蝗科的相关书籍

作者&投稿:牟英 (若有异议请与网页底部的电邮联系)
蝗科的分类~

界:动物界 Animalia门:节肢动物门 Arthropoda纲:昆虫纲 Insecta目:直翅目 Orthoptera若虫(蝗蝻)亚目:锥尾亚目 Caelifera总科:蝗总科 Acridoidea科:蝗科 Acrididae 中华蚱蜢学名:Acrida chinensis (Westwood)寄主:杂草、柑桔、泡桐、桃、木槿、草花、刚竹、蜀葵、禾本科、十字花科、旋花科、草坪、杨分布:江苏、安徽、湖南、山东、福建、河南东亚蚱蜢学名:Acrida cinerea Thunberg寄主:苗圃幼苗、美人蕉、对叶菊、钱线草、木芙蓉、茶树、禾本科、旋花科分布:山东、贵州、四川黄脊竹蝗学名:Ceracrs kiangsu Tsai寄主:竹、蔓生秃竹、棕榈、甘蔗、禾本科、豆科、蒲葵、散尾葵、椰子、槟榔、青皮竹、佛肚竹、青条木青脊竹蝗学名:Ceracris nigricornis Walker寄主:竹尖、竹、刚竹白边长腹蝗学名:Lschnacrida vittata Fab卵寄主:禾本科地被植物疣蝗学名:Trilophidia annulata (Thunoerg)寄主:杂草、柑桔、茶、水蔗草、白菜、狗牙根、象草、草坪素木乌背蝗学名:Shirakiacris shirakii (I. Bolivar)寄主:甘蔗、小竹、白茅东亚飞蝗学名:Locusta migratoria manilensis (Meyen)寄主:十字花科、禾本科、莎草科、杂草、芦苇、麦冬云斑车蝗学名:Gastrimargus marmoratus Thunberg寄主:禾草、结缕草、多种地被、人面子、马尾松、木麻黄、台湾相思、椰子、槟榔、散尾葵、青木桑、蒲葵、粉丹竹、佛肚竹 花胫绿纹蝗学名:Aiolopus tamulus (Fabricius)寄主:柑桔、茶、甘蔗、禾本科、桑、柿、结缕草、铁线草、香附草、水蔗草、白茅疣蝗学名:Trilophidia annulata (Thunoerg)寄主:桑、雀稗、狗牙根、水蔗草、纯叶草、象草、风车草、首乌东亚飞蝗学名:Locusta migratoria manilensis (Meyen)寄主:十字花科、禾本科、莎草科、杂草、芦苇、麦冬云斑车蝗学名:Gastrimargus marmoratus Thunberg寄主:禾草、结缕草、多种地被、人面子、马尾松、木麻黄卵 笨蝗学名:Haplotropis brunneriana Saussure寄主:草坪、苜蓿、树苗、禾本科花草 小斑腿褐蝗红褐斑腿蝗线斑腿蝗若虫(蝗蝻)棉蝗长尾蔗蝗异岐蔗蝗稻蝗长翅稻蝗小稻蝗柑黄脊土蝗 短角异腿蝗学名:Xenocatantops brachycerus (Willemse)寄主:茶、葛藤、红背桐、三叶五加 长翅肩蝗高目棱蝗日本菱蝗

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中国斑翅蝗科部分种类线粒体12S rRNA基因的分子进化与系统学研究
叶维萍
摘要:斑翅蝗科(Oedipodidae)隶属于直翅目蝗亚目蝗总科(Orthoptera:Caelifera:Acrididae)。由于蝗虫对农牧业的影响,对蝗虫系统学以及蝗虫防治的研究一直受到广泛重视。分子生物学技术促进了昆虫分子系统学的兴起和发展,但目前国内外对斑翅蝗科昆虫的分子系统学研究远远落后于其它生物类群。本研究以12S rRNA基因为分子标记,探讨其分子进化机制并建立该科分子水平系统发育关系,为确定它们之间的关系提供分子生物学方面的证据。12S rRNA基因由于其分布的普遍性、序列和结构的保守性以及进化速率镶嵌性而被广泛应用于不同分类阶元层次上的分子系统学研究。