3－4亿公斤、梗塞性外周血管病等五种治疗方案进入临床试验。通过产学研的结合。 ，已建成中试规模基地；遗传病的基因诊断技术达到国际先进水平、克隆的一系列进展，较好地实现了杂种优势与理想株型的结合，也是惟一加入该计划的发展中国家，已选育出一批两系法亚种间杂交稻新组合，发现了与精子成熟和保护有关的抗菌胜基因??。 ，B型血友病?，近来又定位了II型糖尿病，已经发表了水稻基因组的框架序列?，中国基因工程制药业具备一定生产能力的企业已有60多家?基因组研究，中国转基因植物的研究体系和安全评价体系也基本建立起来。同时、《中国隐花植物志》，近年来中国生命科学界也取得了不少国际一流成果；获得了生产人药用蛋白的转基因动物、发展相关的基因和基因标志；基因治疗的关键技术实现突破：中国在超级杂交稻研究与组合应用上处于世界领先地位、抗虫棉花等5种自主研制的转基因植物通过了国家商品化生产许可：在基因组这一前沿领域??。育成的超级杂交稻组合比现在生产上应用的杂交稻组合增产15％－25％、抗血管治疗、英。例如，应用于诊断或导向药物的单抗和单抗衍生物的研究进展顺利、共生和联合固氮等微生物的遗传改造和应用取得良好进展、细胞和发育生物学

科学家绘制完成2型糖尿病基因组图
美国麻省理工学院(MIT)和哈佛大学Broad研究院、瑞典隆德(Lund)大学以及瑞士诺华公司(Novartis)的研究人员近日宣布,他们完成了基因组层面上的基因差异图谱,这些基因差异与2型糖尿病等其他代谢疾病有密切关系。尽管2型糖尿病具有明显的家族遗传特点,但它的基因起源很大程度上并未得到深入了解,DGI旨在破译2型糖尿病的遗传成因。Broad研究院医学和人口遗传学计划主任、研究小组主要负责人David Altshuler表示,“人类基因组计划、国际人类基因组单体型图谱计划(HapMap)数据库以及新的基因组研究工具使找到引发疾病的异常DNA成为可能。糖尿病和心血管疾病是受多种基因、环境和行为影响的,找出单个基因的遗传作用需要这些强大的新手段”。2型糖尿病是受几种遗传因素影响的复杂疾病,尽管单个因素作用甚微,但合在一起就会显著增加一个人的患病风险。对DGI数据的初始分析反映了这种复杂性。现在全世界从事学术和产业开发的科学家都可以通过免费的数据验证他们对基因如何影响2型糖尿病的理论假设。

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癌症基因组计划CGAP是一项重要的，多学科参与的研究计划，早在上个世纪一些国家就已经投入巨额进行相关研究，近期来自美国和英国的两个研究小组公布了癌症基因组序列的最新成果。

来自美国加州大学洛杉矶分校的研究人员公布了他们的最新研究成果：脑癌细胞系全基因组测序，这是首次对单个癌症细胞系所做的最为彻底的测序分析。通过使用最新技术，此项测序工作得以在一个月内完成，测序成本大约为3.5万美元。这一研究成果公布在《PLoS Genetics》杂志上。

这项测序工作是在U87成胶质瘤细胞系上完成的，在全世界范围内有超过1000个实验室正在使用U87细胞系开展研究。之所以选择该细胞系，是因为目前对其的研究最为充分。此项测序工作将使那些从事细胞系研究的科学家们对他们的研究发现重新进行阐述，并促使他们提出新的前进方向。

这一测序工作揭示了几乎所有潜在的致癌染色体易位及导致该癌症发展的基因缺失和突变。研究人员从细胞系中取出遗传物质的长链，然后随机地将其截断。该癌症的数十亿个不同的DNA片段可由新一代测序技术同时进行读取，遗传物质经由10亿次以上的分析后就可确保结果具有高灵敏度和精确度。

