如何查询已知蛋白的分子量
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UniProt是一个集中收录蛋白质资源并能与其它资源相互联系的数据库,也是目前为止收录蛋白质序列目录最广泛、功能注释最全面的一个数据库。 UniProt是由欧洲生物信息学研究所(European Bioinformatics Institute)、美国蛋白质信息资源(Prontein Information Resource)以及瑞士生物信息研究所(Swiss Institute of Bioinformatics)等机构共同组成的UniProt协会(UniProt Consortium)编辑、制作的一个信息资源,旨在为从事现代生物研究的科研人员提供一个有关蛋白质序列及其相关功能方面的广泛的、高质量的并可免费使用的共享数据库。
UniProt是一个向所有使用者免费开放的数据库,全球科研人员都可以登陆网站www.uniprot.org浏览并下载这些资料。借助它,科研人员可以对目的蛋白进行交互式分析或特定的分析。
大分子物质由于直径较大,不易进入凝胶颗粒的微孔,而只能分布颗粒之间,所以在洗脱时向下移动的速度较快。
小分子物质除了可在凝胶颗粒间隙中扩散外,还可以进入凝胶颗粒的微孔中,即进入凝胶相内,在向下移动的过程中,从一个凝胶内扩散到颗粒间隙后再进入另一凝胶颗粒,如此不断地进入和扩散,小分子物质的下移速度落后于大分子物质,从而使样品中分子大的先流出色谱柱,中等分子的后流出,分子最小的最后流出。
已知某蛋白质的相对分子质量是13310,计算此蛋白质由多少个氨基酸残基构 ...
生物体合成所需的20种氨基酸,平均相对分子量是128,但构成蛋白质时,形成肽键,减去n-1个水,这样可以认为氨基酸残基平均分子量为110,所以在计算蛋白质有多少氨基酸残基时,直接分子量除于110就可以了。所以此题计算为:13310\/110=121.
蛋白序列、结构数据库常用的有哪些?
有的情况下,某个蛋白质与已知功能蛋白质的整体序列相似性很低,但由于功能的需要保留了与功能密切相关的序列模式,这样就可能通过PROSITE的搜索找到隐含的功能motif,因此是序列分析的有效工具。PROSITE中涉及的序列模式包括酶的催化位点、配体结合位点、与金属离子结合的残基、二硫键的半胱氨酸、与小分子或...
蛋白质相对分子质量的计算公式?
蛋白质中的肽键数=脱去的水分子数=氨基酸个数-肽链数 2.蛋白质的相对分子质量=氨基酸分子个数×氨基酸平均相对分子质量-18x(脱去的水分子数)3.若已知多肽中氮原子数为m,氨基个数为n,则缩合为该多肽的氨基酸数目为 m-n+肽链数。4.若已知多肽中的氮原子数为m,则缩合成该多肽的氨基酸数目最多...
如何知道一个蛋白的表达部位?
蛋白质分子中关键活性部位氨基酸残基的改变,会影响其生理功能,甚至造成分子病(molecular disease)。例如镰状细胞贫血,就是由于血红蛋白分子中两个β亚基第6位正常的谷氨酸变异成了缬氨酸,从酸性氨基酸换成了中性支链氨基酸,降低了血红蛋白在红细胞中的溶解度,使它在红细胞中随血流至氧分压低的外周毛细...
概述SDS-PAGE法测蛋白质相对分子质量的原理。
(3)蛋白质分子在SDS-PAGE凝胶中的移动距离与指示剂移动距离的比值称相对迁移率,相对迁移率与蛋白质相对分子质量的对数呈线性关系。因此,将含有几种已知相对分子质量的标准蛋白质混合溶液以及待测蛋白溶液分别点在不同的点样孔中,进行SDS-PAGE;然后以标准蛋白质相对分子质量的对数为纵坐标,以相对应的...
某蛋白质分子中有3个丙氨酸分子,水解1g改蛋白质后,测的含丙氨酸14.0mg...
设该蛋白质的分子量为X,已知丙氨酸的平均相对分子质量等于90,该蛋白质的质量是一克也就是1000毫克丙氨酸的质量为14毫克,根据这些数据可以列出方程 X=90×1000÷14。解得X为6430。所以该蛋白质的分子量大约为6430。
利用lambert-beer定律进行蛋白质定量分析,有几种测定方法?
利用lambert-beer定律进行蛋白质定量分析,有4种测定方法。详细论述如下:1、吸光度法(Absorbance Method):这是一种最常用的蛋白质定量方法,通过测量溶液在特定波长下的吸光度来计算蛋白质浓度。吸光度与溶液中的蛋白质浓度成正比,因此可以通过已知的蛋白质吸光系数和稀释倍数来计算蛋白质浓度。2、荧光...
怎么根据SDS-PAGE图估算蛋白浓度 求指导
一、估算步骤:1、标准曲线的制作:(1)运行一个含有已知浓度蛋白标准的凝胶,以创建一个蛋白浓度与凝胶上条带颜色深浅(灰度值)之间的关系曲线。(2)通常使用由一系列不同浓度的蛋白标准制备的SDS-PAGE来创建这一标准曲线。2、样品条带的灰度分析:(1)使用适当的软件(例如ImageJ)来分析样品在...
