生物学分支学科特点? 互联网上生物学信息资源类型和特点?生物学信息数据库特点?

作者&投稿:淫兴 (若有异议请与网页底部的电邮联系)
筒述网络生物学信息资源的特点?~

。随着分子生物学研究的进展 ,当前生物
信息学主要是研究和分析基因和蛋白质的遗传结构和功能 ( ) : 1生物数据库的设计 、 生物信息学研究的主要任务是 的生物信息 ,以解释和认识生命的起源 、进化 、发育 、遗传的
() ( ) 本质 ,破译隐藏在 DNA 序列中的遗传语言及其意义 ,这亦称 建立和优化 ; 2从数据库中提取有效信息的算法 ; 3为用 ( ) 户设计查询信 息 的 界 面 ; 4 开 发 数 据 可 视 化 的 有 效 方 法 ; 为经典的或狭义的生物信息 。此外 ,它亦研究和分析人体所
() ( ) 5与多种资源和信息建立有效连接 ; 6开发数据分析的新 有细胞 、组织 、器官的生理 、病理 、药理过程的各种生物信息 , () 方法 ; 7发展预测的算法 ,对新产品 、新功能 、疾病诊断和治 为人类疾病的预测 、诊断 、预防和治疗提供最合理和有效的
疗等进行预测 。 途径 。这亦称为广义的生物信息学或医学生物信息学 。经
任务包括各种生物数据库 、网站 、软件 、工具和远程网络 典生物学是医学生物信息学的基础和核心 ,医学生物信息学
等等 。其中数据库是最基本的 。目前 ,国际上公共数据库有 是经典生物信息的发展和应用 ,两者是密不可分的 ,都是以
近百种 ,其中 最 著 名 的 核 酸 和 蛋 白 质 序 列 数 据 库 有 几 十 种 计算机为工具 ,对生物信息进行储存 、检索 、分析的科学 。

想要学生更好懂得特点只是,首先应该是做为教师本人对生物抱有高度的兴趣,其次你才能让学生充满兴趣,有了兴趣之后配合生物本身的魅力,学生爱学了当然也就容易理解了

1.生物学是系统性很强的学科
2.生物学具有丰富的哲学内涵
3.从进化论的角度看问题
4.生物学是与实践紧密联系的
5.生物是理科,应当注意理解性记忆
6.生物与化学是有联系的
7.生物重在理解

其实生物最大的特点是让好多人都爱上生物了.

一、名词解释:
1、生物信息学:生物分子信息的获取、存贮、分析和利用;以数学为基础,应用

计算机技术,研究生物学数据的科学。
2、相似性(similarity):两个序列(核酸、蛋白质)间的相关性。
3、同源性(homology):生物进化过程中源于同一祖先的分支之间的关系。
4、同一性(identity):两个序列(核酸、蛋白质)间未发生变异序列的关系。
5、序列比对(alignment):为确定两个或多个序列之间的相似性以至于同源性

,而将它们按照一定的规律排列。
6、生物数据库检索(database query,数据库查询):对序列、结构以及各种二

次数据库中的注释信息进行关键词匹配查找。
7、生物数据库搜索(database search):通过特定序列相似性比对算法,找出核

酸或蛋白质序列数据库中与待检序列具有一定程度相似性的序列。
二、简答题:
1、分子生物学的三大核心数据库是什么?它们各有何特点?
GenBank核酸序列数据库;SWISS-PROT蛋白质序列数据库;PDB生物大分子结构数

据库;
2、简述生物信息学的发生和发展。
20世纪50年代,生物信息学开始孕育;
20世纪60年代,生物分子信息在概念上将计算生物学和计算机科学联系起来;
20世纪70年代,生物信息学的真正开端;
20世纪70年代到80年代初期,出现了一系列著名的序列比较方法和生物信息分析

方法;
20世纪80年代以后,出现一批生物信息服务机构和生物信息数据库;
20世纪90年代后,HGP促进生物信息学的迅速发展。
3、生物信息学的主要方法和技术是什么?
数学统计方法 ;动态规划方法 ;机器学习与模式识别技术;数据库技术及数据

挖掘 ;人工神经网络技术;专家系统;分子模型化技术;量子力学和分子力学

计算;生物分子的计算机模拟;因特网(Internet)技术
4、常见的DNA测序方法有哪些?各有何技术特点和优缺点?
Maxam-Gilbert DNA化学降解法:优点:可测完全未知序列及CG富含区;缺点:操

作繁琐;
Sanger双脱氧链终止法:优点:简便,可测较长片段;缺点:需已知部分序列或

加接头;
焦磷酸测序:优点:廉价、高通量;缺点:一次测序片段短。
5、分子生物学数据库有哪些类型?各有何特点?