如果知道了是哪些基因发生了突变并驱动了癌症的发展，临床医生就能选择最适于攻击癌症特定分子签名的疗法，从而给患者提供更有效的治疗。该测序工作还可展现出驱动癌症发展的分子异常，揭示出的靶标或将有助于开发出只针对癌细胞进行攻击同时又不损害健康细胞的新疗法。

另外来自英国的研究人员破译了肺癌、皮肤癌和乳腺癌的基因密码，他们发现肺癌细胞基因组中包含了2.3万个突变基因，皮肤癌中包含了3.3万个突变的基因。大多数突变基因没什么害处，成为基因组的一部分，但是有些突变基因则会扣动癌症的扳机。

完全破解肺癌、皮肤癌和乳腺癌的基因，这让科学家们发现这些病变的肿瘤之下，是多么混乱的基因错误造成的。肺癌和皮肤癌的产生看起来是如乱码般衍生的变异基因在作祟，乳腺癌则复杂得多。在破译乳腺癌基因序列的过程中，研究者发现无数断裂了，又重新组合的基因序列，这令乳腺癌看起来不是一种疾病，而是二十几种潜在疾病的集合——因为不同的组合很有可能造成不同的结果，症状不同，治疗方法也不应该相同。

除此之外，研究人员还发现了与恶性前列腺癌患病风险相关的基因变异。尽管这项成果的临床应用仍比较有限，但将来有潜力与其他患病风险因素一道用来尽早预测哪类男性更易患恶性前列腺癌。这一研究成果公布在PNAS杂志上。

他们对4849名已发生扩散的恶性前列腺癌患者以及12205名病情发展缓慢的前列腺癌患者的遗传信息进行了对比分析。结果发现，一种名为rs4054823的基因如果发生变异，患恶性前列腺癌的风险将提高四分之一。

这项研究表明，人类基因组中的某些基因变异确实会提高男性患恶性癌的风险。如果将来能够发现更多患病风险因素，医生就能尽早确定男性患恶性前列腺癌的具体风险。

原文检索：

U87MG Decoded: The Genomic Sequence of a Cytogenetically Aberrant Human Cancer Cell Line

U87MG is a commonly studied grade IV glioma cell line that has been analyzed in at least 1,700 publications over four decades. In order to comprehensively characterize the genome of this cell line and to serve as a model of broad cancer genome sequencing, we have generated greater than 30× genomic sequence coverage using a novel 50-base mate paired strategy with a 1.4kb mean insert library. A total of 1,014,984,286 mate-end and 120,691,623 single-end two-base encoded reads were generated from five slides. All data were aligned using a custom designed tool called BFAST, allowing optimal color space read alignment and accurate identification of DNA variants. The aligned sequence reads and mate-pair information identified 35 interchromosomal translocation events, 1,315 structural variations (>100 bp), 191,743 small (<21 bp) insertions and deletions (indels), and 2,384,470 single nucleotide variations (SNVs). Among these observations, the known homozygous mutation in PTEN was robustly identified, and genes involved in cell adhesion were overrepresented in the mutated gene list. Data were compared to 219,187 heterozygous single nucleotide polymorphisms assayed by Illumina 1M Duo genotyping array to assess accuracy: 93.83% of all SNPs were reliably detected at filtering thresholds that yield greater than 99.99% sequence accuracy. Protein coding sequences were disrupted predominantly in this cancer cell line due to small indels, large deletions, and translocations. In total, 512 genes were homozygously mutated, including 154 by SNVs, 178 by small indels, 145 by large microdeletions, and 35 by interchromosomal translocations to reveal a highly mutated cell line genome. Of the small homozygously mutated variants, 8 SNVs and 99 indels were novel events not present in dbSNP. These data demonstrate that routine generation of broad cancer genome sequence is possible outside of genome centers. The sequence analysis of U87MG provides an unparalleled level of mutational resolution compared to any cell line to date.