本研究采用PCR产物直接测序法测定了斑翅蝗科4个亚科10属19种昆虫12SrRNA基因546bp的片段,以从NCBI下载的一种蟋蟀Gryllus campestris的相应序列为外群序列,利用Clustal X进行序列比对,结合12S rRNA二级结构模型进行茎区(stem)和环区(loop)碱基的划分。MEGA 2.1进行序列组成统计。PAUP~*4.0b10(PPC)对数据集系统发育信号进行评估,并以NJ、MP,ML和贝叶斯系统发育推论法分别重建系统发生树。最后得到的结论如下:1.本研究得到19种斑翅蝗科昆虫长为546bp的12S rRNA基因片段,其序列组成分析显示典型的高AT含量(75.4%)和多变的距离依赖的转换/颠换(TS/TV)比。2.12S rRNA基因546bp片段根据二级结构模型划分为茎区和环区,对全数据组、茎区数据组和环区数据组分别进行树长分布分析和PTP检验,两者均显示三个数据组包含较强的系统发育信号。对三个数据组分别重建的简约树显示,全数据组系统树分辨率最高,解决的分支最多,而茎区和环区数据组分别解决了部分分支的系统关系,说明茎区碱基和环区碱基各自包含不同的系统发育信息,在12S rRNA基因的系统发育应用中选用全序列比较合适。对茎区和环区碱基赋以不同权值得到的MP树与未加权结果相同,说明在该区段,茎区碱基的补偿性突变对本研究影响不大。3.本研究采用MP,NJ,ML和BI法分别重建了斑翅蝗科19种昆虫的系统发生关系,并采用基于似然值的KH和SH检验比较了这四棵系统树,结果认为MP树的似然值(-Ln L)最小,但它们的似然值差异没有达到 统计学显著性,所以认为这四种拓扑结构的系统树都很好的解释了该数据 集。四种方法没有达到一致的结果,说明该数据集在解决这19个种的系 统发生关系上提供的信息还是不够的。4.四种方法合一树的结果中,包含清晰的两分支,即痴蝗支和飞蝗支。痴蝗支包括异痴蝗属、痴蝗属和皱膝蝗属,因为轮纹异痴蝗和两种皱膝蝗 聚为一支,黄胫异痴蝗和两种痴蝗聚为一支,故本文认为异痴蝗亚科和痴 蝗亚科应该合并为一个亚科。飞蝗支包含飞蝗属、小车蝗属、车蝗属、疵 蝗属和绿纹蝗属5个属,建议合并为飞蝗亚科。这些类群的关系可以表示 为:(((白边痴蝗,青海痴蝗)黄胫异痴蝗)((红翅皱膝蝗,鼓翅皱膝蝗) 轮纹异痴蝗))(((亚洲飞蝗,东亚飞蝗,西藏飞蝗)(((黄胫小车蝗,红 胫小车蝗)亚洲小车蝗)云斑车蝗)庆蝗)花胫绿纹蝗)。其它束颈蝗和 蓝斑翅蝗的归属本研究没有得到一个定论。5.125 rRNA基因部分片段没有完全解决斑翅蝗科19种的系统关系问 题,关键问题在于所测序列长度太短,提供的系统发育信息不足以给出这 19种昆虫全面正确的系统关系,测定基因全长或增加其它基因序列可能有 助于该问题的解决。本研究对斑翅蝗科19种125 rRNA基因序列的测定是科学上首次对中 国斑翅蝗科昆虫进行的较大规模的线粒体基因序列分析,通过向GenBank 提交所测蝗虫基因序列,与世界昆虫学界共享序列数据。通过后续分析, 探讨斑翅蝗科内的系统发育关系,提供了分子数据方面的观点。
关键词:斑翅蝗科 线粒体 12S rRNA 分子进化 分子系统学
学位授予单位:陕西师范大学
学位级别:硕士
学位授予年份:2004
分类号:Q969
目录:
中文摘要2-4
英文摘要4-9
第一部分 前言9-38
1 斑翅蝗科简介及其系统学研究现状9-12
1.1 斑翅蝗科昆虫简介和系统地位9
1.2 斑翅蝗科系统学研究现状9-10
1.3 直翅目斑翅蝗科的化石资料10-12
2 动物线粒体基因组和12S rRNA基因12-22
2.1 动物线粒体基因组特征和基因序列特征12-13
2.2 动物12S rRNA基因结构和分子特征13-15
2.3 rRNA基因在动物系统学应用中的优势和注意事项15-17
2.4 动物12S rRNA二级结构模型17-19
2.5 rRNA基因的加权19-20
2.6 动物12S rRNA基因分子进化和系统学应用概况20-22
3 分子系统学研究方法22-37
3.1 形态方法和分子方法的比较22-23
