NGS|文库构建全流程,从片段化到PCR扩增
首先,片段化是构建的起始,如同精巧的剪裁,常用超声波或酶解法,如Tn5转座酶,它携带着转座酶、抑制因子、OE、IE和耐药基因的多功能工具包,精准切割DNA片段。
接着,末端修复/加A尾是平滑的修饰,如同艺术家的手触。平端的DNA通过T4 DNA聚合酶和T4多聚核苷酸激酶的默契合作,变得完美无瑕,而A尾的添加则由Taq DNA聚合酶轻轻点染,为接头的相遇做足准备。
连接接头,如同爱情的邂逅,A尾DNA与Illumina Y型接头的T末端紧紧相连,T4 DNA连接酶是这场化学联姻的媒婆,使得每个DNA片段都有了新的身份和方向。
对于RNA文库,RNA富集是关键的第一步,根据样本质量,可以选择Oligo(dT)策略锁定mRNA(适用于高质量RNA),或者通过RNase H去除rRNA以适应不同样本类型。
去除rRNA,如同筛选杂质,通过合成特定的rRNA探针,RNase H帮助去除,而DNase I则负责消化掉那些不必要的DNA残余。
RNA片段化,如同大自然的雷霆一击,高温瞬间将RNA分解成小片段,为后续的cDNA合成铺平道路。
cDNA合成,则是从无到有的逆转过程。RNase Inhibitor保护下的RNA,被逆转录酶转化为cDNA的第一链,接着RNase H和DNA聚合酶Ⅰ合力构建出完整的双链,这是构建cDNA文库的最后一环。
每个步骤都如同基因的乐章,严谨而富有节奏,共同编织出基因文库的壮丽乐章,等待着科学的解读与探索。
植物转录因子研究利器:DAP-seq实验分析流程及案例分享
2. 具体步骤主要步骤包括DNA文库构建、蛋白表达、蛋白与文库的结合反应、文库PCR加接头及定量检测、上机测序、生信分析等。(1)组织材料的全基因组 DNA 提取,并构建 DNA 文库;(2)构建转录因子的Halo-tag体外表达质粒,利用麦胚系统进行蛋白表达;(3)混合蛋白与文库,磁珠富集与目的蛋白结合的 DNA ...
基因组高通量测序的原理
测序方案建立在双脱氧测序法(Sanger等,1977)的基础上。为了从每一克隆插入片段两端成对地进行测序,每一个质粒模板DNA板应配备两个384孔循环测序反应板。测序反应采用Big Dye Terminator chemistry version 3.1(AppliedBiosystems)和标准M13或常用正向引物和反向引物。测序反应通过BiomekFX(Beckman)移液操作...
求3T10 5800GS DK 力量2200 输出手法
第一套符文:冰 暗 血 血 天 缠绕 缠绕(符文能量放完为止)第二套符文:天 血 血 天 缠绕 缠绕 (符文能量放完为止)还有,您的邪冰天赋是178上精华帖的那种点法吗?如果是的话,一定要在开打前把骨盾点上,做出符文分流和骨盾绑定的宏,可以开场前开骨盾,或者在输出中用下面这个循环开骨...
软件开发平台的简介(软件开发公司简介)
目前主流的软件开发平台主要是以低代码为主,低代码开发平台是通过少量代码就可以快速构建出OA协同、公文督办、KM文库、项目管理、采购管理、生产管理、供应链管理等一些列职能类和业务类管理系统的开发平台。它的强大之处在于,终端用户通过可视化操作模式即可快速开发自己的应用管理系统。市面上出现的低代码...
汽车上的GS是什么意思?
我有更好的答案推荐于2017-12-16 12:27:29 最佳答案 GL,GS是上海通用对其君威汽车的命名,主要是配置的区别,G是基本型,GL比G配置好,GS是最高配置的 其他公司如现代,起亚等用GL代表基本型,GLS代表豪华型 这个没有统一的规定 本回答由健康生活分类达人 谢进推荐 举报| 答案纠错 | 评论 40 9 ...
大学基因工程考试,有三道大题求高手解答!急求!
4.以mRNA为模板,经反转录酶催化,在体外反转录成cDNA,与适当的载体(常用噬菌体或质粒载体)连接后转化受体菌,则每个细菌含有一段cDNA,并能繁殖扩增,这样包含着细胞全部mRNA信息的cDNA克隆集合称为该组织细胞的cDNA文库。原核生物没有POLYA尾,不易进行反转录。5.Mut+能够快速利用甲醇为碳源,而Muts...
哪里有百度文库上"工商银行考试文库"实体的答案啊
哪里有百度文库上"工商银行考试文库"实体的答案啊一、单项选择题。(共60题,每题1分,共60分。每题的备选项中,只有1个最符合题意) 1.中央银行增加黄金、外汇储备,货币供应量( )。 A.不变B.减少C.增
台湾的论文库,大陆的大学可以检索到吗?