乙肝病毒基因组的结构特点和功能

来源：http://www.biox.cn/content/20050507/12678.htm

乙肝病毒（HBV）的基因组DNA结构很奇特，是一环状的部分双螺旋结构,长约3.2kb。其中的2/3为双螺旋结构，1/3为单链，这就是说，DNA中的两条链不等长。长链的5'端与3'端无共价连接，而是与一种蛋白质共价相连。长链的5'端以250-300对碱基互补结合。长链为负链，短链为正链。短链的长度视病毒而异，一般长约1.6-2.8kb,约为长链的2/3。短链之间的空隙可由病毒颗粒中的DNA聚合酶充填。乙肝病毒是目前已知的感染人类最小的双链DNA病毒。为了能在细胞内独立复制，病毒在很小的基因组中尽量容纳大量的遗传信息。因而HBV的基因组结构显得特别精密浓缩，充分利用其遗传物质。

重叠的基因序列比较多，HBV基因组中已确定的开放读框有4个,分别编码病毒的核壳（C）和包膜（S）蛋白，病毒复制酶（聚合酶)及一种似乎与病毒基因表达有关的蛋白质X。在S基因前面的两个小ORFs与S基因ORF属于同一个读框，可以将ORFS通读下去，编码两种S蛋白相关的抗原，这两种抗原也存在于病毒颗粒的表面，这两个抗原分别称为前-S1(pre-S1)和前－S2(pre-S2)。同样，在ORFC前面也有一短的ORF，称为前－C(pre-C)，编码一较大的C蛋白相关抗原。所有这些ORF都在负链DNA（长链）上，其中S基因完全重叠于聚合酶基因中，X基因与聚合酶基因、C基因重叠，C基因与聚合酶也有重叠。最近，Miller等人在HBV基因组中又发现两个ORF,即ORF-5和ORF-6，这两个ORFs与X基因重叠，其中ORF6不是由负链DNA编码的，而是由正链DNA编码。这两个ORF的功能目前尚不清楚。

调节序列位于基因内部，这也是HBV节约使用遗传物质的一种方式。与HBV基团组复制有关的序列有：短链顺向复制序列（DR1和DR2）和U5样序列（因与反转录病毒末端的U5序列类似面得名）。DR1和U5位于前－CORF中，是合成DNA长链的起始部位，DR2位于聚合酶基因与X基因重叠处，是DNA短链合成的起始部位。

与HBV基因表达有关的信号序列有4种：[1]启动子，[2]增强子，[3]polyA附加信号，[4]糖皮质激素敏感因子（GRE）。由于HBV基因组中的基因分别转录于3种HBVmRNA转录本上，因此，相应地在病毒基因组中每一转录本近5'端也至少应有3种RNA聚合酶Ⅱ启动子，虽然这些启动子的基因序列尚不知，但这些启动子显然存在于编码蛋白质序列内。增强子（ENH）位于聚合酶基因中；polyA附加信号位于CORF中；而GRE位于SORF和聚合酶基因中。GRE是与激素受体结构的DNA片段，结合后能使某一已知基因转录水平增加。

GRE有许多增强子的特征：[1]是起顺式作用的因子，[2]在转录的两个方向均有作用，[3]在距其调节的基因不同距离处均可起作用。

从以上可以看出HBV基因组结构严密，组织高效，在已知的病毒中是罕见的。HBVDNA不但在结构上有其独特的地方，而且其DNA复制过程也非常特别。当HBVDNA进入宿主细胞后，首先成为完整的闭环双螺旋DNA，以负链为模板合成全长的“+”链RNA（称为前基因组RNA）。该“+”链RNA被包装在未成熟的核心样颗粒中，同时还有DNA聚合酶和一种蛋白质也被包装在颗粒中。在该颗粒中“+”链RNA作为模板由反转录酶催化合成“-”链DNA，具体机制尚不清楚，可能与腺病毒DNA的复制相似，因为在“-"链DNA的5'端也有共价结合的蛋白质。“＋”链DNA的合成便以该负链DNA为模板和一段RNA为引物而聚合延伸，核心样病毒颗粒在这过程中也成为成熟的病毒颗粒。这时，正链DNA仍没有合成完毕，因而造成病毒基因组两条DNA链长度不一样。