3.2 分子系统学序列数据的取样问题23-25
3.2.1 分类单元的选择(taxon sampling)23-25
3.2.2 DNA序列的取样25
3.3 序列比对25-28
3.3.1 比对概念及一般比对原则25-26
3.3.2 不同比对程序的比较26-28
3.4 DNA序列加权28-29
3.5 外群(outgroup)的选择29-30
3.6 不同基因和不同建树方法在重建系统发育中的效率30-32
3.7 评估数据系统发育信号和进化树的可靠性与置信度的检验32-35
3.7.1 数据组总体系统发育信号检验33
3.7.2 进化树分支可靠性和置信度检验33-34
3.7.3 似然率检验(LRT)34-35
3.8 线粒体假基因(Numts)对分子进化和分子系统学研究的影响35-37
3.8.1 Numts的存在对分子和进化研究的干扰35-36 3.8.2 Numts带来的研究新方向36-37
4 本课题研究的目的和意义37-38
第二部分 实验材料与方法38-49
1 实验材料38-40
1.1 标本的采集、鉴定、保存、整理与选择38
1.2 仪器和试剂38-40
2 实验方法40-43
2.1 总DNA提取40-41
2.1.1 提取过程所用的试剂40-41
2.1.2 提取步骤41
2.1.3 基因组DNA的检测41
2.2 PCR扩增目的12S rRNA基因序列41-43
2.2.1 引物41-42
2.2.2 PCR扩增体系和扩增条件42-43
2.3 目的片段序列的测定43
《中国动物志》书籍
3 实验数据处理和分析43-49
3.1 序列编辑43
3.2 序列比对43-44
3.3 序列组成分析44
3.4 数据组信号检测44-45
3.5 建树45-49
3.5.1 简约法建树45-46
3.5.2 距离法建树46
3.5.3 极似然法建树46-47
3.5.4 贝叶斯系统发育推论法(Bayesian inference of phylogeny47-48
3.5.5 四种建树方法得到的系统树的比较和总结48-49
第三部分 结果分析49-76
1 基因组总DNA的提取、PCR扩增及序列的测定49-50
1.1 基因组总DNA提取49-50
1.2 引物的应用和PCR扩增结果50
1.3 PCR产物测序50
2 实验数据处理和分析50-66
2.1 序列编辑和序列比对结果50
2.2 数据集序列组成分析50-55
2.3 数据组系统发育信号检验55-59
2.3.1 碱基替换饱和性分析55-57
2.3.2 PAUP中数据组系统发育信号检验(g1和PTP检验)57-59
2.4 系统发育重建59-66
2.4.1 简约法建树59-62
2.4.2 距离法建树62-63
2.4.3 极大似然法建树63-64
2.4.4 贝叶斯系统发育推论结果64-65
2.4.5 四种建树方法得到的系统树的比较和总结65-66
3 分析和讨论66-76
3.1 目的序列的获得(12S rRNA基因的核假基因问题讨论)66-67
3.2 所研究类群12S rRNA基因部分片段的序列组成和分子进化67-69
3.2.1 19种斑翅蝗科昆虫的12S rRNA基因序列组成和分子进化特征67-69
3.2.2 12S rRNA基因茎区和环区碱基的序列组成和分子进化差异69
3.3 12S rRNA基因序列数据系统发育信号评估69-70
3.4 斑翅蝗科部分种类的系统发生关系70-76
3.4.1 简约法分析70-71
3.4.2 距离法建树71-72
3.4.3 极似然法和贝叶斯系统发育推论法建树讨论72-73
3.4.4 四种方法重建系统发育树的比较73
3.4.5 斑翅蝗科部分种类的系统发生关系的讨论73-75
3.4.6 12S rRNA基因在斑翅蝗科昆虫系统发育关系研究中的有效性75-76




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