primer5.0设计引物-如何用PRIMER5.0设计引物
点文件,选新建DNA序列(File——New——DNASeqence)然后把要设计引物的序列复制进去就行了(如果你要是愿意也可以一个一个碱基的打进去),然后点Primer进入到引物设计界面,进去后选点Search设置相应相应的条件,如:你要设计PCR扩增还是测序引物,是正向、反向还是双向,在片段中的那个位置设计及引物的长度等等,设置好后一路OK点下去就行了,然后就会有引物出来供你选择了。
哈哈不过具体的步骤1L那个网址好像已经给出了,不过在设计引物时LZ还要注意些条件,如TM值和GC一类的,还有引物长度等等^_^
反正我一般设计引物的时候TM和GC都控制在50-60之间,长度一般18或19个碱基(555合成的时候按碱基收费呀555),错配和发卡都没有,不过引物二聚体有的话问题倒是不大(反正我设计出来有二聚体的引物基本都OK)然后就是最好不要有4个或以上连续的碱基,再有就是不要在重复序列里设计引物。
只要注意以上这些的话设计出的引物那里测序或扩增都OK
呵呵希望对LZ有所帮助
如何用PRIMER5.0设计引物进入软件,genetank窗口file---new----DNAsequence进入序列输入版块。然后control+v输入序列,如不改变序列,选择AS菜单。
然后进入primer引物设计。进入search,点OK。系统自动生成引物。
选你需要的就可以了。(有评分)。如要克隆基因,则在primer菜单下手动设计。
PrimerPremier5.0引物设计一、PCR引物设计原则
二、PrimerPremier5.0软件设计引物
三、引物设计步骤
①输入序列:安装好软件后,首先打开软件,左上角来操作,file-new-dnasequence,这一项可以把复制的序列粘贴进去,也可以选择另一个file-open-dnasequence去open一个新的文件。②点击Primer进入引物设计界面。③点击引物设计界面上的search按钮进行搜索选项设定。④点击搜索选项界面上的OK按钮可得到引物设计结果。⑤选择分值高的引物对作为实验合成引物选项。⑥根据需要对引物进行编辑。
明顷泌淋： 打开primer premier 5.0——File——New—— DNA Sequence——COPY 特异序列到GeneTank——Primer——Search——PCR Primers,Pairs—— 设定Sense primer和Antisense primer的范围及PCR产物大小范围——设定引物长度(primer length)——Automatic——OK——Search complete后点OK——在Search Results里选择引物对.——改变参数,再次搜索——找到最适的引物
阳信县17098128230： 如何用PRIMER5.0设计引物 - ？
明顷泌淋： 进入软件,genetank窗口file---new----DNA sequence进入序列输入版块.然后control+v输入序列,如不改变序列,选择AS菜单.然后进入primer引物设计.进入search,点OK.系统自动生成引物. 选你需要的就可以了.(有评分).如要克隆基因,则在primer菜单下手动设计.
阳信县17098128230： 如何如何使用primer primer设计引物 - ？
明顷泌淋： 首先得下载安装一个primer5 的软件,网上百度搜索后即可下载获得 点击File下拉菜单,选择New,然后选择DNA Sequence 从word文件中copy目标序列,然后control+V到primer5的文本框中,选择As is,点击OK.设计引物前得进行酶切位点分...
阳信县17098128230： primer primer5怎么设计引物 - ？
明顷泌淋： 首先打开软件 左上角来操作 file——new——dna sequence 这一项可以把你复制的序列粘贴进去 当然,你也可以选择另一个 file——open——dna sequence 去open一个新的文件.在接下来的界面里 复制你的序列,于是就将序列导入...
阳信县17098128230： 准备做pcr,怎么用primer5设计引物 - ？
明顷泌淋： 如果你要扩展的基因已经测序完成,你在网上找到序列,输入primer5,然后点primer就可以了,然后你可以手动或自动更改,知道达到的你的要求.如果你扩增的基因还未测序完成,你只能通过别人克隆出来的相关基因设计引物,方法同上
阳信县17098128230： 怎样用Primer5设计荧光定量PCR引物,怎样设置各种参数,求大神指点 - ？
明顷泌淋： 选取 目标片段长度在80-250bp的引物,在回头BLAST,特异性良好的话就可以了,一般我会多设计几个,选取最好的那个~
阳信县17098128230： 请问primer premier5.0设计引物怎么添加序列啊?邮箱:lily19841202@sina.com!谢谢 - ？
明顷泌淋： 不好添 如果不是添加在起始点或末端 那可以用Edit primer 然后在你看到的引物序列前后添加碱基,然后点analyze,接着点右边第二个prime会自动搜寻配对的位置然后在评价你的引物 如果是加在两端可以换用DNAMAN,先设计好不加位点的引物,然后添加上碱基后再在DNAMAN 里载入修改后的引物分析其自身互补 同模版互补 及上下游引物之间互补情况
阳信县17098128230： primer premier设计引物如何保存 - ？
明顷泌淋： 设计好后,点左上角的“edit”,再点“copy”,然后选择正向引物或反向引物,点击后就已经复制到剪切板里了.然后打开word、txt或者exel文件,直接ctrl+V粘贴即可.————————————————————————save to database是存入了PP5自己的数据库中.就像这样:然后你在下面选中你的引物,点export,就存进了数据库中,然后你可以编辑名字之类的. 不懂的话继续问.
阳信县17098128230： 已知人胰岛素基因序列怎么用primer5.0设计引物？
明顷泌淋： 直接将该基因序列粘到primer5的序列框里,将与扩增序列用方括号括起来,然后设置参数 ,基本上采用默认的就行了,运行.
阳信县17098128230： primer5怎么设计引物 - ？
明顷泌淋：[答案] 在多种条件限制下,完全没有二聚体有时是很难做到的,只要引物3'端没较长的互补碱基就行.在进行PCR的时候通过优化条件一样可以取得满意的结果.
