mRNA, CDS, exon, intro,ORF的一些基本概念
作者&投稿：计馨 （若有异议请与网页底部的电邮联系）
mRNA ：信使RNA（message RNA）,基因转录产生的RNA，也称为转录本。由于剪接等因素，一个基因转录常常可以形成多个mRNA。
CDS ：编码区（coding sequence），指mRNA中编码蛋白质的那段序列。CDS是已知的一个基因上确确实实翻译成蛋白质的区段，成熟mRNA中由一个或几个exon组成。
exon, intro ： 基因DNA分为编码区和非编码区，编码区包含外显子和内含子，一般非编码区具有基因表达的调控功能，如启动子在非编码区。编码区则转录为mRNA并最终翻译成蛋白质。
ORF ：ORF则是指，任意一段序列，只要起于ATG止于终止子，都可以叫做ORF。ORF是一种预测，而不是一种已知的翻译区。即随意写下一段DNA序列，只要以三个碱基为单位能找到ATG和终止子，就可以称作ORF，这段ORF甚至可能不是一段真正存在的DNA序列，但是它仍然是ORF。一段序列是可以有多个ORF的，只有当ORF符合已知的可翻译成蛋白的序列时，才能等同于CDS。
一个mRNA可能有多个CDS,一个CDS也可能有多个exon。
啜柯复欣： CDS是Coding sequence的缩写,是编码一段蛋白产物的序列,是结构基因组学术语 ORF开放阅读框是基因序列的一部分,包含一段可以编码蛋白的碱基序列,不能被终止子打断.当一个新基因被识别,其DNA序列被解读,人们仍旧无法搞清...
永红区13759995599： mRNA是什么/ - ？
啜柯复欣： Messenger RNA (mRNA) (信使核糖核酸)携带遗传信息,在蛋白质合成时充当模板的RNA.从脱氧核糖核酸(DNA)转录合成的带有遗传信息的一类单链核糖核酸(RNA).它在核糖体上作为蛋白质合成的模板,决定肽链的氨基酸排列顺...
永红区13759995599： 用基因的什么序列,mRNA还是CDS,还是这 - ？
啜柯复欣： 以mRNA为模板,经反转录酶催化合成DNA,则此DNA序列与mRNA互补,称为互补DNA或cDNA.提取出组织细胞的全部mRNA,在体外反转录成cDNA,与适当的载体常用噬菌体或质粒载体连接后转化受体菌,则每个细菌含有一段cDNA,并...
永红区13759995599： 如果一个基因有很多个剪切变异体该怎么找它的转录调控区 - ？
啜柯复欣： 第一个问题:要看你的个人需要和方向了,根据不同的要求选择不同扩增方式,首先如果你扩增原核生物基因,那就是要的基因DNA序列的ORF区,从ATG到TAA,因为原核基因一般没有内含子,只需从基因组中扩即可;如果你要克隆表达真核...
永红区13759995599： cds序列是什么 - ？
啜柯复欣： CDS是编码序列(Coding sequence)的缩写. DNA转录成mRNA,mRNA经剪接等加工后翻译出蛋白质,所谓CDS就是与蛋白质序列一 一对应的DNA序列,且该序列中间不含其它非该蛋白质对应的序列,不考虑mRNA加工等过程中的序列变化,总之,就是与蛋白质的密码子完全对应. CDS是编码一段蛋白产物的序列,是结构基因组学术语.开放阅读框ORF是基因序列的一部分,包含一段可以编码蛋白的碱基序列,不能被终止密码子打断.当一个新基因被识别,其DNA序列被解读,人们仍旧无法搞清相应的蛋白序列是什么.
永红区13759995599： mRNA是什么意思？
啜柯复欣： mRNA:即messenger RNA 信使RNA是由DNA经由转录而来,带着相应的遗传讯息,为下一步转译成蛋白质提供所需的讯息.在细胞中,mRNA从合成到被降解,经过了数个步骤.在转录的过程中,第二型RNA聚合酶从DNA中复制出一段遗传讯息到mRNA前体pre-mRNA上.在原核生物中,除了5'加帽之外mRNA并未被进一步处理而经常是边转录边转译.在真核生物中,转录跟转译发生在细胞的不同位置,转录发生在储存DNA的细胞核中,而转译是发生在细胞质中.
永红区13759995599： 怎么查一个蛋白质的mRNA序列 - ？
啜柯复欣： 1.输入以下网址(pubmed,我查文献用的,是ncbi的)http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/ 2.再search框中选择蛋白protein,在输入你要蛋白 3.选择你要蛋白的种属,如 Homo sapiens-人源 Mus musculus-小鼠,点击. 4.进入以后一直往下拉,...
永红区13759995599： mRNA是什么东东啊? - ？
啜柯复欣： 在细胞中,根据结构功能的不同,RNA主要分三类,即tRNA(转运RNA), rRNA(核糖体RNA),mRNA(信使RNA).mRNA是合成蛋白质的模板,内容按照细胞核中的DNA所转录;tRNA是mRNA上碱基序列(即遗传密码子)的识别者和氨基酸的转运者;rRNA是组成核糖体的组分,是蛋白质合成的工作场所. …望采纳!
永红区13759995599： DNA是什么?mRNA是什么?它们本质有什么区别?有什么联系?都有什么作用?都是怎么产生的? - ？
啜柯复欣： DNA是核酸的一种,叫脱氧核糖核酸,自然界中绝大多数生物的遗传物质是DNA,它是一种高分子化合物,具有双螺旋的空间结构,其分子内部的碱基排序可以储存大量的遗传信息. RNA是另一种核酸,叫核糖核酸.mRNA叫信使RNA,是...
永红区13759995599： 生物信息学中cds是什么意思 - ？
啜柯复欣： blast n. 爆炸; 一阵(疾风等); (吹奏乐器、哨子、汽车喇叭等突然发出的) 响声; 突如其来的强劲气流; vt. 击毁,摧毁; 尖响; 裁判高声吹哨; 枯萎:使枯萎; vi. 爆炸; 吼叫; 枯萎:枯萎; 攻击:严厉批评或猛烈攻击; [例句]There is a risk that toxic chemicals might be blasted into the atmosphere. 爆炸后有毒化学物质可能会进入大气层.生物信息学中应该是枯萎的意思.