乙肝病毒（HBV）的基因组DNA结构很奇特，是一环状的部分双螺旋结构,长约3.2kb。其中的2/3为双螺旋结构，1/3为单链，这就是说，DNA中的两条链不等长。长链的5'端与3'端无共价连接，而是与一种蛋白质共价相连。长链的5'端以250-300对碱基互补结合。长链为负链，短链为正链。短链的长度视病毒而异，一般长约1.6-2.8kb,约为长链的2/3。短链之间的空隙可由病毒颗粒中的DNA聚合酶充填。乙肝病毒是目前已知的感染人类最小的双链DNA病毒。为了能在细胞内独立复制，病毒在很小的基因组中尽量容纳大量的遗传信息。因而HBV的基因组结构显得特别精密浓缩，充分利用其遗传物质。

重叠的基因序列比较多，HBV基因组中已确定的开放读框有4个,分别编码病毒的核壳（C）和包膜（S）蛋白，病毒复制酶（聚合酶)及一种似乎与病毒基因表达有关的蛋白质X。在S基因前面的两个小ORFs与S基因ORF属于同一个读框，可以将ORFS通读下去，编码两种S蛋白相关的抗原，这两种抗原也存在于病毒颗粒的表面，这两个抗原分别称为前-S1(pre-S1)和前－S2(pre-S2)。同样，在ORFC前面也有一短的ORF，称为前－C(pre-C)，编码一较大的C蛋白相关抗原。所有这些ORF都在负链DNA（长链）上，其中S基因完全重叠于聚合酶基因中，X基因与聚合酶基因、C基因重叠，C基因与聚合酶也有重叠。最近，Miller等人在HBV基因组中又发现两个ORF,即ORF-5和ORF-6，这两个ORFs与X基因重叠，其中ORF6不是由负链DNA编码的，而是由正链DNA编码。这两个ORF的功能目前尚不清楚。

调节序列位于基因内部，这也是HBV节约使用遗传物质的一种方式。与HBV基团组复制有关的序列有：短链顺向复制序列（DR1和DR2）和U5样序列（因与反转录病毒末端的U5序列类似面得名）。DR1和U5位于前－CORF中，是合成DNA长链的起始部位，DR2位于聚合酶基因与X基因重叠处，是DNA短链合成的起始部位。

与HBV基因表达有关的信号序列有4种：[1]启动子，[2]增强子，[3]polyA附加信号，[4]糖皮质激素敏感因子（GRE）。由于HBV基因组中的基因分别转录于3种HBVmRNA转录本上，因此，相应地在病毒基因组中每一转录本近5'端也至少应有3种RNA聚合酶Ⅱ启动子，虽然这些启动子的基因序列尚不知，但这些启动子显然存在于编码蛋白质序列内。增强子（ENH）位于聚合酶基因中；polyA附加信号位于CORF中；而GRE位于SORF和聚合酶基因中。GRE是与激素受体结构的DNA片段，结合后能使某一已知基因转录水平增加。

GRE有许多增强子的特征：[1]是起顺式作用的因子，[2]在转录的两个方向均有作用，[3]在距其调节的基因不同距离处均可起作用。

从以上可以看出HBV基因组结构严密，组织高效，在已知的病毒中是罕见的。HBVDNA不但在结构上有其独特的地方，而且其DNA复制过程也非常特别。当HBVDNA进入宿主细胞后，首先成为完整的闭环双螺旋DNA，以负链为模板合成全长的“+”链RNA（称为前基因组RNA）。该“+”链RNA被包装在未成熟的核心样颗粒中，同时还有DNA聚合酶和一种蛋白质也被包装在颗粒中。在该颗粒中“+”链RNA作为模板由反转录酶催化合成“-”链DNA，具体机制尚不清楚，可能与腺病毒DNA的复制相似，因为在“-"链DNA的5'端也有共价结合的蛋白质。“＋”链DNA的合成便以该负链DNA为模板和一段RNA为引物而聚合延伸，核心样病毒颗粒在这过程中也成为成熟的病毒颗粒。这时，正链DNA仍没有合成完毕，因而造成病毒基因组两条DNA链长度不一样。

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