部分有全文,繁体字检索。台湾师范院校联合博硕士论文系统(http:\/\/140.122.127.247\/cgi-bin\/gs\/gsweb.cgi?o=d1):可检索包括高雄师范大学、国立新竹教育大学、国立台中教育大学、国立台湾师范大学、台北市立教育大学、国立彰化师范大学等学校的学位论文,部分可获得全文。繁体字检索。
口袋妖怪绿宝石386版金手指怎么弄,全弄出来,好的200分!
展开全部 1道具 只能通过修改在商店里购买的物品来获得道具,修改方法如下: 在道吉镇的商店买物品,选好购买数量后,等服务员问你是否要买下道具时,不要急着按A,先输入下面这条金手指: 03005B72:XX XX是物品的代码(见下表),输入后买下道具,之后删除金手指就可以了。 道具列表 球0001 大师球 0002 超力怪兽球...
摩托车什么的CG,CB,GS,GN,GT,YB这都是什么啊?哪个好些?
GS是铃木的一款机型,最代表的车型是铃木王,其他如钻豹、EN、GSX等其实都是这一系列的产品,GN的发动机与GS一样,但车型是小太子款式,也是铃木的产品。GT是铃木的一款较新的车型,2008年上市,也是小链机,侧重加速性能。YB是雅马哈的产品,有YB天戟系列和YBR天剑系列,以平衡轴发动机的超低震动而闻名。这些车都各有...
村素丁疏: (1)cDNA文库是指细胞全部mRNA通过逆转录得到cDNA后被克隆的总和.cDNA的组成特点是片段中不含基因的内含子和其他调控序列.cDNA文库构建基本步骤:①制备mRNA:全RNA提取与mRNA的分离提纯;②合成cDNA:oligo dT与mRNA3...
和布克赛尔蒙古自治县15556748916: 微生物基因建库怎么做 - ?
村素丁疏: cDNA 文库的构建 1.1 cDNA 文库构建的基本原理与方法 cDNA 文库是指某生物某发育时期所转录的全部 mRNA 经反转录形成的 cDNA 片段与某种载体连接而形成的克隆的集合.经典 cDNA...
和布克赛尔蒙古自治县15556748916: 为什么要构建基因文库?直接从含有目的基因的生物体内提取不行吗? - ?
村素丁疏: 构建基因文库是获取目的基因的方法之一,并不是惟一的方式.如果所需要的目的基因序列已知,就可以通过PCR方式从含有该基因的生物的DNA中,直接获得,也可以通过反转录,用PCR方式从mRNA中获得,不一定要构建基因文库.但如果所需要的目的基因的序列完全不知,或只知道目的基因序列的一段,或想从一种生物体内获得许多基因,或者想知道这种生物与另一种生物之间有多少基因不同,或者想知道一种生物在个体发育的不同阶段表达的基因有什么不同,或者想得到一种生物的全基因组序列,往往就需要构建基因文库.关于相关问题你可以使用下101教育ppt里面有相关的课件可以让你更加了解.
和布克赛尔蒙古自治县15556748916: 基因文库是怎么回事? - ?
村素丁疏: 基因文库简单说就是将细胞中的所有DNA用酶切成小片段,并将每一段利用载体转入宿主细胞中,这样经过培养后,每一个菌株都含有一小段DNA,再利用特殊方法将要检查的目的基因挑选出来菌株,提取DNA后进行测序, 之所以用基因文库是因为,直接测基因组DNA,太大了,测不准,而利用载体进入宿主细胞之后,DNA片段可以随宿主细胞一起复制,可以得到很多相同的拷贝,方便检查
和布克赛尔蒙古自治县15556748916: 基因的概念和表达 - ?
村素丁疏: 胰岛素是由胰岛B细胞分泌的物质其中探针DNA与胰岛B细胞控制合成胰岛素的DNA相同,胰岛B细胞的mRNA是由控制合成胰岛素的DNA转录而来的,因此,根据碱基配对原则,可以形成杂交分子该人肝细胞的DNA及该人胰岛A细胞的DNA包含能够合成胰岛素的DNA 只不过杆端基因不表达,一样可形成杂交分子该人胰岛A细胞的mRNA是由控制合成胰高血糖素的DNA转录来的,不能互补配对
和布克赛尔蒙古自治县15556748916: 关于基因测序的几个问题! - ?
村素丁疏: 根据一些文献的支持,先片段化,效果较好.因为这样的随机性比先合成要好. 2.加入index只是为了区分每个上机样品,便于分析.对结果没有什么目的和影响 3.如果技术试验流程没有问题的话,有的时候是因为物种本身的特殊性,诸如,杂合度过高,重复序列过高.