基因组数据库:基因组测序
核酸序列数据库:核酸序列测定
一次数据库:蛋白质序列数据库:蛋白质序列测定。生物大分子(蛋白质)三维结

构数据库:X-衍射和核磁共振
特点:数量少,容量大,更新快
二次数据库:上述四类数据库和文献资料为基础构建
特点:数量多,容量小,更新慢
6、简述NCBI Entrez系统的功能。
高级检索系统;查找核酸、蛋白、文献、结构、基因组序列、大分子三维结构、

突变数据、探针序列、单核苷酸多态性等数据。
7、简述NCBI BLAST的功能和种类。
序列相似性比对工具;
对核酸:普通blastn,对高度相似序列megablast;
对蛋白质:普通blastp,对保守域rpsblast;
对人工翻译序列:核酸翻译序列对蛋白质序列blastx,蛋白质对翻译序列tblastn

,核酸翻译序列对翻译序列tblastx;
其它:基因组blast,基因表达序列搜索GEO blast,序列两两比对……
8、举例说明生物信息学软件的应用。
9、生物芯片制作和分析过程中可以应用哪些生物信息学软件。
三、论述题:
1、什么是生物信息学?生物信息学有哪些主要应用领域?
生物分子信息的获取、存贮、分析和利用;以数学为基础,应用计算机技术,研

究生物学数据的科学。
生物分子数据的收集与管理;数据库搜索及序列比较;基因组序列分析;基因表

达数据的分析与处理;蛋白质结构预测。
2、生物信息学在医药领域有什么应用?
辅助诊断(遗传病,HLA分型);
研究药物作用机制,辅助新药物开发和制造。
3、人类基因组计划中主要使用的那些生物信息学手段?它们对人类基因组计划发

挥了哪些重大作用?
单一测序结果判读;contig和chromosome拼接;识别基因区及其调控区;寻找基

因相互作用的时空关系;
4、试述蛋白质二级结构预测的主要策略和方法。
策略:
目标:判断每一段中心的残基是否处于a螺旋、b折叠、b转角(或其它状态)之一

的二级结构态,即三态。
a、理论分析法(从头计算法):通过理论计算(分子力学、分子动力学等)进行

结构预测。优点:不需要经验数据,由一级结构推测高级结构
缺点:天然和未折叠蛋白间能级差很小 (kcal/mol);蛋白质可能的构想空间庞大

,针对蛋白质折叠的计算量巨大;计算模型中力场参数不准确。
b、统计方法:对已知结构的蛋白质进行统计分析,建立序列到结构的映射模型,

进而根据映射模型对未知结构的蛋白质直接从氨基酸预测结构。
经验性方法:根据一定序列形成一定结构的倾向进行结构预测。通过对已知结构

的蛋白质进行统计分析,发现各种氨基酸形成不同二级结构的倾向,从而形成一

系列关于二级结构预测的规律。
结构规律提取方法:从蛋白质结构数据库中提取关于蛋白质结构形成的一般性

规律,指导建立未知结构的蛋白质模型。
同源模型化方法:通过同源序列分析或模式匹配,预测蛋白质的空间结构或结

构单元。
方法:
1、Chou-Fasman方法;(基于单个氨基酸残基统计的经验参数方法,由Chou 和

Fasman在20世纪70年代提出来。通过统计分析,获得每个残基出现于特定二级结

构构象的倾向性因子,进而利用这些倾向性因子预测蛋白质的二级结构。)2、

GOR方法;(是一种基于信息论和贝叶斯统计学的方法GOR将蛋白质序列当作一连

串的信息值来处理;GOR方法不仅考虑被预测位置本身氨基酸残基种类的影响,而

且考虑相邻残基种类对该位置构象的影响)3、基于氨基酸疏水性的方法;4、最

邻近方法;5、人工神经网络方法;6、综合方法:7、利用进化信息预测蛋白质的

生物学概述

植物学、孢粉学

动物学、分子生物学、生物分类学、习性学

微生物学、细菌学、微生物生理学、微生物遗传学、土壤微生物学

细胞学、细胞生物学、细胞化学、细胞遗传学

生理学、免疫学、胚胎学、优生学、悉生生物学

遗传学、分子遗传学、生态学、仿生学

生物物理学、生物力学、生物力能学、生物声学、生物化学、生物数学

特点,布局完善,促进科学协调发展。


生物方面的专业有哪些
2、生物技术:生物技术,是指人们以现代生命科学为基础,结合其他基础科学的科学原理,采用先进的科学技术手段,按照预先的设计改造生物体或加工生物原料,为人类生产出所需产品或达到某种目的。生物技术是一门新兴的,综合性的学科。3、生命科学:是通过分子遗传学为主的研究生命活动规律、生命的本质、生命...

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许谦八正: 生物学主要分支 动物学领域 动物学-动物生理学-解剖学-胚胎学-神经生物学-发育生物学-昆虫学-行为学-组织学 植物学领域 植物学-植物病理学-藻类学-植物生理学 微生物学/免疫学领域 微生物学-免疫学-病毒学 生物化学领域 生物化学-蛋白质力学-...

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许谦八正:[答案] 180.11 生物数学 包括生物统计学等 180.14 生物物理学 180.1410 生物信息论与生物控制论 180.1415 生物力学 包括生物... 180.2457 比较生理学 180.2461 年龄生理学 180.2464 特殊环境生理学 180.2467 语言生理学 180.2499 生理学其他学科...

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