...我这里有期末考试题,熟悉PDB数据库、蛋白质序列、mRNA
1. 从PDB数据库中找一个3D结构已知的蛋白,查询取得其蛋白质序列、mRNA序列(仅包含ORF\/CDS)和基因组序列(10分);2. 用Homologene或BlastP从蛋白质数据库中找15种以上与其高度同源的蛋白质序列,将序列下载并保存为一个FASTA格式的文件(10分);3. 找到每个蛋白相应的mRNA序列,截取从起始...
用分光光度计测蛋白质浓度 求值
利用分光光度计测定蛋白浓度需要先进行蛋白浓度标准曲线绘制。就是测量一系列已知浓度蛋白的吸光值,然后以蛋白浓度为横坐标,吸光值为纵坐标绘制一条直线,然后将你所测样品的吸光值比对该直线所得横坐标即为样品的蛋白质浓度
枕叙止血: 知道蛋白质分子量、氨基酸组成计算器 http://www.proteomics.com.cn/tools/mwcal/ 一般的方法: sds-聚丙烯酰胺凝胶电泳法测定蛋白质的分子量 [原理] 十二烷基硫酸钠(sodium dodecyl sulfate, 简称sds)-聚丙烯酰胺凝胶电泳法测定蛋白质的分...
迁安市15836695720: 蛋白质由330个氨基酸组成,请问其分子量大小是多啊?这个蛋白质的相关分子量的内容从哪里能查到?这个蛋白质的氨基的序列从哪里可找到,怎样查询 - ?
枕叙止血:[答案] 大蛋白的分子量和氨基酸数目的关系一般是氨基酸数*110=道尔顿数 330个氨基酸大概36KDa左右 蛋白质的一级结构等信息可以在Uniprot、swissprot等数据库里查,不过都是英文的,没有中文的数据库
迁安市15836695720: 测量蛋白质分子质量有哪些主要方法 - ?
枕叙止血: 1.根据化学组成测定最低分子量用化学分析方法测出蛋白质中某一微量元素的含量,并假设分子中只有一个这种元素的原子,就可以计算出蛋白质的最低分子量.2. 渗透压法当蛋白质浓度不大时,可用以下公式: M=RT/lim(∏/C) 其中R是气体常数(0.082),T是绝对温度,∏是渗透压(以大气压计),浓度单位是g/L.3. 沉降速度法: M=RTs÷D(1-Vρ) 其中s是沉降系数,D是扩散系数, ρ是溶剂的密度, V是蛋白质的偏微分比容.4. SDS-PAGE法: lgM=K1-K2μR 其中K1和K2是与试验条件有关的常数.用已知分子量的标准蛋白作标准曲线,即可求出未知蛋白的分子量.
迁安市15836695720: 怎么算蛋白质的相对分子质量 - ?
枕叙止血: 用氨基酸的平均质量分数乘氨基酸个数,再减去氨基酸个数乘十八,就行了
迁安市15836695720: 大分子如蛋白质的分子量如何测定及其原理 - ?
枕叙止血: 一般的方法:SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳法测定蛋白质的分子量 原理:十二烷基硫酸钠(Sodium dodecyl sulfate, 简称SDS)-聚丙烯酰胺凝胶电泳法测定蛋白质的分子量http://zhidao.baidu.com/question/39155032.html?si=1
迁安市15836695720: 蛋白质分子量的计算.?
枕叙止血: 蛋白质分子量的计算方法:氨基酸的平均分子量X氨基酸总的分子数(肽链数+肽键数)-18X脱水缩合的水分子数(和肽键数相等) 所以,你的答案是:128X(2+98)-18X98=11036
迁安市15836695720: 如何测胶原蛋白的分子量 - ?
枕叙止血: 分子筛-高效液相色谱联用 这两个是实验室主要应用的方法,如果是在家简易测定,可以试试花百把块几十毫升分子筛,用个注射器装柱,然后去弄点天然存在的较便宜的纯蛋白(比如说鸡蛋清的盐析产物是较纯的鸡卵清蛋白、盐析法提取的羊IgG、等电点沉淀法制备牛奶中的酪蛋白和人IgM),染色考马斯亮蓝G250后透析去除染料作为分子量标准,和目的蛋白同时过柱,用分子量和流出时间做标准曲线,可以估算出你待测蛋白的相对分子量.暂时就记得那么多了
迁安市15836695720: 蛋白质的相对分子质量怎么算?(具体点,最好能举个例题) - ?
枕叙止血: 用氨基酸的平均质量分数乘氨基酸个数,再减去氨基酸个数乘十八,就行了 列:若组成蛋白质的氨基酸的平均相对分子质量是130,那么一个由4条肽链共280个氨基酸所组成的蛋白质,相对分子质量是多少 氨基酸数为280 肽链数为4 说明脱去的水分子数为280-4 所以现在的相对分子质量应是280*130-(280-4)*18
迁安市15836695720: 如何根据蛋白质的相对分子质量查到蛋白质 - ?
枕叙止血:[答案] 蛋白质的基本单位是氨基酸 氨基酸必有肽键 除去肽键的相对分子质量 再凑 CH3 CH2的相对分子质量 氨基酸就知道了
迁安市15836695720: 您能帮我查查laminin,Fibrillarin这两个蛋白的分子量 - ?
枕叙止血: 第一个是层粘连蛋相对分子质量为820kDa, 第二个是核仁纤维蛋白,这个分子量约为340kDa,